Descripción del proyecto
EL CANCER SE DESARROLLA DEBIDO A LA ACUMULACION DE ALTERACIONES TANTO GENETICAS COMO EPIGENETICAS, PERO MIENTRAS LOS CAMBIOS GENETICOS SON FIJOS, LAS MODIFICACIONES EPIGENETICAS SON POTENCIALMENTE REVERSIBLES. LA PLASTICIDAD DE LOS MECANISMOS EPIGENETICOS LOS CONVIERTE EN COORDINADORES IDEALES DE PROCESOS DINAMICOS, COMO LOS QUE OCURREN DURANTE LA PROGRESION DEL CANCER. NO OBSTANTE, TAMBIEN PODEMOS APROVECHAR ESTA CARACTERISTICA PARA ABORDAR SU TRATAMIENTO, POR LO QUE EL DESARROLLO DE FARMACOS PARA REVERTIR LAS ALTERACIONES EPIGENETICAS ES UN CAMPO DE ACTIVA INVESTIGACION. ALGUNAS "EPIDROGAS", INHIBIDORES DE ENZIMAS CON ACTIVIDAD EPIGENETICA, SE EMPLEAN YA EN LA PRACTICA CLINICA Y SON EL TRATAMIENTO HABITUAL EN DETERMINADAS NEOPLASIAS HEMATOLOGICAS. ADEMAS, SOLIDAS EVIDENCIAS SOPORTAN QUE MAS ALLA DE SU POTENCIAL COMO MONOTERAPIAS, LAS EPIDROGAS PODRIAN ACTUAR SINERGICAMENTE CON OTRAS TERAPIAS MODULANDO LA SENSIBILIDAD DE LAS CELULAS CANCEROSAS A OTROS TRATAMIENTOS, INCLUIDA LA INMUNOTERAPIA; CONOCIMIENTOS EN LO QUE SE APOYAN VARIOS ENSAYOS CLINICOS EN CURSO.ANTE ESTE ESCENARIO, ESTAMOS EN EL MOMENTO PRECISO PARA GENERAR CONOCIMIENTOS BIOLOGICOS QUE ORIENTEN EL DESARROLLO DE NUEVAS ESTRATEGIAS TERAPEUTICAS, CON EL OBJETIVO FINAL DE EXTENDER LOS BENEFICIOS DE LAS EPIDROGAS A MAS PACIENTES ONCOLOGICOS. EN ESTA PROPUESTA EMPLEAREMOS TECNOLOGIA DE VANGUARDIA PARA ABORDAR PREGUNTAS CLAVE EN EL CAMPO DE LA EPIGENOMICA DEL CANCER, INCLUIDO EL NIVEL DE HETEROGENEIDAD EPIGENETICA DEL CANCER A RESOLUCION DE CELULAS INDIVIDUALES, ASI COMO EL IMPACTO DEL USO DE EPIDROGAS EN LA SELECCION CLONAL. PROPONEMOS CARACTERIZAR VARIAS CAPAS DE COMPLEJIDAD A NIVEL DE CELULAS INDIVIDUALES (SINGLE-CELL, SC) PARA GENERAR LOS METILOMAS TUMORALES DE MAS ALTA DEFINICION POR SCDNAMETHYLATION, Y LOS PRIMEROS MAPAS TRANSCRIPTOMICOS TRAS EL TRATAMIENTO CON EPIDROGAS POR TRANSCRIPTOMICA ESPACIAL. TAMBIEN IDENTIFICAREMOS PROGRAMAS REGULADORES GENICOS QUE CONTROLAN LA RESPUESTA A EPIDROGAS MEDIANTE SCATAC-SEQ MAS SCRNA-SEQ, Y ESTUDIAREMOS LA SELECCION CLONAL MEDIANTE EL ESTUDIO DEL ADN Y PROTEINAS EN CELULAS INDIVIDUALES.CON EL FIN DE ACELERAR LA TRANSFERENCIA DEL CONOCIMIENTO GENERADO EN ESTE ESTUDIO EN BENEFICIO DE LOS PACIENTES ONCOLOGICOS, LA PRIMERA PARTE DE ESTE PROYECTO SE CENTRARA EN ENFERMEDADES QUE YA SON TRATADAS CON EPIDROGAS EN LA PRACTICA CLINICA: SINDROME MIELODISPLASICO TRATADO CON EL INHIBIDOR DE LA ADN METILTRANSFERASA AZACITIDINA, SEZARY LINFOMA CUTANEO DE CELULAS-T TRATADO CON EL INHIBIDOR DE HISTONA DESACETILASA VORINOSTAT, Y LINFOMA FOLICULAR TRATADO CON EL INHIBIDOR DE EZH2 TAZEMETOSTAT. COMPARAREMOS MUESTRAS DE TUMORES ANTES Y DESPUES DEL TRATAMIENTO PARA DESENTRAÑAR LA COMPLEJIDAD DE LA HETEROGENEIDAD TUMORAL Y LA SELECCION CLONAL. ADEMAS, IDENTIFICAREMOS VULNERABILIDADES TERAPEUTICAS EN EL MICROAMBIENTE TUMORAL QUE GUIEN EL USO COMBINADO DE EPIDROGAS CON OTRAS ESTRATEGIAS.EN LA SEGUNDA PARTE DEL PROYECTO, DILUCIDAREMOS NUEVAS OPORTUNIDADES PARA LAS EPIDROGAS MEDIANTE EL ESTUDIO DE TUMORES SOLIDOS DE PACIENTES TRATADOS CON INMUNOTERAPIAS Y CANCER DE ORIGEN DESCONOCIDO. LA INTERACCION ENTRE LAS CELULAS MALIGNAS Y EL MICROAMBIENTE TUMORAL ES UN REGULADOR CRITICO DE LA RESPUESTA A LOS FARMACOS, POR LO QUE LA CARACTERIZACION EXHAUSTIVA DE LAS POBLACIONES CELULARES EN ESTOS TUMORES Y LA INTEGRACION CON LOS HALLAZGOS DE LOS TUMORES TRATADOS CON EPIDROGAS REVELARAN NUEVAS ESTRATEGIAS PARA OPTIMIZAR LOS TRATAMIENTOS COMBINADOS EN LOS TUMORES SOLIDOS PIGENOMICA DEL CANCER\RESPUESTA A FARMACOS\SELECCION CLONAL\HETEROGENEIDAD TUMORAL\MEDICINA DE PRECISION\APROXIMACIONES DE CELULA UNICA\FARMACOS EPIGENETICOS (EPIDROGAS)