Descripción del proyecto
LOS VIRUS DE RNA EVOLUCIONAN MAS RAPIDAMENTE QUE NINGUNA OTRA ENTIDAD NATURAL. SU RAPIDA EVOLUCION SE DEBE EN ULTIMA INSTANCIA A UNAS ELEVADAS TASAS DE MUTACION, ORDENES DE MAGNITUD MAYORES QUE LAS DE LOS ORGANISMOS DE DNA. ESTA PROPENSION A LOS ERRORES TIENE IMPLICACIONES EN SALUD PUBLICA RELACIONADAS CON LA PATOGENESIS, LAS TERAPIAS ANTIVIRALES O LA EMERGENCIA VIRAL. SIN EMBARGO, LAS ESTIMACIONES ACTUALES DE LAS TASAS DE MUTACION VARIAN FUERTEMENTE ENTRE DIFERENTES VIRUS DE RNA E INCLUSO DENTRO DE UN MISMO VIRUS. EN ESTE PROYECTO, PROPONEMOS INVESTIGAR LA VARIABILIDAD Y EVOLUCION DE LAS TASAS DE MUTACION DE LOS VIRUS DE RNA A DIFERENTES NIVELES. PRIMERAMENTE, ANALIZAREMOS LAS DIFERENCIAS ENTRE GRANDES GRUPOS DE VIRUS MEDIANTE LA COMPARACION ENTRE RNA VIRUS DE CADENA SENCILLA Y DE DOBLE CADENA, ASI COMO EVALUANDO SI EXISTE UNA CORRELACION EN EL CONJUNTO DE LOS VIRUS DE RNA ENTRE EL TAMAÑO GENOMICO Y LA FIDELIDAD DE COPIA POR SITIO NUCLEOTIDICO. EN SEGUNDO LUGAR, USANDO HERRAMIENTAS DE EVOLUCION EXPERIMENTAL, COMPROBAREMOS SI LAS TASAS DE MUTACION DE LOS VIRUS DE RNA HAN SIDO OPTIMIZADAS POR LA SELECCION NATURAL PARA MAXIMIZAR LA CAPACIDAD ADAPTATIVA DE ESTOS. PARA ELLO, COMPARAREMOS LA CAPACIDAD ADAPTATIVA DE VIRUS EN LOS QUE LA FIDELIDAD REPLICATIVA HA SIDO ALTERADA MEDIANTE LA INTRODUCCION DE SUSTITUCIONES DE UN UNICO AMINOACIDO EN SUS POLIMERASAS. ADEMAS, CARACTERIZAREMOS LA EVOLUCION DE VIRUS DE RNA SOMETIDOS A UNA PRESION DE SELECCION PARA EL INCREMENTO DE LA FIDELIDAD LLEVANDO A CABO PASES SERIADOS EN PRESENCIA DE MUTAGENOS QUIMICOS ESPECIFICOS. EL CONJUNTO DE LOS EXPERIMENTOS CONLLEVARA EL MANEJO DE VIRUS DE RNA MUY DIFERENTES, COMO UN BACTERIOFAGO, UN CORONAVIRUS, UN ROTAVIRUS Y UN PICORNAVIRUS. FINALMENTE, USAREMOS UNA NUEVA APROXIMACION PARA LLEVAR A CABO EL PRIMER ESTUDIO EN PROFUNDIDAD DE LA TASA DE MUTACION DE UN VIRUS HUMANO IN VIVO, USANDO UN GRAN NUMERO DE SECUENCIAS DE HIV-1 OBTENIDAS DE MUESTRAS DE PACIENTES. ESTO NOS LLEVARA A PLANTEAR PREGUNTAS NOVEDOSAS COMO POR EJEMPLO SI EXISTE VARIACION EN LA TASA DE MUTACION VIRAL ENTRE PACIENTES O ENTRE DIFERENTES ESTADIOS DE LA ENFERMEDAD, ASI COMO ESTABLECER LAS POSIBLES IMPLICACIONES BIOMEDICAS DE ESTA VARIABILIDAD. LOS PROCEDIMIENTOS EXPERIMENTALES DE ESTE PROYECTO COMBINARAN METODOS CLASICOS CON RECIENTES AVANCES TECNOLOGICOS, LO CUAL NOS PERMITIRA CARACTERIZAR LAS TASAS DE MUTACION CON UN NIVEL DE DETALLE SIN PRECEDENTES Y PODRIA AYUDARNOS A DESVELAR NUEVOS MECANISMOS DE GENERACION DE DIVERSIDAD EN VIRUS DE RNA. IRUS\HIV-1\BACTERIOFAGO\SECUENCIACION\ANTIVIRAL\MUTACION\VARIABILIDAD\EVOLUCION\GENETICA