Descripción del proyecto
LOS PATOGENOS RESISTENTES A LOS ANTIBIOTICOS (PRAS) REPRESENTAN UN IMPORTANTE PROBLEMA PARA SALUD. LOS PRAS, INCLUYENDO EL ENTEROCOCO RESISTENTE A LA VANCOMICINA (EVR), FRECUENTEMENTE INICIAN LAS INFECCIONES COLONIZANDO EL TRACTO INTESTINAL. UNA VEZ QUE ESTOS PATOGENOS COLONIZAN EL INTESTINO, ALCANZAN NIVELES MUY ALTOS, QUE PROMUEVEN SU DISEMINACION AL TORRENTE SANGUINEO, PONIENDO EN GRAVE PELIGRO LA VIDA DEL PACIENTE. ADEMAS, LA COLONIZACION INTESTINAL PROMUEVE SU DISEMINACION A OTROS PACIENTES MEDIANTE LA CONTAMINACION FECAL DEL MEDIO AMBIENTE. POR TANTO, LA COMPRENSION DE LOS MECANISMOS MOLECULARES POR LOS QUE ESTOS PATOGENOS COLONIZAN EL TRACTO INTESTINAL NOS PERMITIRA PREVENIR LAS INFECCIONES Y LA TRANSMISION DE ARPS ENTRE PACIENTES. ALGUNOS ESTUDIOS HAN COMENZADO A IDENTIFICAR ALGUNOS DE LOS GENES QUE REQUIERE UNO DE ESTOS ARPS (EVR) PARA COLONIZAR EL TRACTO INTESTINAL. SIN EMBARGO, ESTAS INVESTIGACIONES SE HAN CENTRADO EN EL ESTUDIO DE UN SOLO GEN U OPERON, PERO LOS REQUISITOS GENETICOS GENERALES QUE NECESITA EVR PARA COLONIZAR EL INTESTINO AUN NO HAN SIDO DESCUBIERTOS. EN ESTE PROYECTO VAMOS A UTILIZAR UN MODELO DE INFECCION EN RATONES, UNA TECNICA DE MUTAGENESIS POR TRANSPOSICION UNIDA A SECUENCIACION DE ALTO RENDIMIENTO, Y ANALISIS RNA-SEQ CON EL FIN DE IDENTIFICAR LOS GENES QUE REQUIERE EVR PARA COLONIZAR EL TRACTO INTESTINAL. ADEMAS, APLICAREMOS LA METODOLOGIA CRISPR-CAS9 PARA CONFIRMAR LOS GENES REQUERIDOS POR EVR PARA LA COLONIZACION INTESTINAL. POSTERIORMENTE, SE REALIZARAN EXPERIMENTOS IN VIVO, EX VIVO E IN VITRO, EN COMBINACION CON ANALISIS METABOLOMICOS PARA DILUCIDAR EL MECANISMO MOLECULAR POR EL QUE ALGUNOS DE LOS GENES U OPERONES IDENTIFICADOS CONTRIBUYEN A LA COLONIZACION INTESTINAL POR EVR. POR ULTIMO, Y TENIENDO EN CUENTA LA HETEROGENEIDAD DEL ENTORNO INTESTINAL DEL PACIENTE DEBIDO A LA DIVERSIDAD Y EL IMPACTO DEL MICROBIOMA, INVESTIGAREMOS COMO CAMBIAN LOS REQUISITOS GENETICOS DE EVR SEGUN EL ENTORNO INTESTINAL COLONIZADO. LA IDENTIFICACION DE LOS FACTORES DE COLONIZACION CODIFICADOS POR EL ERV Y LOS MECANISMOS MOLECULARES POR LOS QUE ESTE PATOGENO PUEDE ADAPTARSE A DISTINTOS NICHOS INTESTINALES AYUDARAN AL DESCUBRIMIENTO DE NUEVAS TERAPIAS EXITOSAS PARA COMBATIR ESTE PATOGENO DE DIFICIL TRATAMIENTO. NTEROCOCO\RATON\METAGENOMICA\TRANSCRIPTOMICA\MUTAGENESIS\COLONIZACION\ANTIBIOTICO\PATOGENO RESISTENTE\INTESTINO