Descripción del proyecto
LA HISTONA LINKER EN MAMIFEROS ES UNA FAMILIA DE DISTINTOS SUBTIPOS O VARIANTES DE LA HISTONA H1, QUE INCLUYE 7 VARIANTES SOMATICAS (H1,0 A H1,5, Y H1X), ADEMAS DE ALGUNOS SUBTIPOS ESPECIFICOS DE CELULAS GERMINALES, QUE PARTICIPA EN EL ESPACIAMIENTO ENTRE NUCLEOSOMAS Y EN LA FORMACION DE LA ESTRUCTURA DE CROMATINA DE ALTO ORDEN, SE COMPRENDE ESCASAMENTE POR QUE EXISTEN TANTAS VARIANTES DE H1 Y SI PRESENTAN PROPIEDADES PARTICULARES RELEVANTES PARA SU FUNCIONALIDAD, LA HIPOTESIS DE PARTIDA DEL PRESENTE PROYECTO ES QUE SI EXISTEN VARIAS VARIANTES DE LA HISTONA H1 CONSERVADAS EN MAMIFEROS, CO-EXPRESADAS MUCHAS DE ELLAS EN EL MISMO TIPO CELULAR, ESTAS DEBEN PRESENTAR CARACTERISTICAS DIFERENTES QUE CONDUCEN A QUE SE LOCALICEN EN EL GENOMA DE FORMA NO TOTALMENTE SOLAPADA Y/O DESARROLLEN ALGUNAS FUNCIONES DIFERENCIADAS, NOSOTROS Y OTROS GRUPOS HEMOS DEMOSTRADO QUE LA DEPLECION DE DISTINTAS VARIANTES CONDUCE A LA DESREGULACION DE DISTINTOS GENES Y A DIVERSOS EFECTOS FENOTIPICOS, DEPENDIENTES TAMBIEN DEL TIPO CELULAR ANALIZADO, LA ESPECIFICIDAD DEBE VENIR DADA POR EL MOMENTO Y LUGAR DONDE SE EXPRESA CADA VARIANTE, Y POR SU SECUENCIA, MODIFICACIONES POST-TRADUCCIONALES Y ESTRUCTURA, QUE DEBE DETERMINAR QUE INTERACCIONES ESTABLECE CON EL DNA Y FACTORES PROTEICOS DEL NUCLEOPLASMA Y LA CROMATINA,EL OBJETIVO GENERAL DEL PRESENTE PROYECTO ES ENTENDER POR QUE EXISTEN HASTA 7 VARIANTES DE LA HISTONA H1 EN CELULAS SOMATICAS HUMANAS; QUE DIFERENCIAS FUNCIONALES EXISTEN ENTRE ELLAS, QUE OCUPACION DEL GENOMA PRESENTAN, Y QUE INTERACCIONES ESTABLECEN CON OTROS FACTORES NUCLEARES O COMPONENTES DE LA CROMATINA, Y SI ESTO DEPENDE DEL TIPO CELULAR, ESTADIO CELULAR, O GUARDA RELACION CON EL PROCESO CANCERIGENO, TAMBIEN QUEREMOS ESTUDIAR LAS CONSECUENCIAS DE LA DEPLECION SIMULTANEA DE DISTINTAS VARIANTES H1 QUE PROVOCA EFECTOS DRASTICOS COMO LA INDUCCION DE LA RESPUESTA INMUNE INNATA (RESPUESTA INTERFERON) Y MUERTE CELULAR, PROBABLEMENTE POR LA PARTICIPACION DE H1 EN EL SILENCIAMIENTO DE LA HETEROCROMATINA Y DNA REPETITIVO, COLABORANDO EN LA ESTABILIDAD GENOMICA,PARA TODO ELLO DISPONEMOS DE LAS HERRAMIENTAS NECESARIAS, QUE INCLUYEN VECTORES PARA LA EXPRESION INDUCIBLE DE RNAS INTERFERENTES (SHRNAS) CONTRA TODAS LAS VARIANTES, VECTORES PARA LA EXPRESION DE LAS H1S FUSIONADAS AL PEPTIDO SEÑAL HA QUE FACILITA LOS EXPERIMENTOS DE INMUNOPRECIPITACION Y CHIP, Y ANTICUERPOS ESPECIFICOS CONTRA LAS VARIANTES, LA COMBINACION DE ESTAS HERRAMIENTAS EN DISTINTOS TIPOS DE CELULAS, SANAS O TUMORALES, PROVENIENTES DE DISTINTOS TEJIDOS, DEBERIA PERMITIR ESTABLECER SI LAS ESPECIFICIDADES FUNCIONALES DE LAS DISTINTAS VARIANTES SE CONSERVAN ENTRE TEJIDOS O SON UNA CARACTERISTICA PARTICULAR DE ESTOS O DEL ESTADO DE LA CELULA,LA FINALIDAD DEL PROYECTO ES ENTENDER COMO UN COMPONENTE ESTRUCTURAL DE LA CROMATINA INTERVIENE EN LA REGULACION DE LOS PROCESOS NUCLEARES INCLUYENDO EL CONTROL DE LA EXPRESION GENICA, CON IMPLICACIONES EN PROLIFERACION, DIFERENCIACION Y LA DESREGULACION QUE SUPONE EL PROCESO TUMORAL, HISTONA H1\LINKER\VARIANTES\CROMATINA\TRANSCRIPCIÓN\MODIFICACIONES POST-TRADUCCIONALES\CHIP-SEQ\EPIGENÓMICA\CÁNCER