Descripción del proyecto
EXISTEN HOY EN DIA DIVERSAS ENFERMEDADES PRODUCIDAS POR VIRUS, TANTO EN EL HOMBRE COMO EN ANIMALES DE INTERES QUE ESTAN SIENDO OBJETO DE ESTUDIO POR NUMEROSOS GRUPOS DE INVESTIGACION, LA MAYORIA DE ESTOS VIRUS INDUCEN UNA SERIE DE EFECTOS CITOPATOGENICOS EN LAS CELULAS INFECTADAS, CUYA BASE MOLECULAR HA SIDO OBJETO DE ESTUDIO POR NUESTRO GRUPO DURANTE VARIOS AÑOS, EL OBJETO DE ESTE PROYECTO ES AHONDAR EN LOS MECANISMOS DE INTERFERENCIA VIRAL CON LAS CELULAS INFECTADAS ENFOCANDO ESTA INVESTIGACION EN LOS EFECTOS DE SECUENCIAS PRESENTES EN LOS GENOMAS VIRALES QUE PRODUZCAN PER SE MODIFICACIONES EN LA CELULA A NIVEL MOLECULAR, EL MODELO QUE UTILIZAREMOS PARA ESTE ESTUDIO SERA EL VIRUS SINDBIS, UN ALPHAVIRUS QUE PERTENECE A LA FAMILIA TOGAVIRIDAE QUE CONTIENE RNA DE CADENA POSITIVA COMO MATERIAL GENETICO, ADEMAS, ANALIZAREMOS CON FINES COMPARATIVOS REPLICONES DE ALGUNOS PICORNAVIRUS Y DEL VIRUS DE LA HEPATITIS C, QUE PERTENECE A LA FAMILIA FLAVIVIRIDAE, SE ANALIZARA EL EFECTO DE LA PRESENCIA DE SECUENCIAS DEL GENOMA VIRAL EN EL CITOPLASMA DE LA CELULA, PARA LO QUE SE UTILIZARAN DOS ENFOQUES DISTINTOS: LA EXPRESION DE ESTAS SECUENCIAS EN PLASMIDOS QUE CONTENGAN EL PROMOTOR DEL FAGO T7 EN CELULAS QUE EXPRESAN DE MANERA CONSTITUTIVA LA RNA POLIMERASA DE ESTE FAGO Y EL SEGUNDO ENFOQUE SERA LA TRANSCRIPCION IN VITRO DE ESTAS SECUENCIAS PARA SU TRANSFECCION EN CELULAS EN CULTIVO, SE ANALIZARAN LOS EFECTOS DE ESTAS SECUENCIAS, TANTO EN LA SINTESIS DE MACROMOLECULAS CELULARES, COMO EN LA REDISTRIBUCION DE PROTEINAS ENTRE EL NUCLEO Y EL CITOPLASMA, RECIENTEMENTE HEMOS PUBLICADO QUE AMBOS FENOMENOS ESTAN RELACIONADOS Y SE PROPONE DETERMINAR LAS SECUENCIAS MINIMAS DEL RNA VIRAL QUE INDUZCAN AMBOS EFECTOS, MEDIANTE ANALISIS DE PROTEOMICA DETERMINAREMOS LAS PROTEINAS CELULARES CUYA REDISTRIBUCION ESTE AFECTADA POR LA INFECCION VIRAL O POR LA EXPRESION DE DETERMINADAS SECUENCIAS VIRICAS, ADEMAS, MEDIANTE ESTOS ENSAYOS NUESTRO OBJETIVO ES DETERMINAR LAS PROTEINAS TANTO VIRALES COMO CELULARES QUE ESTEN INTERACCIONANDO CON LOS MRNAS VIRALES Y QUE PUEDAN PARTICIPAR EN EL MECANISMO DE SU TRADUCCION, SERA TAMBIEN DE GRAN INTERES DETERMINAR LAS PROTEINAS QUE ESTEN UNIDAS A LOS MRNAS CELULARES QUE NO SE TRADUCEN EN LAS CELULAS INFECTADAS, YA QUE ALGUNA DE ESTAS PROTEINAS PUEDE ESTAR IMPLICADA EN EL MECANISMO DE INTERFERENCIA VIRAL CON LA TRADUCCION CELULAR, DENTRO DEL ANALISIS DE DISTINTOS MOTIVOS PRESENTES EN LOS MRNAS DEL VIRUS SINDBIS SE CONTINUARA EL ESTUDIO PARA COMPRENDER LA FUNCIONALIDAD DE ESTAS ESTRUCTURAS EN EL RNA VIRAL Y EL MECANISMO POR EL QUE CONFIEREN LA INDEPENDENCIA DE DISTINTOS FACTORES DE INICIACION, EXISTE UNA ESTRUCTURA EN LA ZONA CODIFICANTE DEL MRNA SUBGENOMICO VIRAL CERCANA AL AUG QUE PROVEE INDEPENDENCIA DEL FACTOR EIF2, AUNQUE SU MODO DE ACCION EXACTO PERMANECE AUN DESCONOCIDO, POR OTRO LADO, PROPONEMOS TAMBIEN ESTUDIAR UNAS SECUENCIAS REPETIDAS QUE FORMAN TRES HORQUILLAS EN LA REGION 3 NO CODIFICANTE DE LOS MRNAS VIRALES Y SU IMPLICACION EN LA REPLICACION Y TRADUCCION DE ESTOS MRNAS, EL OBJETIVO DE TODOS ESTOS ESTUDIOS ESTA DIRIGIDO A COMPRENDER MEJOR LOS MECANISMOS MOLECULARES DE CITOPATOGENICIDAD VIRAL Y DE LA INTERFERENCIA VIRAL CON LA RESPUESTA ANTIVIRAL DE LAS CELULAS, ESTOS ESTUDIOS SERVIRAN PARA PODER DISEÑAR TERAPIAS ANTIVIRALES MAS EFICACES BASADAS EN BLOQUEAR LA ACCION DE SECUENCIAS VIRALES CITOPATOGENICAS, INFECCIONES VIRALES\CITOPATOLOGÍA MOLECULAR\PROTEÍNAS VIRALES CITOTÓXICAS\RESPUESTA ANTIVIRAL\ESTRUCTURA DE RNA VIRAL