RECODIFICACION DE GENOMAS VIRALES MEDIANTE MUTACIONES SINONIMAS COMO UNA HERRAMI...
RECODIFICACION DE GENOMAS VIRALES MEDIANTE MUTACIONES SINONIMAS COMO UNA HERRAMIENTA PARA ALTERAR LA EFICACIA BIOLOGICA DE LOS VIRUS
LOS AVANCES RECIENTES EN BIOLOGIA SINTETICA Y MANIPULACION DEL DNA HAN INCREMENTADO ENORMEMENTE NUESTRA CAPACIDAD DE MANIPULAR LOS GENOMAS VIRALES. LA RECODIFICACION SINONIMA (I.E. INTRODUCCION DE MULTIPLES SUSTITUCIONES DE NUCLEO...
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Financiación
concedida
El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto
el día 2016-01-01
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Descripción del proyecto
LOS AVANCES RECIENTES EN BIOLOGIA SINTETICA Y MANIPULACION DEL DNA HAN INCREMENTADO ENORMEMENTE NUESTRA CAPACIDAD DE MANIPULAR LOS GENOMAS VIRALES. LA RECODIFICACION SINONIMA (I.E. INTRODUCCION DE MULTIPLES SUSTITUCIONES DE NUCLEOTIDO QUE NO MODIFICAN LA SECUENCIA DE AMINOACIDOS DE UNA PROTEINA) DE LOS GENOMAS VIRALES ES UN NUEVO METODO QUE PERMITE LA GENERACION DE VIRUS CON FENOTIPOS ALTERADOS. LA INTRODUCCION DE NUMEROSAS SUBSTITUCIONES SINONIMAS EN DIVERSOS GENOMAS VIRALES HA PERMITIDO LA PRODUCCION DE ESTIRPES ATENUADAS DE DIFERENTES VIRUS RNA (E.G. POLIOVIRUS, VIRUS DE LA GRIPE, VIRUS RESPIRATORIO SINCITIAL, VIRUS DE LA INMUNODEFICIENCIA HUMANA Y DE SIMIOS, VIRUS CHIKUNGUNYA, VIRUS DENGUE, ECHOVIRUS 7, VIRUS DE LAS ESTOMATITIS VESICULAR, VIRUS DEL SINDROME REPRODUCTIVO Y RESPIRATORIO PORCINO, VIRUS DE LA ENCEFALITIS POR GARRAPATAS). LA RECODIFICACION SINONIMA DE GENOMAS VIRALES TAMBIEN HA PERMITIDO INVESTIGAR DIVERSOS ASPECTOS DE LA BIOLOGIA DE LOS VIRUS COMO SON LAS INTERACCIONES CON EL SISTEMA INMUNE INNATO DEL HOSPEDADOR, LA IDENTIFICACION DE ESTRUCTURAS FUNCIONALES EN LOS GENOMAS VIRALES, LA REGULACION DE LA EXPRESION TEMPORAL DE LOS GENES VIRALES ASI COMO LA ROBUSTEZ MUTACIONAL Y ADAPTABILIDAD DE LOS VIRUS RNA. A PESAR DE LOS AVANCES LOGRADOS EN ESTE AREA DE INVESTIGACION, MUCHAS CUESTIONES PERMANECEN AUN POR RESOLVER, ENTRE LA QUE DESTACA EL MECANISMO POR EL CUAL LOS CAMBIOS DE NUCLEOTIDO SINONIMOS AFECTAN EL FENOTIPO VIRAL. EN ESTE PROYECTO NOS PROPONEMOS ESTUDIAR: (I) PORQUE UNOS CODONES O PARES DE CODONES ESTAN SOBRERREPRESENTADOS O SUBREPRESENTADOS EN EL GENOMA DEL VIRUS DE LA INMUNODEFICIENCIA HUMANA DE TIPO 1 (VIH-1), (II) CUAL ES EL MECANISMO RESPONSABLE DE LA ATENUACION VIRAL (E.G. TRADUCCION DE PROTEINAS, INTERACCION CON EL SISTEMA INNATO CELULAR). DEBIDO A QUE LOS VIRUS RNA Y EN CONCRETO EL VIH-1 SON AGENTES ALTAMENTE MUTABLES Y ADAPTABLES, TAMBIEN PLANTEAMOS EXPLORAR SI ES POSIBLE GENERAR UN VIRUS ATENUADO QUE NO PUEDA REVERTIR SU FENOTIPO. A LA FINALIZACION DE NUESTRO PROYECTO PROPORCIONAREMOS UN CONOCIMIENTO FUNDAMENTAL ACERCA DEL MECANISMO SUBYACENTE A LA CONTRIBUCION DE LAS SUBSTITUCIONES SINONIMAS AL FENOTIPO VIRAL. DILUCIDAR ESTE MECANISMO ES UNA MAXIMA PRIORIDAD SI QUEREMOS UTILIZAR LAS SUBSTITUCIONES SINONIMAS EN DIFERENTES CONTEXTOS BIOLOGICOS Y CLINICOS. IRUS\PATOGÉNESIS\INMUNIDAD INNATA\TRADUCCIÓN\EVOLUCIÓN\ATENUACIÓN\MUTACIONES SINÓNIMAS\VIH-1