Descripción del proyecto
LA INVESTIGACION BIOLOGICA SIEMPRE HA HECHO USO DE SISTEMAS MODELO. ASI, NUESTRA COMPRENSION DEL DESARROLLO HUMANO SE BASA EN EXPERIMENTOS QUE UTILIZAN LA MOSCA DE LA FRUTA O GUSANOS; Y EL DESCUBRIMIENTO SOBRE COMO NUESTROS HIJOS HEREDAN NUESTROS GENES SURGIO DE EXPERIMENTOS CON GUISANTES. MODELOS COMO ESTOS SON MUY VALIOSOS PORQUE INCORPORAN LOS PRINCIPIOS DE SISTEMAS MAS SOFISTICADOS, PERO SON MAS ASEQUIBLES EXPERIMENTALMENTE Y MUCHO MENOS COMPLICADOS. ESTO PERMITE, MEDIANTE EXPERIMENTOS QUE DE OTRO MODO SERIAN PRACTICAMENTE INVIABLES, IDENTIFICAR PRINCIPIOS UNIVERSALES QUE OPERAN EN TODOS LOS NIVELES DE LA BIOLOGIA. LA MISMA PREMISA SE APLICA AL NIVEL DE BIOMOLECULAS INDIVIDUALES. NUESTRO INTERES AQUI ES ENCONTRAR MODELOS SIMPLES PARA EL ESTUDIO DE LAS BIOMOLECULAS CONOCIDAS COMO PROTEINAS DE MEMBRANA, QUE SON RESPONSABLES DE INNUMERABLES REACCIONES DE LA VIDA, INCLUIDA LA TRANSDUCCION DE ENERGIA, LA SEÑALIZACION INTERCELULAR, LA CAPTURA DE NUTRIENTES, LA MUERTE CELULAR O LA ENTRADA DE LOS VIRUS EN NUESTRAS CELULAS.APROXIMADAMENTE UN TERCIO DE LOS GENES EN LOS GENOMAS SECUENCIADOS CODIFICAN PROTEINAS DE MEMBRANA. EN EL CASO CONCRETO DEL GENOMA HUMANO EL 39% DE LOS 19.628 GENES QUE CODIFICAN PROTEINAS TIENEN UN PEPTIDO SEÑAL Y/O AL MENOS UNA REGION TRANSMEMBRANA (TM), LO QUE SUGIERE EL TRANSPORTE DE LA PROTEINA CORRESPONDIENTE AL EXTERIOR DE LA CELULA ATRAVESANDO LA MEMBRANA PLASMATICA (SECRECION) O SU INSERCION EN ALGUNO DE LOS SISTEMAS DE MEMBRANAS CELULARES. ADEMAS, REPRESENTAN ALREDEDOR DEL 60% DE LAS DIANAS FARMACOLOGICAS ACTUALMENTE UTILIZADAS. LA FUNCION DE LA MAYORIA DE LAS PROTEINAS DE MEMBRANA ESTA INDISOLUBLEMENTE VINCULADA AL CORRECTO EMPAQUETAMIENTO Y ENSAMBLAJE DE SUS SEGMENTOS TM MEDIANTE INTERACCIONES ESPECIFICAS. SIN EMBARGO, SU PAPEL EN LOS COMPLEJOS ESTRUCTURALES DE ORDEN SUPERIOR (ENTRE DISTINTAS PROTEINAS) HA SIDO MENOS ESTUDIADO DEBIDO A SU COMPLEJIDAD. NUESTRO LABORATORIO HA DEMOSTRADO LA IMPORTANCIA DE LAS INTERACCIONES ENTRE SEGMENTOS TM EN EL PROCESO DE MUERTE CELULAR POR APOPTOSIS Y EN LAS INTERACCIONES VIRUS-HUESPED. PARA ELLO, HEMOS SIDO PIONEROS EN ESPAÑA EN EL ESTUDIO DE INTERACCIONES ENTRE PROTEINAS CON UN SOLO SEGMENTO TM, DADO QUE REPRESENTAN EL MODELO MAS SENCILLO PARA LA DESCRIPCION DE ESTOS PROCESOS. SIN EMBARGO, LOS ASPECTOS MAS DINAMICOS DE ESTAS INTERACCIONES, ES DECIR, SU CARACTER TRANSITORIO Y REVERSIBILIDAD, HAN SIDO MUCHO MENOS EXPLORADOS POR LA COMUNIDAD CIENTIFICA, AUNQUE SUS CONSECUENCIAS FUNCIONALES SON CIERTAMENTE IMPORTANTES Y EL FOCO DE LA PRESENTE PROPUESTA. COMPRENDER COMO UNA CADENA DE AMINOACIDOS SE PLIEGA CORRECTAMENTE, SE INTEGRA EN LA BICAPA LIPIDICA Y COMO INTERACTUA CON OTRAS PROTEINAS ES, POR TANTO, UN PROBLEMA IMPORTANTE A RESOLVER, Y NO SOLO POR PURA CURIOSIDAD. EL PRESENTE PROYECTO SE BASA EN LA EXPERIENCIA PREVIA DE LOS MIEMBROS DEL GRUPO DE INVESTIGACION Y TRATA DE COMPRENDER EN PRIMER LUGAR COMO LAS SECUENCIAS DE POLIPEPTIDOS SE ASOCIAN EN LA SUPERFICIE DE LA MEMBRANA Y, A CONTINUACION, ESTABLECER LOS DETALLES MOLECULARES QUE GOBIERNAN LAS INTERACCIONES ENTRE LOS SEGMENTOS TM CON EL OBJETIVO DE PODER MODULARLAS. LOS MODELOS ELEGIDOS SON DOS PROBLEMAS BIOLOGICOS RELEVANTES Y DE GRAN ACTUALIDAD, COMO SON, LAS INTERACCIONES ENTRE PROTEINAS APOPTOTICAS DE LA FAMILIA BCL2 Y LAS INTERACCIONES ENTRE LAS DIFERENTES PROTEINAS DE LA ENVUELTA DEL SARS-COV-2 (AGENTE CAUSANTE DE LA ACTUAL PANDEMIA COVID19), EN AMBOS CASOS EN EL ENTORNO DE LA MEMBRANA. ROTEINAS DE MEMBRANA\COVID19\MEMBRANA LIPIDICA\SARS-COV-2 ENVUELTA\PROTEINAS BCL2\APOPTOSIS\ESCALA HIDROFOBICIDAD\TRANSLOCON\INTERFASE