Descripción del proyecto
LAS UNIDADES FUNCIONALES DE LOS ORGANISMOS VIVOS SON ENSAMBLADOS MACROMOLECULARES O NANOMAQUINAS QUE LLEVAN A CABO TODOS LOS PROCESOS FUNDAMENTALES DE LA BIOLOGIA, ESTAS MAQUINAS SON COMPLEJOS DE PROTEINAS Y ACIDOS NUCLEICOS QUE CONVIERTEN LA ENERGIA QUIMICA EN CAMBIOS CONFORMACIONALES; SON ESTRUCTURAS MUY DINAMICAS, CON UNA GRAN VARIABILIDAD CONFORMACIONAL INHERENTE A SUS FUNCIONES Y MECANISMOS, MUCHOS DE ESTOS PROCESOS CELULARES SE HAN DESCUBIERTO DIRECTA O INDIRECTAMENTE A TRAVES DEL ESTUDIO DE VIRUS, YA QUE ALTERAN LAS FUNCIONES CELULARES Y MODULAN EL COMPORTAMIENTO CELULAR,NUESTROS SISTEMAS MODELO DERIVADOS DE VIRUS DE DIVERSA COMPLEJIDAD SON LAS CAPSIDAS, UN PARADIGMA PARA EL ANALISIS DE PROCESOS DINAMICOS, Y OTROS COMPLEJOS MACROMOLECULARES ESENCIALES EN EL CICLO DEL VIRUS, BASADO EN NUESTRO TRABAJO PREVIO, NOS ENFOCAMOS PRINCIPALMENTE EN VIRUS RNA DE DOBLE CADENA (DSRNA) COMO LOS BIRNAVIRUS DE LA BUSITIS INFECCIOSA (IBDV, UN PATOGENO AVIAR) Y DE LA NECROSIS PANCREATICA INFECCIOSA (IPNV, UN PATOGENO DE PECES), Y VARIOS MICOVIRUS COMO LOS VIRUS DE PENICILLIUM CHRYSOGENUM (PCV) Y DE ROSELLINIA NECATRIX (RNQV1, QUE INFECTA UN ASCOMICETO PATOGENO DE ARBOLES FRUTALES),LOS OBJETIVOS ESPECIFICOS DE ESTE PROYECTO SON:1, ANALISIS ESTRUCTURAL Y FUNCIONAL DE LOS COMPLEJOS RIBONUCLEOPROTEICOS (RNPC) DE IBDV, EL DSRNA GENOMICO DE IBDV ESTA UNIDO A LA PROTEINA DE LA NUCLEOCAPSIDA (SIMILAR AL DNA UNIDO A LAS HISTONAS EN LAS CELULAS EUCARIOTAS) Y A UNAS POCAS COPIAS DE LA RNA-POLIMERASA EN SUS EXTREMOS 5, ESTAS RNPC SON LAS MAQUINAS MOLECULARES PARA LA TRANSCRIPCION Y REPLICACION VIRALES, Y SU RECONSTRUCCION TRIDIMENSIONAL PROPORCIONARA UNA MEJOR COMPRENSION DE ESTOS MECANISMOS CRUCIALES, LAS RNPC SERAN ANALIZADAS TAMBIEN EN SU ESTADO ACTIVO PARA LA SINTESIS DE RNA,2, ANALISIS ESTRUCTURAL Y FUNCIONAL DE LOS COMPLEJOS DE LA PROTEASA DE IBDV, VP4, LA PROTEASA QUE PROCESA LA POLIPROTEINA VIRAL, FORMA ESTRUCTURAS HELICOIDALES EN CELULAS INFECTADAS POR IBDV, LA UNIDAD ESTRUCTURAL BASICA ES UN DIMERO DE VP4, ESTABILIZADO POR INTERACCIONES INTRA- E INTERDIMERICAS, A PARTIR DE MUTANTES DE DELECCION DE LAS REGIONES N Y C TERMINAL, QUE MEDIAN LOS CONTACTOS INTRA- E INTERDIMERICOS RESPECTIVAMENTE, Y EL ANALISIS DE CRISTALOGRAFIA DE RAYOS X, PRETENDEMOS ESTABLECER SU MECANISMO DE REGULACION,3, ANALISIS ESTRUCTURAL Y NANOSCOPICO DE LAS CAPSIDAS DE IPNV E IBDV, PARA CORRELACIONAR LAS CARACTERISTICAS ESTRUCTURALES DE LAS INTERACCIONES DE LOS CAPSOMEROS DE IBDV E IPNV CON LAS PROPIEDADES MECANICAS DE SUS CAPSIDAS, LLEVAREMOS A CABO UN ANALISIS MEDIANTE MICROSCOPIA DE FUERZAS ATOMICAS, LOS VIRIONES DE IPNV SERAN ANALIZADOS MEDIANTE CRYO-ME TRIDIMENSIONAL,4, ESTUDIOS FUNCIONALES Y EVOLUTIVOS DE VIRUS DSRNA DE HONGOS A PARTIR DE CRYO-ME 3D A RESOLUCION CUASI-ATOMICA, LA ESTRUCTURA DE PCV A 4 A DE RESOLUCION NOS INDICA UNA DUPLICACION ESTRUCTURAL DE UN UNICO DOMINIO CON PUNTOS CALIENTES ESPECIFICOS PARA LA INSERCION DE PEPTIDOS, ESTAS PREDICCIONES SERAN EVALUADAS EN UNA SISTEMA BASADO EN EL ENSAMBLAJE DE PSEUDO-PARTICULAS VIRALES (VLP) PARA INTRODUCIR MUTACIONES EN DIFERENTES REGIONES, LA ESTRUCTURA DE RNQV1 A RESOLUCION ATOMICA SE RESOLVERA A PARTIR DE PELICULAS ADQUIRIDAS CON UN DETECTOR DIRECTO DE ELECTRONES,LA CARACTERIZACION ESTRUCTURAL DE ESTOS ENSAMBLADOS MACROMOLECULARES PUEDE IDENTIFICAR NUEVAS DIANAS PARA EL DISEÑO DE TERAPIAS FUTURAS, PARA INHIBIR FUNCIONES ESENCIALES COMO EL ENSAMBLAJE VIRAL Y LA REPLICACION DEL GENOMA, PATÓGENOS VIRALES\COMPLEJO MACROMOLECULAR\NANOBIOMÁQUINA\CRIO-MICROSCOPÍA ELECTRÓNICA TRIDIMENSIO\CICLO VIRAL