Descripción del proyecto
PATOGENOS RESISTENTES A ANTIBIOTICOS, TALES COMO EL ENTEROCOCO-VANCOMICINA-RESISTENTE (VRE) SON UN PROBLEMA CRECIENTE EN PACIENTES HOSPITALIZADOS Y SUELEN CAUSAR INFECCIONES TRAS EL TRATAMIENTO ANTIBIOTICO, INFECCIONES POR VRE SUELEN COMENZAR EN EL INTESTINO, EN CONDICIONES NORMALES, NUESTRO INTESTINO ESTA COLONIZADO POR CIENTOS DE BACTERIAS COMENSALES, LA MICROBIOTA, QUE INHIBE LA COLONIZACION INTESTINAL POR VRE, LO QUE SE DENOMINA "RESISTENCIA A LA COLONIZACION" (CR), POR CONTRA, LA ADMINISTRACION DE ANTIBIOTICOS ALTERA LA COMPOSICION DE LA MICROBIOTA LO QUE PERMITE A VRE COLONIZAR EL INTESTINO Y POSTERIORMENTE DISEMINAR A SANGRE DONDE PUEDE PONER EN PELIGRO LA VIDA DEL PACIENTE, POR TANTO, ENTENDER COMO Y QUE MIEMBROS DE LA MICROBIOTA CONFIEREN CR Y COMO LOS ANTIBIOTICOS PROMUEVEN LA INFECCION ES CRUCIAL SI QUEREMOS PREVENIR LAS INFECCIONES POR VRE, SIN EMBARGO, LA AUSENCIA DE TECNICAS PARA ANALIZAR LA MICROBIOTA HA DIFICULTADO EL ESTUDIO DE ESTE CLINICAMENTE RELEVANTE CAMPO, AFORTUNADAMENTE, NUEVAS TECNICAS DE SECUENCIACION MASIVA PERMITEN AHORA EL ESTUDIO DETALLADO DE LA MICROBIOTA Y SUS GENES (MICROBIOMA), NUESTRO GRUPO HA SIDO PIONERO EN APLICAR ESTA NUEVA METODOLOGIA PARA IDENTIFICAR CAMBIOS EN LA MICROBIOTA QUE PROMUEVEN LA COLONIZACION POR VRE E IDENTIFICAR AQUELLAS ESPECIES BACTERIANAS QUE CONFIEREN CR, HEMOS DEMOSTRADO QUE LA ELIMINACION DE CIERTAS BACTERIAS DE LA MICROBIOTA, INCLUIDAS BARNESIELLA, RUMINOCOCCACEAE, LACHNOSPIRACEAE, ALISTIPES, ALLOBACULUM, INCREMENTA EL RIESGO DE INFECCION, MAS AUN, LA RECONSTITUCION DE RATONES TRATADOS CON ANTIBIOTICOS CON DICHAS BACTERIAS DISMINUYE CONSIDERABLEMENTE LA COLONIZACION POR VRE, HABIENDO IDENTIFICADO BACTERIAS CONCRETAS DE LA MICROBIOTA QUE PROMUEVEN CR, EN ESTE PROYECTO PROPONEMOS IDENTIFICAR LOS MECANISMOS POR LOS CUALES DICHAS BACTERIAS CONFIEREN PROTECCION, NUESTROS RESULTADOS PUBLICADOS INDICAN QUE LA MICROBIOTA CONFIERE CR EN AUSENCIA DE COMPONENTES ESENCIALES DEL SISTEMA INMUNE, POR ELLO, EN ESTE PROYECTO NOS CENTRAREMOS EN IDENTIFICAR MECANISMOS POR LOS CUALES LA MICROBIOTA DIRECTAMENTE CONFIERE RESISTENCIA (COMPETICION POR NUTRIENTES, PRODUCCION DE SUSTANCIAS INHIBITORIAS), PARA ALCANZAR ESTE OBJETIVO, PRIMERO DEFINIREMOS LOS NUTRIENTES UTILIZADOS POR EL PATOGENO Y LAS BACTERIAS PROTECTORAS (BPS) EN EL INTESTINO DE RATONES, PARA ELLO UTILIZAREMOS TECNICAS OMICAS (METAGENOMICA Y METATRANSCRIPTOMICA) PARA IDENTIFICAR LOS GENES EXPRESADOS PARA ADQUIRIR NUTRIENTES IN VIVO, Y TECNICAS METABOLOMICAS PARA IDENTIFICAR NUTRIENTES QUE HAYAN MERMADO IN VIVO TRAS LA COLONIZACION POR VRE O BPS, ADEMAS, IDENTIFICAREMOS IN VITRO MEDIANTE "ARRAYS" LOS NUTRIENTES QUE SON ESENCIALES PARA EL CRECIMIENTO DE VRE, Y MEDIANTE UNA TECNICA DE IDENTIFICACION DE MUTANTES POR TRANSPOSICION IN VIVO, IDENTIFICAREMOS GENES QUE NECESITA VRE PARA COLONIZAR EL INTESTINO Y ADQUIRIR NUTRIENTES, UNA VEZ DEFINIDAS LAS ESTRATEGIAS UTILIZADAS POR VRE Y BPS PARA EXPLOTAR NUTRIENTES, ENSAYOS DE COMPETICION IN VITRO E IN VIVO DEMOSTRARAN EL PAPEL DE LA COMPETICION POR NUTRIENTES EN CR FRENTE A VRE, POR OTRO LADO, LOS PERFILES OMICOS IN VIVO DE LAS BPS IDENTIFICARAN POSIBLES MOLECULAS INHIBIDORAS QUE SERAN TESTADAS EN ENSAYOS DE INHIBICION DE CRECIMIENTO PARA DEFINIR EL PAPEL DE ESTAS MOLECULAS EN CR, LA INFORMACION OBTENIDA EN ESTE PROYECTO DARA LUGAR A NUEVAS ESTRATEGIAS TERAPEUTICAS PARA COMBATIR INFECCIONES POR VRE, UN PATOGENO QUE ESTA ADQUIRIENDO RESISTENCIAS A LAS POCAS OPCIONES TERAPEUTICAS DISPONIBLES, ENTEROCOCO\MICROBIOTA\COLONIZACIÓN INTESTINAL\ENFERMEDADES INFECCIOSAS\ANÁLISIS ÓMICOS