ANALSIS DE LA REGULACION POST-TRANCRIPCIONAL MEDIADA POR PROTEINAS DE UNION A RN...
ANALSIS DE LA REGULACION POST-TRANCRIPCIONAL MEDIADA POR PROTEINAS DE UNION A RNA EN STAPHYLOCOCCUS AUREUS
LA APLICACION DE LAS NUEVAS TECNICAS GENOMICAS DE ALTA RESOLUCION PARA EL ESTUDIO DEL TRANSCRIPTOMA DE LAS CELULAS HA REVELADO QUE LA MAYOR PARTE DEL GENOMA SE TRANSCRIBE PARA DAR LUGAR A UNA GRAN CANTIDAD DE MOLECULAS DE RNA, DIS...
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Fecha límite participación
Sin fecha límite de participación.
Financiación
concedida
El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto
el día 2011-01-01
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Descripción del proyecto
LA APLICACION DE LAS NUEVAS TECNICAS GENOMICAS DE ALTA RESOLUCION PARA EL ESTUDIO DEL TRANSCRIPTOMA DE LAS CELULAS HA REVELADO QUE LA MAYOR PARTE DEL GENOMA SE TRANSCRIBE PARA DAR LUGAR A UNA GRAN CANTIDAD DE MOLECULAS DE RNA, DISTINTAS AL MRNA, RRNA Y TRNA. ESTAS NUEVAS MOLECULAS DE RNA INCLUYEN REGIONES NO TRADUCIDAS DEL MRNA TANTO EN EL EXTREMO 5 COMO EN EL 3, MOLECULAS DE RNA ANTISENTIDOS (ASRNAS) Y MOLECULAS DE RNA QUE NO CODIFICAN PROTEINAS (NCRNA). LA PRESENCIA DE ESTAS MOLECULAS DE RNA NO ESTA RESTRINGIDA A LOS EUCARIOTAS SUPERIORES Y TAMBIEN ESTAN PRESENTES EN ORGANISMOS EUCARIOTAS UNICELULARES Y BACTERIAS. EL RECONOCIMIENTO DE LA EXISTENCIA DE ESTE NUEVO NIVEL DE REGULACION BASADO EN RNA HA PROVOCADO EL INICIO DE UNA NUEVA ERA EN EL ESTUDIO DE LA REGULACION GENICA, EN EL QUE LOS RNA REGULADORES Y LAS PROTEINAS DE UNION A DICHOS RNA JUEGAN UN PAPEL CLAVE. EN ESTE PROYECTO PROPONEMOS ESTUDIAR LA FUNCION DE LAS PROTEINAS DE UNION A RNA EN LA REGULACION POST-TRANSCRIPCIONAL DE LA BACTERIA PATOGENA STAPHYLOCOCCUS AUREUS. PARA ELLO, Y APROVECHANDO LA CAPACIDAD DE UNION A RNA DE DICHAS PROTEINAS, SE PURIFICARAN IN VIVO MEDIANTE CO-INMUNOPRECIPITACION LAS DIANAS (RNAS) DIRECTAS DE ESTAS PROTEINAS Y SE IDENTIFICARAN MEDIANTE TILING ARRAYS (RIP-ON-CHIP). TRAS VALIDAR LOS RESULTADOS MEDIANTE EXPERIMENTOS DE INTERACCION RNA-PROTEINA IN VITRO, SE CONSTRUIRAN MUTANTES DE DICHAS PROTEINAS PARA LUEGO REALIZAR ESTUDIOS TRANSCRIPTOMICOS GLOBALES QUE PERMITAN IDENTIFICAR SI LA REGULACION MEDIADA POR ELLAS SE PRODUCE A NIVEL DEL PROCESAMIENTO DEL RNA O DE LA TRADUCCION DE LAS PROTEINAS. FINALMENTE, EJEMPLOS DE INTERACCIONES RNA-PROTEINA, RELEVANTES PARA LA BIOLOGIA DE S. AUREUS, SERAN SELECCIONADOS PARA ESTUDIAR LOS MECANISMOS PRECISOS DE ESTA REGULACION POST-TRANSCRIPCIONAL MEDIANTE ESTUDIOS DE ESTABILIDAD DEL RNA, DETERMINACION DE LA ESTRUCTURA SECUNDARIA DEL RNA, VALIDACION DE LA ZONA DE UNION AL TRASCRITO (RNA FOOTPRINTING), ENSAYOS DE SINTESIS DE PROTEINAS E INHIBICION DE LA UNION DEL RIBOSOMA (TOEPRINTING), TODOS ELLOS EN PRESENCIA O AUSENCIA DE LAS PROTEINAS DE UNION A RNA. ROTEINAS DE UNION A RNA\STAPHYLOCOCCUS AUREUS\RNA REGULADORES\REGULACION POST-TRANSCRIPCIONAL