ACTIVACION DE RUTAS CRIPTICAS DE METABOLITOS SECUNDARIOS DE STREPTOMYCES MEDIANT...
ACTIVACION DE RUTAS CRIPTICAS DE METABOLITOS SECUNDARIOS DE STREPTOMYCES MEDIANTE LA DIFERENCIACION DE LAS HIFAS Y LA HOMEOSTASIS DEL COBRE
EL PROBLEMA. EL ALARMANTE INCREMENTO DE LAS RESISTENCIAS ANTIMICROBIANAS ESTA HACIENDO QUE MUCHAS INFECCIONES SEAN MUY DIFICILES DE TRATAR (PRIORIDAD TEMATICA SALUD).SOLUCIONES. MEJORAR EL USO DE LOS ANTIBIOTICOS (APROXIMACION C...
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Descripción del proyecto
EL PROBLEMA. EL ALARMANTE INCREMENTO DE LAS RESISTENCIAS ANTIMICROBIANAS ESTA HACIENDO QUE MUCHAS INFECCIONES SEAN MUY DIFICILES DE TRATAR (PRIORIDAD TEMATICA SALUD).SOLUCIONES. MEJORAR EL USO DE LOS ANTIBIOTICOS (APROXIMACION CLINICA NO TRATADA AQUI); DESCUBRIR NUEVOS ANTIBIOTICOS SIN RESISTENCIAS EXTENDIDAS (ESTA ES LA APROXIMACION EXPLORADA EN STREPDIFCU, CONCRETAMENTE USAR LA DIFERENCIACION DE STREPTOMYCES PARA POTENCIAR EL METABOLISMO SECUNDARIO Y CONTRIBUIR AL DESCUBRIMIENTO DE NUEVOS COMPUESTOS BIOACTIVOS).ANTECEDENTES. STREPTOMYCES CODIFICA UNOS 30 METABOLITOS SECUNDARIOS POR GENOMA, DE LOS QUE SOLO UNA MINIMA FRACCION ES PRODUCIDA EN EL LABORATORIO. EN NUESTRO PROYECTO ERC STARTING GRANT STRP-DIFFERENTIATION 280304 CREAMOS UN MUTANTE EN LOS GENES SCO2730 Y SCO2731 (CHAPERON DE COBRE Y SU TRANSPORTADOR, MUTANTE SCO2730::TN5062) QUE ES CAPAZ DE EXPRESAR EL 50% DE SUS METABOLITOS SECUNDARIOS EN EL LABORATORIO DURANTE TODO EL CICLO DE DESARROLLO, SALTANDOSE LA FASE NO PRODUCTORA (VEGETATIVA). EN EL PROYECTO ERC PROOF OF CONCEPT (STREPCRYPTPATH-835857) HEMOS CREADO UN RNAM ANTISENTIDO FRENTE A LOS GENES SCO2730 Y SCO2731 QUE POTENCIA EL METABOLISMO SECUNDARIO DE CUALQUIER ESTREPTOMICETO, PERO A UN NIVEL INFERIOR AL DEL MUTANTE SCO2730::TN5062. RECIENTEMENTE, EN EL PROYECTO RTI2018-093978-B-I00 DESCUBRIMOS QUE EL MUTANTE SCO2730::TN5062 TIENE UN INCREMENTO MUY SIGNIFICATIVO DE LA TASA DE MUTACION ESPONTANEA (EL CLON ANALIZADO EN EL PROYECTO STG-STRP-DIFFERENTIATION TENIA LOS EXTREMOS DE SU CROMOSOMA DELECIONADOS Y 14 MUTACIONES PUNTUALES). EXPERIMENTOS DE MUTAGENESIS ALEATORIA, TAMBIEN REALIZADOS EN NUESTRO PROYECTO RTI2018-093978-B-I00, NOS PERMITIERON IDENTIFICAR 6 MUTANTES (EN LOS GENES SCO1897, SCO0954, SCO1758, SCO2102, SCO4439 Y SCO4440) QUE MOSTRABAN FENOTIPOS MUY SIGNIFICATIVOS EN DIVISION CELULAR, METABOLISMO SECUNDARIO, FORMACION DE POLIFOSFATOS, MADURACION DE LAS ESPORAS, Y FORMACION DE CELULAS CARENTES DE PARED CELULAR.TEORIZAMOS QUE LA ACTIVACION MASIVA DEL METABOLISMO SECUNDARIO DEL MUTANTE SCO2730::TN5062 DEPENDE DE LA MUTACION DE LOS GENES SCO2730 Y SCO2731 COMBINADA CON PARTE DEL RESTO DE MUTACIONES PRESENTES EN EL CLON ANALIZADO EN EL PROYECTO STG STRP-DIFFERENTIATION. TAMBIEN TEORIZAMOS QUE LA CARACTERIZACION DE LOS MUTANTES EN LOS MUTANTES INDICADOS ARRIBA CONTRIBUIRA A MEJORAR NUESTRA COMPRENSION DE LA DIFERENCIACION DE STREPTOMYCES. EL PRIMER RETO SERA DISEÑAR HERRAMIENTAS PARA REPRODUCIR LA ACTIVACION DEL METABOLISMO SECUNDARIO DEL MUTANTE SCO2730::TN5062 EN CUALQUIER ESTREPTOMICETO (INVESTIGACION APLICADA). CREAREMOS UN METODO PARA ELIMINAR LOS EXTREMOS DEL CROMOSOMA USANDO REGIONES CONSERVADAS DE ESTOS EXTREMOS; USAREMOS EL RNAM ANTISENTIDO CREADO EN EL PROYECTO ERC PROOF OF CONCEPT PARA DISMINUIR LA EXPRESION DE LOS GENES SCO2730 Y SCO2731. SI ESTO NO FUNCIONA, ACTIVAREMOS EL PLAN DE CONTINGENCIA, DIEÑANDO RNAMS ANTISENTIDO PARA DISMINUIR LA EXPRESION DE LOS OTROS 14 GENES MUTADOS EN EL MUTANTE SCO2730::TN5062. EL SEGUNDO RETO SERA EXPLORAR LOS 6 MUTANTES MENCIONADOS ARRIBA, CON EL FIN DE AVANZAR EN NUESTRA COMPRENSION DE LA DIFERENCIACION Y LA ACTIVACION DEL METABOLISMO SECUNDARIO (INVESTIGACION BASICA).INNOVACION. EL CONOCIMIENTO GENERADO CONTRIBUIRA AL AVANCE DE LA COMPRESION DE LA DIFERENCIACION DE STREPTOMYCES. SI PODEMOS ACTIVAR LA PRODUCCION DE LA MITAD DE LOS METABOLITOS SECUNDARIOS DE STREPTOMYCES, PODRIAMOS REVOLUCIONAR LA BUSQUEDA DE NUEVOS METABOLITOS SECUNDARIOS. TREPTOMYCES\BIOTECNOLOGIA\FARMA\SCREENING\RUTAS CRIPTICAS\METABOLITOS SECUNDARIOS\COMPUESTOS BIOACTIVOS\ANTIBIOTICOS\ESPORULACION\DIFERENCIACION
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