SCREENING DE ALTO RENDIMIENTO Y ANALISIS FUNCIONAL DE RNAS ANTISENTIDO CON NUEVA...
SCREENING DE ALTO RENDIMIENTO Y ANALISIS FUNCIONAL DE RNAS ANTISENTIDO CON NUEVAS FUNCIONES EN LAS RESPUESTAS FRENTE AL STRESS EN ESCHERICHIA COLI
LA UBICUIDAD DE LOS MICROORGANISMOS ESTA MAYORITARIAMENTE ASOCIADA CON SUS HABILIDADES ESPECIALES PARA ADAPTARSE Y SOBREVIVIR BAJO AMBIENTES ADVERSOS. ESTUDIOS RECIENTES HAN REVELADO LA EXISTENCIA DE UNA NUEVA CLASE DE PEQUEÑOS RN...
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Financiación
concedida
El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto
el día 2011-01-01
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Descripción del proyecto
LA UBICUIDAD DE LOS MICROORGANISMOS ESTA MAYORITARIAMENTE ASOCIADA CON SUS HABILIDADES ESPECIALES PARA ADAPTARSE Y SOBREVIVIR BAJO AMBIENTES ADVERSOS. ESTUDIOS RECIENTES HAN REVELADO LA EXISTENCIA DE UNA NUEVA CLASE DE PEQUEÑOS RNAS ANTISENTIDO (SRNAS) QUE TIENEN UN PAPEL CLAVE EN LOS MECANISMOS DE REGULACION PERMITIENDO A ESCHERICHIA COLI Y OTRAS BACTERIAS (INCLUYENDO ALGUNOS GENEROS DE ENTEROBACTERIAS PATOGENAS) ADAPTARSE A SITUACIONES DE STRESS MEDIOAMBIENTAL. EL ANALISIS DE VARIOS DE ESTOS SRNAS RELACIONADOS CON EL STRESS HAN DEMOSTRADO QUE PUEDEN EJERCER SUS FUNCIONES REGULADORAS MEDIANTE APAREAMIENTO DE BASES CON SUS MRNAS DIANA PARA ALTERAR LA TRADUCCION Y LA ESTABILIDAD DEL ARNM DE UNA MANERA DEPENDIENTE DE HFQ.DADAS LAS FUNCIONES IMPORTANTES DE LOS SRNAS EN LA ADAPTACION BACTERIANA Y VIRULENCIA, EL PRINCIPAL OBJETIVO DE ESTE PROYECTO ES UTILIZAR UNA COMBINACION DE METODOLOGIAS BIOQUIMICAS, GENETICAS Y DE BIOLOGIA MOLECULAR DE ALTO RENDIMIENTO Y CARACTERIZAR UN GRUPO IMPORTANTE DE SRNAS IDENTIFICADOS EXPERIMENTALMENTE Y PREDICHOS POR ANALISIS IN SILICO QUE NO HAN SIDO ESTUDIADOS PREVIAMENTE. LOS OBJETIVOS ESPECIFICOS DEL PROYECTO SON: (I) CARACTERIZAR RNAS ANTISENTIDO CON NUEVOS PAPELES EN LAS RESPUESTAS BACTERIANAS AL STRESS Y (II) EXAMINAR SUS FUNCIONES REGULADORAS USANDO ESCHERICHIA COLI COMO ORGANISMO MODELO. ADEMAS, TAMBIEN SE PLANTEA (III) INVESTIGAR COMO LA FORMACION DE COMPLEJOS DE SRNA/MRNA AFECTAN EL DESTINO DE SRNAS SELECCIONADOS Y SUS DIANAS, Y DETERMINAR LA CONTRIBUCION DE LA RNA CHAPERONA HFQ Y LAS RIBONUCLEASAS CELULARES EN EL CONTROL DE LOS PASOS INICIAL Y POSTERIORES DE DESENSAMBLAJE Y PROCESAMIENTO DE ESTOS COMPLEJOS IN VIVO. LOS RESULTADOS OBTENIDOS EN EL TRANSCURSO DE ESTE ESTUDIO PROPORCIONARAN NUEVOS CONOCIMIENTOS CON RESPECTO A LA NATURALEZA Y PAPELES ESPECIFICOS DE SRNAS RELACIONADOS CON EL STRESS DURANTE LA ADAPTACION DE ESCHERICHIA COLI A AMBIENTES ADVERSOS. MEDIANTE EL ESTABLECIENDO DE RELACIONES ENTRE LOS NUEVOS MECANISMOS ANTISENTIDO CARACTERIZADOS Y OTRAS VIAS REGULADORAS USANDO APROXIMACIONES DE BIOLOGIA DE SISTEMAS Y FILOGENETICAS, SEREMOS CAPACES DE INTEGRARLOS EN LAS REDES REGULADORAS GLOBALES COORDINANDO DIFERENTES MECANISMOS DE ADAPTACION EN ESCHERICHIA COLI Y OTRAS ENTEROBACTERIAS PATOGENAS ESTRECHAMENTE RELACIONADAS. ES MAS, PREDECIMOS QUE UN NUMERO DE PROTEINAS RELACIONADAS CON EL STRESS QUEHAN DEMOSTRADO SER REGULADAS POR SRNAS CONSERVADOS EVOLUTIVAMENTE SERAN POTENCIALES DIANAS TERAPEUTICAS PARA EL DISEÑO DE FARMACOS. ONTROL POST-TRANSCRIPCIONAL\RESPUESTAS BACTERIANAS AL STRESS\ESCHERICHIA COLI\RNAS ANTISENTIDO