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BFU2013-48282-C2-2-P

Financiado

REGULACION POR RNAS NO CODIFICANTES DE LA ADAPTACION A ESTRES ABIOTICO EN EL SIM...

REGULACION POR RNAS NO CODIFICANTES DE LA ADAPTACION A ESTRES ABIOTICO EN EL SIMBIONTE DE LEGUMINOSAS SINORHIZOBIUM MELILOTI LOS PEQUEÑOS RNAS NO CODIFICANTES (SRNAS) HAN EMERGIDO COMO REGULADORES POST-TRANSCRIPCIONALES UBICUOS CUYA ACTIVIDAD SUBYACE A VIRTUALMENTE TODA REPROGRAMACION DE LA EXPRESION GENICA RELACIONADA CON LA ADAPTACION Y EL DESARROLLO... ver más

01/01/2013

CSIC

121K€

Presupuesto del proyecto: 121K€

Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2013-01-01

0% 100%

Participantes

CSIC

Lider

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Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA...

TRL 2-3 | 552M€

Presupuesto del proyecto 121K€

Descripción del proyecto LOS PEQUEÑOS RNAS NO CODIFICANTES (SRNAS) HAN EMERGIDO COMO REGULADORES POST-TRANSCRIPCIONALES UBICUOS CUYA ACTIVIDAD SUBYACE A VIRTUALMENTE TODA REPROGRAMACION DE LA EXPRESION GENICA RELACIONADA CON LA ADAPTACION Y EL DESARROLLO EN BACTERIAS,LOS RIZOBIOS SON UN GRUPO DE BACTERIAS DEL SUELO CONOCIDOS POR SU CAPACIDAD PARA ESTABLECER SIMBIOSIS FIJADORAS DE NITROGENO CON LAS PLANTAS LEGUMINOSAS, SU TRANSICION DESDE UN ESTADO COMPETITIVO DE VIDA LIBRE EN EL SUELO A SU RESIDENCIA INTRACELULAR FINAL COMO BACTEROIDES MADUROS EN LOS NODULOS QUE INDUCEN EN LAS RAICES DE SUS LEGUMINOSAS HUESPED DEMANDA UNA FLEXIBILIDAD ADAPTATIVA NOTABLE, QUE HASTA AHORA HA SIDO CASI EXCLUSIVAMENTE ESTUDIADA DESDE LA PERSPECTIVA DE LA REGULACION TRANSCRIPCIONAL MEDIADA POR PROTEINAS,ESTE PROYECTO PRETENDE CARACTERIZAR SRNAS Y PROCESOS REGULADOS POR SRNAS PROBABLEMENTE IMPLICADOS EN LA ADAPTACION A ESTRESES ABIOTICOS QUE SE SABE COMPROMETEN LA COMPETITIVIDAD POR LA NODULACION Y EL RENDIMIENTO SIMBIOTICO GLOBAL DE ESTAS BACTERIAS, UTILIZANDO COMO MODELO EXPERIMENTAL SINORHIZOBIUM MELILOTI, LA ESTRUCTURA DEL RNOMA NO CODIFICANTE DE S, MELILOTI HA SIDO PREVIAMENTE ESTABLECIDA MEDIANTE TRANSCRIPTOMICA POR RNA-SEQ DE BACTERIAS SOMETIDAS A DIFERENTES ESTRESES Y CONDICIONES DE CULTIVO, ESTOS ESTUDIOS JUNTO A TRABAJO PRELIMINAR EN NUESTRO LABORATORIO HAN APORTADO LOS PRIMEROS DATOS FUNCIONALES SOBRE UN CONJUNTO DE SRNAS QUE HAN SIDO SELECCIONADOS PARA UNA CARACTERIZACION MAS DETALLADA, ESPECIFICAMENTE EN ESTE PROYECTO SE ABORDARA EL ESTUDIO DE LA FUNCION DE TRES SRNAS CUYA CARACTERIZACION ESTA YA EN CURSO EN NUESTRO LABORATORIO, DOS DE ELLOS (ABCR2 Y SMELC205) SE UNEN A LA PROTEINA HFQ, UNA CHAPERONA DE RNA MUY CONSERVADA FILOGENETICAMENTE QUE ES REQUERIDA PARA LA ACTIVIDAD DE LA MAYORIA DE LOS SRNAS MEJOR CARACTERIZADOS EN BACTERIAS GRAM-NEGATIVAS, LA EXPRESION DE ABCR2 Y SMELC205 ASI COMO LOS MOTIVOS PREDICHOS EN SUS RESPECTIVOS PROMOTORES SUGIEREN QUE FORMAN PARTE DE LOS REGULONES DE RPOH Y RPOE2, RESPETIVAMENTE, QUE SON LOS FACTORES SIGMA MAYORITARIAMENTE IMPLICADOS EN LAS RESPUESTAS DE ADAPTACION AL ESTRES GENERAL (FASE ESTACIONARIA) ASI COMO A LOS CHOQUES HIPEROSMOTICO Y TERMICO EN S, MELILOTI, EL TERCER SRNA (SMR14C2) ES INDEPENDIENTE DE HFQ Y SE ACUMULA PREFERENTEMENTE EN RESPUESTA AL CHOQUE OSMOTICO Y EN BACTERIAS ENDOSIMBIOTICAS (I,E, NODULO),LA FUNCION DE ESTOS SRNAS SERA VALORADA DESDE UNA PERSPECTIVA PAN-GENOMICA MAS QUE EN EL CONTEXTO DE LOS GENOMAS DE CEPAS INDIVIDUALES, POR ELLO, CADA SRNA SERA INVESTIGADO INDEPENDIENTEMENTE EN SENDAS CEPAS DE S, MELILOTI DE SECUENCIA GENOMICA CONOCIDA CON LOS SIGUIENTES OBJETIVOS ESPECIFICOS: I) ANALISIS DE SU REGULACION TRANSCRIPCIONAL EN BACTERIAS EN VIDA LIBRE Y ENDOSIMBIOTICAS; II) CARACTERIZACION DE LOS FENOTIPOS ASOCIADOS A SU ACTIVIDAD, DISECCION DE SUS REGULONES Y VALORACION DE LA POSIBLE INTERACCION MEDIADA POR LOS SRNAS ENTRE LAS FRACCIONES DEL GENOMA COMPARTIDO (I,E, CORE) Y ACCESORIO DE S, MELILOTI, III) IDENTIFICACION DE LOS MRNA DIANA Y DISECCION DE LOS APAREAMIENTOS IMPLICADOS EN LA RIBOREGULACION; Y IV) IDENTIFICACION DE NUEVAS PROTEINAS ASOCIADAS A LA ACTIVIDAD DE LOS SRNAS EN S, MELILOTI, UTILIZANDO SMR14C2 COMO CEBO, FIJACIÓN DE NITRÓGENO\ SIMBIOSIS\ RHIZOBIA\ SRNAS BACTERIANOS\ RNA NO CODIFICANTE\ RNA REGULADOR\ CHAPERONA DE RNA\ ESTRÉS ABIÓTICO\ REGULACIÓN POST-TRANSCRIPCIONAL

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