Descripción del proyecto
HOY EN DIA SE NECESITAN NUEVOS ANTIBIOTICOS PARA COMBATIR ENFERMEDADES INFECCIOSAS PERSISTENTES, EMERGENTES Y RECURRENTES, ASI COMO AQUELLAS CON RESISTENCIAS ADQUIRIDAS EN HOSPITALES, HISTORICAMENTE, LOS ANTIBIOTICOS SE HAN OBTENIDO A PARTIR DE BIOMOLECULAS MICROBIANAS PRESENTES DE FORMA NATURAL CON CAPACIDAD PARA MATAR BACTERIAS, DESDE LOS AÑOS 40, LA BUSQUEDA POR TODO EL MUNDO DE BACTERIAS DEL SUELO FACILMENTE CULTIVABLES, COMO POR EJEMPLO, LOS ACTINOMICETOS, DIO COMO RESULTADO EL DESCUBRIMIENTO DE MUCHOS ANTIBIOTICOS POTENTES, PERO ESA APROXIMACION HA SIDO ABANDONADA EN GRAN MEDIDA POR LAS COMPAÑIAS FARMACEUTICAS DEBIDO A LAS ALTAS FRECUENCIAS DE REDESCUBRIMIENTO DE ANTIBIOTICOS CONOCIDOS, SIN EMBARGO, LAS BACTERIAS QUE HAN ELUDIDO LOS METODOS DE CULTIVO CONVENCIONALES Y QUE, POR TANTO, NO SE HA EXAMINADO LA UTILIDAD DE SUS PRODUCTOS NATURALES, EXCEDEN EN DOS O TRES ORDENES DE MAGNITUD A AQUELLAS QUE HAN SIDO CULTIVADAS, LAS NUEVAS INVESTIGACIONES LLEVADAS A CABO EN LA ULTIMA DECADA EN EL CAMPO DEL CULTIVO DE MICROORGANISMOS OFRECEN LA POSIBILIDAD DE REINICIALIZAR EL PROCESO DE DESCUBRIMIENTO Y ABRE RUTAS ALTERNATIVAS AL DESCUBRIMIENTO DE FARMACOS A PARTIR DE BACTERIAS AUN NO CULTIVADAS, NUESTRA HIPOTESIS DE TRABAJO ES QUE LOS HABITATS DE ANDALUCIA CONTIENEN UNA PLETORA DE BACTERIAS NO CULTIVADAS E INEXPLORADAS QUE PRODUCEN NUEVOS PRODUCTOS NATURALES BIOACTIVOS,RESPONDEREMOS A LA PREGUNTA DE SI LAS BACTERIAS NO CULTIVADAS DEL SUELO, NUMERICAMENTE DOMINANTES, SON CAPACES DE PRODUCIR NUEVOS ANTIBIOTICOS, Y A LA VEZ, ESTABLECEREMOS Y OPTIMIZAREMOS PROTOCOLOS Y PROCESOS PARA UNA EXPLORACION FUTURA A GRAN ESCALA DE LAS BACTERIAS NO CULTIVABLES REALIZANDO LOS TRES OBJETIVOS SIGUIENTES:1, SE EMPLEARAN METODOS AVANZADOS DE CULTIVO Y SEPARACION DE CELULAS MICROBIANAS PARA ACCEDER Y CULTIVAR NUEVOS TIPOS DE BACTERIAS, SE UTILIZARA UN ANALISIS TAXONOMICO MOLECULAR MEDIANTE LA AMPLIFICACION Y SECUENCIACION DE LA SUBUNIDAD PEQUEÑA DEL GEN ARNR (SSU ADNR) PARA REVELAR LA DIVERSIDAD E IDENTIDAD DE LAS BACTERIAS AISLADAS, SE EVALUARA EL POTENCIAL GENETICO PARA PRODUCIR ANTIBIOSIS DE LAS BACTERIAS DESCONOCIDAS CON EL FIN DE FACILITAR LOS SUBSIGUIENTES PROCESOS DE FERMENTACION Y DE PRODUCCION DE SUS PRODUCTOS NATURALES,2, EL EMPLEO DE UN METODO DE ENSAYO DE COLONIAS BACTERIANAS DE ALTA CAPACIDAD Y DE FERMENTACIONES EN FORMATO MINIATURIZADO PERMITIRA UNA RAPIDA DETECCION DE AQUELLAS BACTERIAS QUE PRODUCEN ANTIBIOTICOS, POSTERIORMENTE SE FERMENTARAN LAS COLECCIONES DE CEPAS PRODUCTORAS DE ANTIBIOTICOS PARA GENERAR UNA COLECCION ENRIQUECIDA DE EXTRACTOS, LOS PERFILES DE METABOLITOS SE CARACTERIZARAN Y SE DESREPLICARAN MEDIANTE CROMATOGRAFIA-LIQUIDA Y ESPECTROMETRIA DE MASAS, LOS EXTRACTOS MICROBIANOS QUE CONTENGAN ANTIBIOTICOS CONOCIDOS SE CORRELACIONARAN CON LA FILOGENIA BACTERIANA, LOS EXTRACTOS QUE CONTENGAN ANTIBIOTICOS NO IDENTIFICABLES SE PRIORIZARAN PARA UNA MAYOR CARACTERIZACION,3, LA COLECCION DE EXTRACTOS SE EVALUARA MEDIANTE ENSAYOS EMPIRICOS CON CELULAS ENTERAS Y ENSAYOS CON UNA DIANA ESPECIFICA PARA IDENTIFICAR NUEVOS ANTIBIOTICOS FRENTE A PATOGENOS HUMANOS GRAM -, ASI COMO POTENCIAR O RESTAURAR LA ACCION DE ANTIBIOTICOS BETA-LACTAMICOS, SE VALORARA EL POTENCIAL DE ESTAS NUEVAS MOLECULAS COMO TERAPIAS CONTRA PSEUDOMONAS AERUGINOSA Y STAPHYLOCOCCUS AUREUS RESISTENTE A METICILINA (MRSA),