Descripción del proyecto
LA REGION N-TERMINAL DE SRC, FORMADA POR LOS DOMINIOS SH4, UNICO Y SH3, A LA QUE DENOMINAMOS SNRE (DEL INGLES SRC N-TERMINAL REGULATORY ELEMENT) REGULA LA CAPACIDAD DE INVASION Y CRECIMIENTO DE CELULAS DE CANCER COLORECTAL. EN ESTE PROYECTO VAMOS A I) ESTUDIAR LAS INTERACCIONES DENTRO DE LA SNRE, II) SU CONEXION CON EL RESTO DE LA PROTEINA Y SU ENTORNO CELULAR, Y III) EL USO DE LA SNRE COMO DIANA TERAPEUTICA EN ONCOLOGIA.CARACTERISTICAS SINGULARES DE LA REGION SNRE SON: I) LA PRESENCIA DE ZONAS DESORDENADAS CON INTERACCIONES TRANSITORIAS, II) SU DIMERIZACION ASOCIADA AL ANCLAJE A MEMBRANAS, III) LA EXISTENCIA DE UN SITIO INTERNO DE UNION DEL GRUPO MIRISTOILO, Y IV) LA PROTEOLISIS EN UN SITIO ESPECIFICO DEL DOMINIO UNICO. ESTAS CARACTERISTICAS REGULAN PROCESOS ALOSTERICOS, DE DIFUSION FACILITADA EN LA SUPERFICIE DE LA MEMBRANA HACIA SITIOS ESPECIFICOS DE SEÑALIZACION Y, POSIBLEMENTE, DE RELOCALIZACION DE SRC ENTRE COMPARTIMIENTOS, INCLUYENDO EL NUCLEO. LA FRACCION NUCLEAR DE SRC HA SIDO POCO ESTUDIADA. LA PROTEOLISIS EN EL DOMINIO UNICO PODRIA SER DETERMINANTE PARA EL TRANSPORTE AL NUCLEO. FINALMENTE, SE ABORDARA EL EFECTO DE LA SNRE EN LA DINAMICA GLOBAL DE SRC. SRC ESTA DIRECTAMENTE LIGADO A LA PROGRESION Y MALA PROGNOSIS EN MULTIPLES TIPOS DE CANCER. LOS FARMACOS ACTUALES CONTRA SRC ACTUAN SOBRE EL SITIO DE UNION A ATP, COMUN A MUCHAS QUINASAS, Y MUESTRAN BAJA SELECTIVIDAD Y LA APARICION DE RESISTENCIA. FARMACOS CONTRA LA REGION SNRE SE ESPERA QUE MUESTREN MAYOR SELECTIVIDAD, DEBIDO A LA SINGULARIDAD DE LA SECUENCIA DEL DOMINIO UNICO. POR OTRO LADO, EL DOMINIO UNICO ESTA FOSFORILADO DE FORMA DISTINTA EN DISTINTOS TIPOS CELULARES, LO QUE PODRIA PERMITIR ACTUAR DE FORMA SELECTIVA SOBRE CELULAS CANCEROSAS. EN EL PROYECTO VAMOS A UTILIZAR PROTEINAS FLUORESCENTES FUSIONADAS CON LOS EXTREMOS DE LA SNRE PARA IDENTIFICAR PEQUEÑAS MOLECULAS QUE DESESTABILICEN DICHA REGION. LA SNRE ES UN COMPONENTE DE UNA REGION SINGULAR QUE DENOMINAMOS, EN INGLES DISORDERED BOUNDARY OF THE CELL (DBC). ESTE CONCEPTO, INTRODUCIDO POR NUESTRO GRUPO, SE BASA EN LA ABUNDANCIA DE REGIONES DESORDENADAS ANCLADAS A MEMBRANAS Y PREDICE QUE LOS GRUPOS CARGADOS EN LOS LIPIDOS Y LAS PROTEINAS DESORDENADAS ESTAN ELECTROSTATICAMENTE ACOPLADOS. ESTO DA LUGAR A PROPIEDADES EMERGENTES, COMO LA DIMERIZACION INESPERADA DE ZONAS CON FUERTE CARGA POSITIVA ANCLADAS A UNA BICAPA. LA MODULACION DE LA PROPIA DBC, IMPIDIENDO LA DIMERIZACION DE SRC MEDIANTE MOLECULAS QUE SE ACUMULEN EN ESTA REGION, CONSTITUYE UNA SEGUNDA ESTRATEGIA PARA ENCONTRAR NUEVOS INHIBIDORES NO CLASICOS DE SRC. SE HA DEMOSTRADO QUE LOS ANTIBIOTICOS QUE ACTUAN SOBRE LAS PROPIEDADES FISICAS DE LA MEMBRANA TIENEN MENOS TENDENCIA A INDUCIR RESISTENCIA.PARA DESARROLLAR ESTAS NUEVAS ESTRATEGIAS DESDE UNA BASE SOLIDA EL PROYECTO TAMBIEN ABORDARA ASPECTOS BASICOS DE LA DBC COMO EL ESTUDIO EXPERIMENTAL Y COMPUTACIONAL DE LA DINAMICA DE PROTEINAS DESORDENADAS EN ENTORNOS RESTRINGIDOS O EN LA SUPERFICIE DE MEMBRANAS. ALGUNOS ASPECTOS DE ESTE PROYECTO TOCAN LOS LIMITES DE LOS METODOS ESTANDAR DE RMN Y EN EL PROYECTO SE CONTEMPLA TAMBIEN EL DESARROLLO DE METODOS NO CONVENCIONALES, INCLUYENDO RMN DE 129XE HIPERPOLARIZADO POR POLARIZACION NUCLEAR DINAMICA, NUEVOS MARCAJE ISOTOPICOS Y TECNICAS MEJORADAS DE ADQUISICION Y PROCESADO, INCLUYENDO MUESTREADO NO-UNIFORME. RC\MEMBRANA CELULAR\FRONTERA DESORDENADA DE LA CÉLULA\DOMINIO ÚNICO\COMPARTIMIENTO NUCLEAR DE SRC\QUINASAS NO-RECEPTORAS DE LA FAMILA SRC\SEÑALIZACIÓN CELULAR\DESCUBRIMIENTO DE FÁRMACOS\PROTEÍNAS INTRINSECAMENTE DESORDENADAS\CÁNCER COLORECTAL