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SAF2016-80998-R

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ESTUDIO DEL CONTEXTO GENOMICO DE LOS RETROTRANSPOSONES EN TRYPANOSOMA CRUZI Y RE...

ESTUDIO DEL CONTEXTO GENOMICO DE LOS RETROTRANSPOSONES EN TRYPANOSOMA CRUZI Y RELACION DE SUS SECUENCIAS FUNCIONALES CON LOS PROCESOS DE REGULACION DE LA EXPRESION GENICA LOS TRIPANOSOMATIDOS SON PROTOZOOS CAUSANTES DE GRAVES PATOLOGIAS EN HUMANOS COMO DIFERENTES TRIPANOSOMIASIS Y LEISHMANIOSIS. TRYPANOSOMA CRUZI ES EL AGENTE CAUSANTE DE LA ENFERMEDAD DE CHAGAS LA CUAL AFECTA A MAS DE 8 MILLONES DE... ver más

01/01/2016

CSIC

73K€

Presupuesto del proyecto: 73K€

Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2016-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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CSIC

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Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Presupuesto del proyecto 73K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto LOS TRIPANOSOMATIDOS SON PROTOZOOS CAUSANTES DE GRAVES PATOLOGIAS EN HUMANOS COMO DIFERENTES TRIPANOSOMIASIS Y LEISHMANIOSIS. TRYPANOSOMA CRUZI ES EL AGENTE CAUSANTE DE LA ENFERMEDAD DE CHAGAS LA CUAL AFECTA A MAS DE 8 MILLONES DE PERSONAS EN EL MUNDO Y A MAS DE 60.000 EN ESPAÑA. LA SECUENCIACION DE LOS GENOMAS DE TRYPANSOMATIDOS HA MOSTRADO QUE ESTOS CONTIENEN UN ELEVADO NUMERO DE ELEMENTOS MOVILES ACTIVOS E INACTIVOS. LEJOS DE SER SECUENCIAS FOSILES, LOS RETROTRANSPOSONES PARECEN JUGAR UN PAPEL IMPORTANTE EN LA REGULACION GENICA. L1TC Y SU VERSION TRUNCADA, NARTC, SON LOS RETROTRANSPOSONES MAS ABUNDANTES DEL GENOMA DE T. CRUZI. L1TC CODIFICA LAS PROTEINAS QUE CONFORMAN LA MAQUINARIA ENZIMATICA PARA SU MOVILIZACION AUTONOMA. LOS PRIMEROS 77 NUCLEOTIDOS DE L1TC (PR77) SON UN PROMOTOR INTERNO DEPENDIENTE DE LA RNA POLIMERASA II QUE GENERAN MRNAS ABUNDANTES QUE CARECEN DE SPLICED LEADER Y SON TRADUCIBLES. PR77 CONTIENE UN MOTIVO CONSERVADO ENTRE PROMOTORES DENOMINADO DOWNSTREAM PROMOTER ELEMENT (DPE) A QUIEN SE UNEN, DE MANERA ESPECIFICA, FACTORES NUCLEARES. PR77 ESTA CONSERVADA EN EL EXTREMO 5¿DE LA MAYORIA DE LOS RETROELEMENTOS LARGOS, CORTOS, ACTIVOS E INACTIVOS DE TRIPANOSOMATIDOS POR LO QUE HA SIDO CALIFICADA COMO HUELLA PR77. A NIVEL DE RNA, LA HUELLA PR77 DE L1TC ADOPTA UNA ESTRUCTURA SECUNDARIA DE TIPO RIBOZIMA HDV LA CUAL ES ACTIVA Y EJERCE CATALISIS JUSTO ARRIBA DEL DOMINIO RIBOZYMA. LA HUELLA PR77 ESTA CONSERVADA EN CUANTO A SECUENCIA Y ESTRUCTURA EN LOS RETROTRANSPOSONES DE MUCHOS TRIPANOSOMATIDOS. LOS GENOMAS DE LOS TRIPANOSOMATIDOS ESTAN ORGANIZADOS EN GRANDES CLUSTERS DE GENES EN TANDEM QUE SON TRANSCRITOS POR LA RNA POL II LA CUAL SE INICIA EN LAS REGIONES LOCALIZADAS ENTRE LOS CLUSTERS (STRAND SWITCH REGIONS). LA GRAN ACUMULACION DE ELEMENTOS MOVILES ENTRE ESTAS REGIONES SUGIERE QUE LA ACTIVIDAD PROMOTORA DE PR77 ESTE INVOLUCRADA EN EL RECLUTAMIENTO DE LA RNA POL II Y EN LA TRANSCRIPCION DE LOS GENES ADYACENTES Y POLICISTRONES. EN ESTOS ORGANISMOS, LA REGULACION DE LA TRANSCRIPCION GENICA SE ATRIBUYE, PRINCIPALMENTE, A PROCESOS POST TRANSCRIPCIONALES RELACIONADOS CON LA ESTABILIDAD DE LOS MRNAS. EL PRINCIPAL OBJETIVO DE ESTE PROYECTO ES ESTUDIAR LAS IMPLICACIONES FUNCIONALES DEL SISTEMA DOBLE PR77/L1TCRZ EN LA REGULACION DE LA EXPRESION GENICA EN TRIPANOSOMATIDOS. ANALIZAREMOS EL CONTEXTO GENOMICO EN EL QUE SE ENCUENTRAN L1TC Y NARTC EN EL GENOMA DE DIFERENTES CEPAS DE T. CRUZI DE DIFERENTE CAPACIDAD DE INFECCION Y TROPISMO TISULAR. LAS REGIONES GENOMICAS RICAS EN SECUENCIAS PR77 PORTADAS O NO POR RETROELEMENTOS SE RELACIONARAN CON LA ABUNDANCIA RELATIVA DE LOS MRNAS. SE ANALIZARA LA RELACION DE PR77 CON GENES DE VIRULENCIA A LOS QUE L1TC Y NARTC ESTA ASOCIADO, CON EL NIVEL TRANSCRIPCIONAL DE POLICISTRONES Y CON LA ABUNDANCIA DE TRANSCRITOS QUE PORTEN UNA HUELLA PR77 EN SUS REGIONES 3¿UTR. LA IDENTIFICACION DE TRES FACTORES NUCLEARES QUE SE UNEN DE MANERA ESPECIFICA A P77 Y LOS ANTICUERPOS MONOCLONALES GENERADOS FRENTE A ELLOS NOS VA A FACILITAR LA IDENTIFICACION DEL RESTO DE FACTORES QUE CONSTITUYEN EL COMPLEJO DE TRANSCRIPCION. ESTOS ANTICUERPOS NOS VAN A PERMITIR, JUNTO AL USO DE ANTICUERPOS ANTI HISTONAS ACETILADAS, CORRELACIONAR EL INICIO DE TRANSCRIPCION CON PRESENCIA DE P77. SE HAN IDENTIFICADO SECUENCIAS HOMOLOGAS A PR77 CON PLEGAMIENTO COMPATIBLE CON FUNCION RIBOZYMA HDV EN UN GRAN NUMERO DE ORGANISMOS, DESDE HONGOS A EUCARIOTAS SUPERIORES COMO LO QUE SUGIERE UNA FUNCION UNIVERSAL DE ESTA PEQUEÑA SECUENCIA ONTROL DE ENFERMEDAD\REGULACIÓN\EXPRESIÓN GÉNICA\RIBOZIMA-HDV LIKE\PROMOTOR\ELEMENTO MÓVILES\LEISHMANIA\TRYPANOSOMA

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