Descripción del proyecto
LA HISTONA LINKER EN MAMIFEROS ES UNA FAMILIA DE DISTINTOS SUBTIPOS O VARIANTES DE LA HISTONA H1, QUE INCLUYE 7 VARIANTES SOMATICAS (H1,0 A H1,5, Y H1X), ADEMAS DE ALGUNOS SUBTIPOS ESPECIFICOS DE CELULAS GERMINALES, QUE PARTICIPA EN EL ESPACIAMIENTO ENTRE NUCLEOSOMAS Y EN LA FORMACION DE LA ESTRUCTURA DE CROMATINA DE ALTO ORDEN, SE COMPRENDE ESCASAMENTE POR QUE EXISTEN TANTAS VARIANTES DE H1 Y SI PRESENTAN PROPIEDADES PARTICULARES RELEVANTES PARA SU FUNCIONALIDAD, LA HIPOTESIS DE PARTIDA DEL PRESENTE PROYECTO ES QUE SI EXISTEN VARIAS VARIANTES DE LA HISTONA H1 CONSERVADAS EN MAMIFEROS, CO-EXPRESADAS EN EL MISMO TIPO CELULAR, ESTAS DEBEN PRESENTAR CARACTERISTICAS DIFERENTES QUE CONDUCEN A QUE SE LOCALICEN EN EL GENOMA DE FORMA NO TOTALMENTE SOLAPADA Y/O DESARROLLEN ALGUNAS FUNCIONES DIFERENCIADAS, NOSOTROS Y OTROS GRUPOS HEMOS DEMOSTRADO QUE LA DEPLECION DE DISTINTAS VARIANTES CONDUCE A LA DESREGULACION DE DISTINTOS GENES Y A DIVERSOS EFECTOS FENOTIPICOS, DEPENDIENTES TAMBIEN DEL TIPO CELULAR ANALIZADO, LA ESPECIFICIDAD DEBE VENIR DADA POR EL MOMENTO Y LUGAR DONDE SE EXPRESA CADA VARIANTE, Y POR SU SECUENCIA, MODIFICACIONES POST-TRADUCCIONALES Y ESTRUCTURA, QUE DEBE DETERMINAR QUE INTERACCIONES ESTABLECE CON EL DNA Y FACTORES PROTEICOS DEL NUCLEOPLASMA Y LA CROMATINA, NUMEROSOS ESTUDIOS HAN MOSTRADO QUE LAS VARIANTES SOMATICAS DE LA H1 PRESENTAN ALTERACIONES GENETICAS O EN SU EXPRESION EN VARIOS TIPOS DE CANCER, POR EJEMPLO, EN MELANOMA, ALGUNAS DE ESTAS ALTERACIONES CORRELACIONAN CON MENOR SUPERVIVENCIA, ALGUNOS MELANOMAS SON RESISTENTES A TERAPIA CON INHIBIDORES BRAF/MEK O A INMUNOTERAPIA, DADO QUE LA DEPLECION COMBINADA DE H1,2 Y H1,4 EN CANCER DE MAMA INDUCE LA RESPUESTA INMUNE INNATA (RESPUESTA INTERFERON) POR LA DESREPRESION DE TRANSCRITOS A PARTIR DE DNA REPETITIVO Y SATELITES, Y ESTO PODRIA REVERTIR LA INMUNORESISTENCIA DE TUMORES, NOS PROPONEMOS INVESTIGAR SI LA DEPLECION DE H1 EN LINEAS DE MELANOMA TIENE TAMBIEN ESTE EFECTO, PARA ELLO ESTUDIAREMOS EN ESTAS CELULAS CUAL ES EL COMPLEMENTO DE H1, COMO SE REGULA Y COMO AFECTA SU ALTERACION A LA PROLIFERACION TUMORAL, EXPRESION GENICA Y ORGANIZACION DE LA CROMATINA, USAREMOS CELULAS DE CANCER DE MAMA Y MELANOMA PARA INVESTIGAR EL INTERACTOMA ESPECIFICO DE CADA VARIANTE H1, DONDE DE LOCALIZAN EN EL GENOMA MEDIANTE CHIP Y CUT&RUN, Y EN EL NUCLEO MEDIANTE MICROSCOPIA DE SUPER-RESOLUCION, TAMBIEN VAMOS A COMPARAR LA EXPRESION Y LOCALIZACION DE LAS VARIANTES H1 EN CULTIVOS CELULARES CRECIENDO EN MONOCAPA O COMO ESFEROIDES, Y SI LA DEPLECION DE LAS H1S AFECTA EL DESARROLLO DE ESTOS ESFEROIDES, PARA TODO ELLO DISPONEMOS DE VECTORES PARA LA EXPRESION INDUCIBLE DE RNAS INTERFERENTES (SHRNAS) Y ANTICUERPOS PARA INMUNOPRECIPITACION Y CHIP, ESPECIFICOS CONTRA LAS VARIANTES H1, LA COMBINACION DE ESTAS HERRAMIENTAS EN DISTINTOS TIPOS CELULARES, DEBERIA PERMITIR ESTABLECER SI LAS ESPECIFICIDADES FUNCIONALES DE LAS DISTINTAS VARIANTES SE CONSERVAN ENTRE TEJIDOS O SON UNA CARACTERISTICA PARTICULAR DE ESTOS O DEL ESTADO DE LA CELULA, Y SI LA PROGRESION TUMORAL ESTA INFLUENCIADA POR EL COMPLEMENTO DE LAS VARIANTES H1, HISTONA H1\LINKER\VARIANTES\CROMATINA\TRANSCRIPCION\EPIGENOMICA\CANCER\MELANOMA\CHIP-SEQ\RESPUESTA INTERFERON