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PID2019-111217RB-I00

Financiado
UNA APROXIMACION TRASLACIONAL A LA INTERPRETACION DE VARIANTES DE SECUENCIA EN P...
UNA APROXIMACION TRASLACIONAL A LA INTERPRETACION DE VARIANTES DE SECUENCIA EN PROTEINAS: INTEGRANDO IMPACTO MOLECULAR, REGULACION POR EL ENTORNO GENETICO Y COSTE CLINICO LA COMPRENSION DE LOS MECANISMOS MOLECULARES Y CELULARES QUE DETERMINAN EL IMPACTO DE LAS VARIANTES DE SECUENCIA NO ES SOLO UN PROBLEMA BIOLOGICAMENTE RELEVANTE, ES UN DESAFIO CRUCIAL PARA LA CONSTRUCCION DE LA MEDICINA DEL SIGLO... LA COMPRENSION DE LOS MECANISMOS MOLECULARES Y CELULARES QUE DETERMINAN EL IMPACTO DE LAS VARIANTES DE SECUENCIA NO ES SOLO UN PROBLEMA BIOLOGICAMENTE RELEVANTE, ES UN DESAFIO CRUCIAL PARA LA CONSTRUCCION DE LA MEDICINA DEL SIGLO XXI, PARA ABORDARLO, NECESITAMOS AVANZAR EN NUESTRO CONOCIMIENTO DE COMO EL PERFIL GENETICO DE UN INDIVIDUO LE HACE VULNERABLE A LA ENFERMEDAD, A NIVEL PRACTICO, ELLO SIGNIFICA COMPRENDER EL VALOR FUNCIONAL DE LAS VARIANTES GENETICAS DEL INDIVIDUO, PREVIAMENTE IDENTIFICADAS MEDIANTE EXPERIMENTOS DE SECUENCIACION MASIVA ('NEXT-GENERATION SEQUENCING -NGS-),SIN EMBARGO, EL ALCANCE DE ESTA ESTRATEGIA SE VE SEVERAMENTE AFECTADO POR NUESTRA INCAPACIDAD ACTUAL PARA RESPONDER A UNA DE LAS PREGUNTAS CENTRALES DE LA MEDICINA PERSONALIZADA, CONOCIDA COMO EL PROBLEMA DE LA INTERPRETACION DE LAS VARIANTES (PIV): 'CUAL ES LA RELACION ENTRE PERFIL GENETICO Y VULNERABILIDAD A LA ENFERMEDAD ?' O, TAL COMO SE PLANTEA EN NUESTRO PROYECTO, 'PODEMOS ESTABLECER SI LA SUBSTITUCION DE UN AMINOACIDO POR OTRO PUEDE AFECTAR A LA FUNCION DE LA PROTEINA ?'EN ESTE PROYECTO, REFORMULAMOS COMPLETAMENTE Y EXTENDEMOS LA APROXIMACION ACTUAL AL PIV, SIGUIENDO EL PARADIGMA 'BACK TO BASICS' (ESTABLECIDO POR SHENDURE Y COLABORADORES, CELL, 2019), PARTIENDO DE LOS RESULTADOS DE NUESTRA EXITOSA PARTICIPACION EN EL CONCURSO INTERNACIONAL DE METODOS IN SILICO, CAGI 5, Y EN BASE A NUESTROS RESULTADOS PRELIMINARES SOBRE EL PAPEL REGULADOR DEL ENTORNO GENETICO, DESCOMPONEMOS EL PIV EN DOS GRANDES BLOQUES: (I) MODELADO DEL IMPACTO FUNCIONAL DE LAS VARIANTES DE SECUENCIA, Y (II) CARACTERIZACION DEL PAPEL REGULADOR DEL ENTORNO GENETICO EN LA PROPAGACION DEL IMPACTO DE LAS VARIANTES A LOS NIVELES SUPERIORES DE LA JERARQUIA BIOLOGICA (CELULA, TEJIDO, ETC,), ESTOS DOS BLOQUES CONSTITUIRAN EL NUCLEO DE LOS OBJETIVOS 1 Y 2 Y SE CENTRARAN EN LA GENERACION DE CONOCIMIENTO MECANISTICO Y DE METODOS COMPUTACIONALES PARA ABORDAR EL PIV, RELACIONADO CON ESTE ULTIMO ASPECTO, EN NUESTRO OBJETIVO 3 DESARROLLAREMOS UN MODELO ORIGINAL DEL COSTE CLINICO PARA LA IDENTIFICACION DE LA MEJOR HERRAMIENTA PARA LAS APLICACIONES MEDICAS DE LA SECUENCIACION,EN LA EJECUCION DE ESTOS OBJETIVOS COMBINAREMOS LOS RESULTADOS DE LAS MAS RECIENTES TECNICAS GENOMICAS (EXPERIMENTOS 'SINGLE-CELL', HI-C, ETC,) CON DATOS GENETICOS POBLACIONALES Y PRINCIPIOS BIOFISICOS Y ESTRUCTURALES SOBRE LAS VARIANTES DE SECUENCIA, LOS MODELOS COMPUTACIONALES OBTENIDOS SE TRANSFORMARAN EN HERRAMIENTAS 'IN SILICO' ADAPTADAS A LAS NECESIDADES DE LOS PROFESIONALES DE LA SALUD, Y DIFUNDIDAS A TRAVES DE NUESTRA WEB (WWW,BIOTOCLIN,ORG),A FIN DE GARANTIZAR LA RELEVANCIA CLINICA DE NUESTROS RESULTADOS, VALIDAREMOS NUESTRAS HERRAMIENTAS EN UN CONJUNTO DE UNOS 1,900 EXOMAS/PANELES GENICOS PROPORCIONADOS POR NUESTROS COLABORADORES EN DIFERENTES INSTITUCIONES, TANTO INTERNACIONALES (E, BHOJ, CHILDREN’S HOSPITAL OF PHILADELPHIA, USA) COMO NACIONALES (O, DIEZ, ONCOGENETICS, VHIO; R, COLOBRAN, IMMUNOGENETICS AND A, MESEGUER, RENAL PHYSIOPATHOLOGY AMBOS DEL VHIR; F, VIDAL, DIAGNOSTICS AND MOLECULAR THERAPY UNIT, BANC DE SANG I TEIXITS), FINALMENTE, ME GUSTARIA RECALCAR QUE NUESTRA COLABORACION CON EL CHILDREN’S HOSPITAL OF PHILADELPHIA (USA) HA AUMENTADO NUESTRA VISIBILIDAD INTERNACIONAL, YA QUE NOS HA LLEVADO A ESTABLECER DOS NUEVAS COLABORACIONES CON DOS GRUPOS INDEPENDIENTES (S, SHEPPARD Y N, AQUIZU) EN DOS PROYECTOS DIFERENTES SOBRE MECANISMOS PATOGENICOS ASOCIADOS A LOS REGULADORES EPIGENETICOS, VARIANTES PATOGENICAS\IMPACTO MOLECULAR\DIAGNOSTICO MOLECULAR\NEXT-GENERATION SEQUENCING\GENOMICA\SECUENCIA PROTEINAS\ENTORNO GENETICO\COSTE CLINICO ver más
01/01/2019
FUNDACIO HOSPITAL...
133K€
Perfil tecnológico estimado

Línea de financiación: concedida

El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2019-01-01
Presupuesto El presupuesto total del proyecto asciende a 133K€
Líder del proyecto
FUNDACIO HOSPITAL UNIVERSITARI VALL HEBRON -... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.
Perfil tecnológico TRL 4-5 33M