Descripción del proyecto
LAS VIAS DE QUIMIOSEÑALIZACION SON MECANISMOS IMPORTANTES EN LA TRADUCCION DE SEÑALES EN BACTERIAS, ESTAS VIAS MEDIAN LA QUIMIOTAXIS Y HAY EVIDENCIA DE QUE ESTA ES UN FACTOR IMPORTANTE EN LA VIRULENCIA, RECIENTEMENTE SE HAN DESCUBIERTO VIAS DE QUIMIOSEÑALIZACION CON OTRAS FUNCIONES COMO LA REGULACION DE NIVELES DE SEGUNDOS MENSAJEROS, QUE A SU VEZ REGULAN MUCHOS PROCESOS CON RELEVANCIA CLINICA COMO LA FORMACION DE BIOPELICULAS, EL QUORUM SENSING O LA SECRECION DE FACTORES DE VIRULENCIA, LOS QUIMIORRECEPTORES ESTAN AL INICIO DE LAS VIAS DE QUIMIOSEÑALIZACION, LA UNION DE SEÑALES AL DOMINIO DE UNION A LIGANDO (DUL) GENERA UN ESTIMULO QUE TERMINA CAUSANDO LA FOSFORILACION DE CHEY, LO QUE DEFINE LA RESPUESTA DEL SISTEMA, LOS 4 QUIMIORRECEPTORES DE E, COLI HAN SIDO ESTUDIADOS EXTENSAMENTE Y FORMAN PARTE DE LA UNICA VIA QUE MODULA LA QUIMIOTAXIS, LOS RECEPTORES CONTIENEN UN DUL DEL TIPO PAQUETE DE 4 HELICES CON UN SOLO SITIO DE UNION A LIGANDO, EL ANALISIS DE GENOMAS HA DEMOSTRADO QUE MUCHAS BACTERIAS TIENEN UN NUMERO ELEVADO DE QUIMIORRECEPTORES Y MULTIPLES VIAS, TAMBIEN HA REVELADO QUE APROXIMADAMENTE EL 40% DE LOS QUIMIORRECEPTORES TIENEN UN DUL CON UN TAMAÑO CASI EL DOBLE DEL EQUIVALENTE EN E, COLI, LOS RECEPTORES CON UN DUL GRANDE NO ESTAN CARACTERIZADOS Y SUS DUL NO ESTAN ANOTADOS EN LA BASE DE DATOS SMART, EL OBJETIVO DEL PROYECTO ES SOLVENTAR LA FALTA DE CONOCIMIENTO EN ESTE AMBITO, EN UNA COLABORACION ENTRE T, KRELL Y J,A, GAVIRA, LOS IP DEL PROYECTO, SE HA IDENTIFICADO LA ESTRUCTURA DE UNO DE ESTOS DUL GRANDES, QUE REPRESENTA UN NUEVO TIPO DE DOMINIO (PINEDA ET AL, 2012, PNAS 109, 18926), ESTE DOMINO (LLAMADO HBM) ESTA COMPUESTO POR DOS MODULOS HELICOIDALES; CADO UNO PUEDE UNIR SEÑALES, HEMOS DEMOSTRADO QUE LA UNION DE SEÑALES A CADO UNO DE LOS MODULOS CAUSA UNA RESPUESTA, APARTE DEL DOMINIO HBM EXISTE UNA SEGUNDA FAMILIA DE DUL GRANDES, QUE SE LLAMA DOBLE PDC, ESTE DOMINO ESTA COMPUESTO POR DOS MODULOS GLOBULARES DE TIPO ALFA/BETA Y CADO UNO POSEE UNA CAVIDAD PARA LA UNION DE SEÑALES, NO SE SABE SI ESTAS CAVIDADES UNEN SEÑALES,LA CARACTERISTICA COMUN DE LOS RECEPTORES CON UN DUL GRANDE ES SU ORGANIZACION BIMODULAR, HIPOTETIZAMOS QUE CADA MODULO RECONOCE SEÑALES DISTINTAS, Y QUE CADA UNO CONTRIBUYE A LA RESPUESTA, EN MICROBIOLOGIA SE HAN DESCRITO VARIOS MECANISMOS QUE PERMITEN LA INCLUSION DE DISTINTAS SEÑALES EN LA DEFINICION DE LA RESPUESTA, PENSAMOS QUE LOS QUIMIORRECEPTORES CON DUL BIMODULAR CONSTITUYEN OTRO MECANISMO, POR ELLO, SOLICITAMOS FONDOS PARA CONTINUAR LA COLABORACION TAN FRUCTIFERA ENTRE LOS LABORATORIOS KRELL Y GAVIRA INCLUYENDO EXPERTOS DE ALEMANIA, FRANCIA Y MEXICO, UTILIZAREMOS CEPAS DE PSEUDOMONAS, Y EN PARTICULAR LOS RECEPTORES MCPS, PCTA Y PCTC, RESPONSABLES DE LA QUIMIOTAXIS HACIA ACIDOS ORGANICOS, AMINOACIDOS Y GABA RESPECTIVAMENTE, ESTE PROYECTO ELUCIDARA MUCHOS ASPECTOS BASICOS DEL FUNCIONAMIENTO DE ESTA FAMILIA, UTILIZANDO APROXIMACIONES TRANSVERSALES DE BIOINFORMATICA, MICROBIOLOGIA, BIOLOGIA MOLECULAR, BIOQUIMICA DE PROTEINAS, TERMODINAMICA Y BIOLOGIA ESTRUCTURAL, ADICIONALMENTE SE REALIZARAN EXPERIMENTOS PARA ELUCIDAR LA RELEVANCIA FISIOLOGICA DE ESTOS RECEPTORES Y EVALUAR SU CONTRIBUCION EN LA COLONIZACION DE RAICES O EN LA VIRULENCIA, LOS RESULTADOS DE ESTE PROYECTO COLMARAN LAS LAGUNAS EN EL CONOCIMIENTO DE ESTA ABUNDANTE Y RELEVANTE FAMILIA DE RECEPTORES, LO QUE PERMITIRA CONCLUIR SI LA RAZON DE SU EXISTENCIA RESIDE EN LA CAPACIDAD DE INTEGRAR MULTIPLES SEÑALES EN LA DEFINICION DE LA RESPUESTA, TRADUCCIÓN DE SEÑALES\ VÍAS QUIMIOSENSORIALES\ QUIMIORRECEPTOR\ QUIMIOTAXIS\ DETECCIÓN DE SEÑALES\ PSEUDOMONAS\ RECONOCIMIENTO MOLECULAR\ ESTRUCTURA DE PROTEÍNA