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BFU2009-06993

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BIOLOGIA EVOLUTIVA Y DE SISTEMAS DE LA EMERGENCIA DE FITOVIRUS DE RNA

UNO DE LOS MAYORES DESAFIOS PARA LA SANIDAD, HUMANA Y ANIMAL, Y PARA LA AGRONOMIA ES LA APARICION DE NUEVAS ENFERMEDADES INFECCIOSAS, LA MAYORIA CAUSADA POR VIRUS DE RNA, LOS VIRUS DE RNA MUESTRAN UNA GRAN PLASTICIDAD EVOLUTIVA C... ver más

01/01/2009

CSIC

431K€

Presupuesto del proyecto: 431K€

Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

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Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Presupuesto del proyecto 431K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto UNO DE LOS MAYORES DESAFIOS PARA LA SANIDAD, HUMANA Y ANIMAL, Y PARA LA AGRONOMIA ES LA APARICION DE NUEVAS ENFERMEDADES INFECCIOSAS, LA MAYORIA CAUSADA POR VIRUS DE RNA, LOS VIRUS DE RNA MUESTRAN UNA GRAN PLASTICIDAD EVOLUTIVA COMO CONSECUENCIA DE LOS ENORMES TAMAÑOS POBLACIONALES QUE ALCANZAN, SUS CORTOS TIEMPOS DE GENERACION Y SUS ALTAS TASAS DE MUTACION Y RECOMBINACION, ENTENDER LOS MECANISMOS POR LOS QUE UN VIRUS SE CONVIERTE EN EMERGENTE ES FUNDAMENTAL PARA PODER DISEÑAR DE MANERA RACIONAL NUEVAS TERAPIAS ANTIVIRALES Y ESTRATEGIAS DE CONTROL,EN ESTE PROYECTO ESTAMOS INTERESADOS EN APRENDER CUALES SON LOS MECANISMOS GENETICO-POBLACIONALES QUE DETERMINAN LA EMERGENCIA DE NUEVOS VIRUS Y QUE CAMBIOS, TANTO EN EL GENOMA VIRAL COMO EN SU INTERACCION CON LA PLANTA HUESPED, ACONTECEN DURANTE EL PROCESO DE EMERGENCIA Y POSTERIOR ADAPTACION AL NUEVO HUESPED,PLANTEAMOS UNA APROXIMACION EXPERIMENTAL QUE EMPLEA COMO VIRUS MODELO AL POTYVIRUS DEL GRABADO DEL TABACO, ESTRATEGIA QUE COMPLEMENTAREMOS CON UNA APROXIMACION IN SILICO PROPIA DE LA BIOLOGIA DE SISTEMAS COMPUTACIONAL, EN PRIMER LUGAR, CARACTERIZAREMOS LA DISTRIBUCION DE EFECTOS MUTACIONALES E INTERACCIONES EPISTATICAS ENTRE PARES DE MUTACIONES ALEATORIAS A TRAVES DE UNA PANOPLIA DE POTENCIALES HUESPEDES Y CONTRASTAREMOS NUESTROS RESULTADOS CON LAS PREDICCIONES DE MODELOS RECIENTEMENTE PROPUESTOS PARA ESTE PROCESO, EN SEGUNDO LUGAR, REALIZAREMOS UN GRAN EXPERIMENTO DE EVOLUCION QUE PRETENDE SIMULAR LA APARICION DE UN NUEVO VIRUS DE RNA EN UNA POBLACION DE HUESPEDES GENETICAMENTE HETEROGENEOS, DE LOS RESULTADOS DE ESTE EXPERIMENTO Y DE SU ANALISIS DETALLADO ESPERAMOS APRENDER: (I) SOBRE QUE CONSTRICCIONES IMPONEN DISTINTOS GENOTIPOS DEL HUESPED Y SOBRE LA ESPECIFICIDAD DE LA ADAPTACION, (II) SOBRE LA REPRODUCIBILIDAD DE LA EVOLUCION TANTO A NIVEL FENOTIPICO COMO EN SU BASE MOLECULAR, ASI COMO IDENTIFICAR CUALES SON LAS DIANAS DE LA SELECCION EN UN GENOMA VIRAL, (III) CUALES SON LOS COMPONENTES CELULARES (GENES Y REDES DE INTERACCION) A LOS QUE DEBE ADAPTARSE ESPECIFICAMENTE EL VIRUS Y COMO SU MANIPULACION PUEDE RESULTAR EN VIRULENCIA Y (IV) MEDIANTE LA COMPARACION DE NUESTROS DATOS TRANSCRIPTOMICOS, Y DE UN MODELO INFERIDO PARA EL INTERACTOMA DEL HUESPED, CON OTROS OBTENIDOS PARA DISTINTOS VIRUS INFECTANDO EL MISMO HUESPED, INTENTAREMOS ELUCIDAR SI VIRUS FILOGENETICAMENTE RELACIONADOS ACTUAN SOBRE LAS MISMAS DIANAS EN EL INTERACTOMA DEL HUESPED MIENTRAS QUE VIRUS NO RELACIONADOS LO HACEN SOBRE DIANAS COMPLETAMENTE DISTINTAS, FINALMENTE, HACIENDO USO DE LAS NUEVAS TECNICAS DE PIROSECUENCIACION MASIVA, OBTENDREMOS UNA DESCRIPCION SIN PRECEDENTES DE COMO LA VARIABILIDAD GENETICA DE UN VIRUS ES GENERADA, SE DISTRIBUYE ESPACIALMENTE EN DISTINTOS TEJIDOS Y ORGANOS Y EVOLUCIONA CON EL TIEMPO EN UN HUESPED INDIVIDUAL, ADAPTACION\MUTACIONES BENEFICIOSAS\VIRUS EMERGENCES\EPISTASIAS\DINAMICAS EVOLUTIVAS\GAMA DE HUESPEDES\CARGA MUTACIONAL\BIOLOGIA DE SISTEMAS\EVOLUCION DE VIRUS

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