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BFU2013-48282-C2-1-P

Financiado

RNAS NO CODIFICANTES IMPLICADOS EN LA ADAPTACION AL ESTRES DE NITROGENO Y LA DIF...

RNAS NO CODIFICANTES IMPLICADOS EN LA ADAPTACION AL ESTRES DE NITROGENO Y LA DIFERENCIACION CELULAR EN CIANOBACTERIAS LA INVESTIGACION SOBRE LOS RNAS REGULADORES NO CODIFICANTES SE HA DISPARADO EN LOS ULTIMOS AÑOS Y ESTA BIEN ESTABLECIDO QUE LOS PEQUEÑOS RNAS BACTERIANOS (SRNAS) SON IMPORTANTES REGULADORES POST-TRANSCRIPCIONALES CUYAS FUNCIONES N... ver más

01/01/2013

CSIC

157K€

Presupuesto del proyecto: 157K€

Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2013-01-01

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Participantes

CSIC

Lider

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Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA...

TRL 2-3 | 552M€

Presupuesto del proyecto 157K€

Descripción del proyecto LA INVESTIGACION SOBRE LOS RNAS REGULADORES NO CODIFICANTES SE HA DISPARADO EN LOS ULTIMOS AÑOS Y ESTA BIEN ESTABLECIDO QUE LOS PEQUEÑOS RNAS BACTERIANOS (SRNAS) SON IMPORTANTES REGULADORES POST-TRANSCRIPCIONALES CUYAS FUNCIONES NO PUEDEN IGNORARSE EN NINGUN ORGANISMO, LOS SRNAS PARTICIPAN EN PROCESOS DE REGULACION QUE AFECTAN A TODOS LOS ASPECTOS DE LA FISIOLOGIA BACTERIANA, INCLUIDA LA ADAPTACION AL ESTRES O LA VIRULENCIA,LAS CIANOBACTERIAS SON UN GRUPO DE ORGANISMOS FOTOSINTETICOS ADAPTADOS A CASI TODOS LOS AMBIENTES, TIENEN REQUERIMIENTOS NUTRICIONALES MUY REDUCIDOS Y SON VERSATILES Y FACILMENTE ADAPTABLES A CAMBIOS DE LUZ, DISPONIBILIDAD DE NUTRIENTES, ETC, ADEMAS, LAS CIANOBACTERIAS FILAMENTOSAS ESTAN ENTRE LOS POCOS PROCARIOTAS QUE LLEVAN A CABO PROCESOS DE DIFERENCIACION CELULAR CONDUCENTES A LA ADAPTACION AL ESTRES NUTRICIONAL O AMBIENTAL, ESTOS PROCESOS DE ADAPTACION SE BASAN EN EL ESTABLECIMIENTO DE PATRONES DE EXPRESION GENICA DIFERENCIAL, EN OCASIONES RESTRINGIDOS A CELULAS ESPECIFICAS EN LOS FILAMENTOS,ESTAMOS INTERESADOS EN ANALIZAR LA POSIBLE IMPLICACION DE SRNAS EN LA REGULACION DE LOS PROGRAMAS DE TRANSCRIPCION IMPLICADOS EN LA ADAPTACION AL MEDIO AMBIENTE, Y ESPECIALMENTE EN LA DIFERENCIACION DE HETEROCISTOS (UN TIPO DE CELULA ESPECIALIZADA EN LA FIJACION DEL NITROGENO ATMOSFERICO), USANDO COMO MODELO LA CIANOBACTERIA FORMADORA DE HETEROCISTOS ANABAENA SP, PCC 7120, CON ESE FIN, Y EN EL CONTEXTO DE NUESTRO PROYECTO ACTUAL (BFU2010 - 14821), YA HEMOS LLEVADO A CABO UNA APROXIMACION DE RNA-SEQ PARA EL ANALISIS DEL TRANSCRIPTOMA DE ANABAENA, LA ESTRATEGIA DE RNA-SEQ APLICADA PERMITIO IDENTIFICAR LOS SITIOS DE INICIO DE TRANSCRIPCION DE TODO EL GENOMA Y DISCRIMINAR LOS CAMBIOS TRANSCRIPCIONALES RELACIONADOS CON EL ESTRES DE NITROGENO DE LOS ESPECIFICAMENTE INHERENTES A LA DIFERENCIACION DE HETEROCISTOS, HEMOS ELEGIDO PARA SU ANALISIS VARIOS SRNAS CUYA TRANSCRIPCION ESTA REGULADA EN FUNCION DE LA DISPONIBILIDAD DE NITROGENO COMBINADO Y PUEDEN POR TANTO ESTAR RELACIONADOS CON LA REGULACION DE LA ADAPTACION AL ESTRES DE NITROGENO Y/O LA DIFERENCIACION DE HETEROCISTOS,LAS RESPUESTAS DE LAS CIANOBACTERIAS AL ESTRES DE NITROGENO ESTAN CONTROLADAS POR NTCA, UN REGULADOR TRANSCRIPCIONAL DE TIPO CRP, PENSAMOS QUE, TAL COMO OCURRE EN EL CASO DE OTRAS PROTEINAS DE LA FAMILIA CRP/FNR, NTCA PODRIA REGULAR INDIRECTAMENTE CIERTOS TRANSCRITOS QUE RESPONDEN AL NITROGENO A TRAVES DE LA PARTICIPACION DE SRNAS REGULADOS POR NTCA, LA DIFERENCIACION DE HETEROCISTOS, QUE TAMBIEN SE INDUCE EN RESPUESTA AL DEFICIT DE NITROGENO Y EN ULTIMA INSTANCIA ESTA CONTROLADA POR NTCA, IMPLICA UN PROGRAMA TRANSCRIPCIONAL ESPECIFICO DE LOS HETEROCISTOS QUE ESTA REGULADO POR HETR, POR TANTO, HIPOTETIZAMOS QUE LOS SRNAS REGULADOS POR HETR PUEDAN ESTAR IMPLICADOS EN LA DIFERENCIACION, ESTA PROPUESTA SE CENTRA EN EL ESTUDIO DE LAS POSIBLES FUNCIONES DE VARIOS SRNAS REGULADOS POR NTCA Y/O DEPENDIENTES DE HETR QUE YA HEMOS SELECCIONADO EN BASE A SU PERFIL DE EXPRESION Y EN LA IDENTIFICACION DE SUS BLANCOS Y MECANISMOS DE ACCION MEDIANTE UNA COMBINACION DE ENFOQUES BIOINFORMATICOS Y EXPERIMENTALES,POR ULTIMO, CON EL ANALISIS FILOGENETICO COMPARATIVO DE PROMOTORES QUE DIRIGEN LA TRANSCRIPCION DE SRNAS REGULADOS POR NITROGENO ESPERAMOS IDENTIFICAR Y CARACTERIZAR NUEVOS MOTIVOS DE SECUENCIA CONSERVADA IMPLICADOS EN LOS MECANISMOS MOLECULARES QUE OPERAN LA TRANSCRIPCION EN RESPUESTA A LA DISPONIBILIDAD DE NITROGENO Y/O ESPECIFICA DEL HETEROCISTO, RNAS NO CODIFICANTES\ RNAS REGULATORIOS\ RNAS PEQUEÑOS\ DIFERENCIACIÓN CELULAR\ HETEROCISTO\ CIANOBACTERIA\ ESTRÉS DE NITRÓGENO

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