Descripción del proyecto
LOS ANTIBIOTICOS SON NUESTRAS PRINCIPALES ARMAS PARA LUCHAR CONTRA LAS BACTERIAS PATOGENAS, SOMOS TESTIGOS DEL AVANCE GALOPANTE DE LA RESISTENCIA DE BACTERIAS A ANTIBIOTICOS, CAUSA DE LA MUERTE DE 700 000 PACIENTES CADO AÑO, Y SE ESTIMA QUE ESTA CIFRA PUEDE AUMENTAR HASTA 10 MILLONES EN 2050, LOS ANTIBIOTICOS MATAN O REDUCEN EL CRECIMIENTO BACTERIANO, RESULTANDO EN PRESIONES EVOLUTIVAS QUE FAVORECEN LA APARIENCIA DE RESISTENCIAS ADICIONALES, LA LUCHA CONTRA LA RESISTENCIA A ANTIBIOTICOS CON NUEVOS ANTIBIOTICOS CREA UN CIRCULO VICIOSO QUE NO RESUELVE EL PROBLEMA A LARGO PLAZO, UNA ALTERNATIVA PROMETEDORA A LOS ANTIBIOTICOS ES LA TERAPIA ANTIINFECCIOSA, BASADA EN LA INHIBICION DE MECANISMOS MOLECULARES QUE CAUSAN ENFERMEDAD, PERO QUE NO INTERFIEREN CON EL CRECIMIENTO, EN ESTE CONTEXTO, LAS PROTEINAS DE TRADUCCION DE SEÑALES BACTERIANAS SON BLANCOS PRINCIPALES, LOS QUIMIORRECEPTORES (QRS) ESTAN ENTRE LOS RECEPTORES BACTERIANOS MAS ABUNDANTES, LOS QRS RECONOCEN MOLECULAS SEÑAL DE MANERA DIRECTA O EN COMPLEJO CON PROTEINAS DE UNION A LIGANDO, LO QUE CAUSA EL ESTIMULO DE VIAS DE QUIMIOTAXIS, AUNQUE LOS QRS JUEGAN UN PAPEL CLAVE EN LA VIRULENCIA DE PATOGENOS, LAS MOLECULAS SEÑAL RECONOCIDAS POR LA GRAN MAYORIA DE LOS QRS SON DESCONOCIDAS, SIN EMBARGO, ESTE CONOCIMIENTO NO ES SOLAMENTE ESENCIAL PARA COMPRENDER EL MECANISMO MOLECULAR DE QUIMIOTAXIS, PERO TAMBIEN NECESARIO PARA EL DESARROLLO DE NUEVAS ESTRATEGIAS DE TERAPIA ANTIINFECCIOSA, EL PRINCIPAL OBJETIVO DE ESTE PROYECTO ES COLMAR ESTAS LAGUNAS EN EL CONOCIMIENTO, SE UTILIZARAN PSEUDOMONAS AERUGINOSA PAO1 Y PECTOBACTERIUM ATROSEPTICUM SCRI1043 COMO CEPAS MODELO PARA PATOGENOS HUMANOS Y DE PLANTAS, RESPECTIVAMENTE, INICIALMENTE, EL PROF, ZHULIN (EE,UU,) HARA ESTUDIOS DE GENOMICA COMPARATIVA UTILIZANDO CEPAS PATOGENAS, ASI COMO CEPAS NO PATOGENAS FILOGENETICAMENTE RELACIONADAS, PARA IDENTIFICAR QRS PRESENTES EN CEPAS PATOGENAS, SE GENERARA EL DOMINIO DE UNION A LIGANDO DE ESTOS QRS COMO PROTEINA INDIVIDUAL PARA REALIZAR CRIBADOS A ALTO RENDIMIENTO UTILIZANDO LIBRERIAS DE COMPUESTOS, ESTA APROXIMACION HA SIDO LIDERADA POR EL IP, RESULTANDO EN LA IDENTIFICACION DE MUCHOS RECEPTORES NUEVOS, ALTERNATIVAMENTE, SE GENERARAN QRS QUIMERICAS QUE SERAN INTRODUCIDOS EN E, COLI PARA UN CRIBADO IN VIVO; EXPERIMENTOS A REALIZAR POR EL PROF, SOURJIK (ALEMANIA), LOS PARAMETROS DE UNION DE LOS COMPUESTOS HITS SE DETERMINARAN MEDIANTE CALORIMETRIA ISOTERMA DE TITULACION, PARA IDENTIFICAR QRS ESTIMULADOS POR PROTEINAS DE UNION A LIGANDO, SE REALIZARAN ENSAYOS DE PULL-DOWN CON LOS DOMINIOS DE UNION A LIGANDO INMOVILIZADOS, SE PREPARARAN MUTANTES BACTERIANOS EN GENES DE QRS PARA ENSAYOS DE QUIMIOTAXIS Y ESTUDIOS DE INFECCION DE PLANTAS (COLABORACION DRA, LOPEZ-SOLANILLA), SE REQUIERE MOTILIDAD QUIMIOTACTICA EN LA SUPERFICIE DE PLANTAS PARA LOCALIZAR SITIOS DE ENTRADA, Y SE INVESTIGARA SI LA PERTURBACION DE GRADIENTES MEDIANTE LA APLICACION DE QUIMIOEFECTORES CLAVES REDUCE LA VIRULENCIA, EN COLABORACION CON EL DR, GAVIRA SE HARAN ENSAYOS DE CRISTALIZACION DE DOMINIOS DE UNION A LIGANDO PARA LA RESOLUCION DE SU ESTRUCTURA 3D, ESTE PROYECTO RESULTARA EN LA ANOTACION FUNCIONAL DE UN GRAN NUMERO DE QRS, Y SE DESVELARAN LAS PRESIONES EVOLUTIVAS QUE RESULTARON EN LA QUIMIOTAXIS DE PATOGENOS, ESTE PROYECTO APORTARA IMPORTANTES CONTRIBUCIONES EN LOS CAMPOS DE TRADUCCION DE SEÑALES, VIRULENCIA, RECONOCIMIENTO MOLECULAR Y BIOLOGIA ESTRUCTURAL, QUE FORMARAN LAS BASES PARA EL DESARROLLO DE NUEVAS ESTRATEGIAS ANTIINFECCIOSAS, SISTEMAS DE TRADUCCION DE SEÑALES EN BAC\VIAS DE QUIMIOSEÑALIZACION\QUIMIOTAXIS\QUIMIORRECEPTOR\DETECCION DE MOLECULAS SEÑAL\DOMINIOS DE RECONOCIMIENTO DE MOLECULAS \RECONOCIMIENTO MOLECULAR\CRIBADO DE ALTO RENDIMIENTO\BACTERIAS PATOGENAS