Descripción del proyecto
NUESTRO RECIENTE TRABAJO ACERCA DE LA RECONEXION DE REDES GENICAS BACTERIANAS EN NODOS GENICOS CLAVE (HUBS) ALTAMENTE CONECTADOS (ISALAN ET AL, NATURE 452:840-5, 2008) Y EL DESARROLLO DE MARCOS LOGICOS PARA ENTENDER LAS REDES GENICAS RESULTANTES (ISALAN ET AL, NATURE 458:969, 2009), NOS HA LLEVADO A CONSIDERAR QUE LAS REDES GENICAS DE CANCER HUMANO PUEDEN ESTUDIARSE DE MANERA SIMILAR, POR ELLO PROPONEMOS DESARROLLAR UN KIT DE FACTORES QUE NOS PERMITAN REMODELAR LA CONECTIVIDAD DE ALGUNOS DE LOS GENES MAS ALTAMENTE CONECTADOS EN LA RED TRANSCRIPTOMICA HUMANA, ESTOS GENES ESTAN IMPLICADOS EN MUCHAS ENFERMEDADES (INCLUYENDO EL CANCER), ESTE KIT NOS PERMITIRA DETERMINAR LA POSIBILIDAD DE EVOLUCION Y LA ROBUSTEZ DE LA RED AL RECONECTARLA, EL OBJETIVO ES CENTRARNOS EN LOS GENES RELEVANTES UTILIZANDO NUCLEASAS DE DEDOS DE ZINC, PARA MUTAR, REPARAR O INSERTAR ADN EN LOCI CROMOSOMICOS MEDIANTE RECOMBINACION HOMOLOGACOMO PUNTO DE PARTIDA, PROPONEMOS MODIFICAR LOS SIGUIENTES GENES: TBP (PROTEINA DE UNION A LA CAJA TATA), P53, P300, RXR, PRB, RELA, C-JUN, C-MYC, C-FOS Y RET, ESTOS SON ALGUNOS DE LOS GENES CENTRALES CON MAYOR CONECTIVIDAD EN LA RED DE FACTORES DE TRANSCRIPCION HUMANOS (BASE DE DATOS TRANSFAC 8,2) Y SUS MUTANTES SE ASOCIAN CON DIVERSAS ENFERMEDADES, DISEÑAREMOS Y CARACTERIZAREMOS PROTEINAS DE DEDOS DE ZINC QUE RECONOZCAN ESTAS SECUENCIAS DE ADN IN VITRO E INDUCIREMOS LA REPARACION O MUTACION GENICA IN VIVO, COMO ESTUDIO PILOTO, YA HEMOS MUTADO SATISFACTORIAMENTE EL GEN P53 Y HEMOS LOGRADO UNA REPARACION CROMOSOMICA (EN EL MARCO DE NUESTRA SUBVENCION ANTERIOR POR PARTE DEL MINISTERIO DE EDUCACION Y CIENCIA, REF,: SAF2007-61422), GLOBALMENTE, EL PROYECTO PERMITIRA LA REPARACION O MUTACION DE ONCOGENES ESPECIFICOS EN LINEAS CELULARES DE CANCER, EN EL CONTEXTO DE TODAS LAS DEMAS MUTACIONES QUE SE HAN ACUMULADO DURANTE EL PROCESO DE ONCOGENESIS, ESTO PERMITIRA CARACTERIZAR LA CONTRIBUCION DE LOS NODOS Y GENES CENTRALES DE LA RED EN LOS FENOTIPOS OBSERVADOS, POR ULTIMO, ALGUNOS DE LOS PEPTIDOS DE REPARACION GENICA QUE HEMOS GENERADO TENDRAN POTENCIAL TERAPEUTICO, ADEMAS DE PROPORCIONAR HERRAMIENTAS PARA LA BIOLOGIA DE SISTEMAS Y DE REDES,