Descripción del proyecto
EL SEGUIMIENTO DE LA VARIACION EVOLUTIVA ENTRE MAQUINARIAS PROTEICAS BASANDOSE EN LA HETEROGENEIDAD MECANISTICA DE SUS SISTEMAS BIOLOGICOS ES UNA APROXIMACION NO CONVENCIONAL QUE VA MAS ALLA DE LAS TRADICIONALES COMPARACIONES DE SECUENCIA Y DE ESTRUCTURA ENTRE PROTEINAS, UN MECANISMO ESCASAMENTE COMPRENDIDO PERO ESENCIAL Y FASCINANTE, EL CUAL NO HA ATRAIDO MUCHO LA ATENCION DEBIDO A LA AUSENCIA DE INFORMACION EXPERIMENTAL, ES LA MADURACION DE LAS PROTEINAS DE LA MEMBRANA EXTERNA (OMPS), LA BIOGENESIS DE LAS OMP ES UN COMPLEJO Y SOFISTICADO PROCESO COMPUESTO POR MUCHOS PASOS, A TRAVES DEL CUAL UNA PREPROTEINA EN UNA FORMA UNIDA A CHAPERONA, ES DIRIGIDA AL COMPLEJO INSERTASA, SE TRANSFIERE AL MISMO, Y ES PLEGADA EN ESTE ANDAMIO ANTES DE SER LIBERADA EN LA MEMBRANA COMO UNA PROTEINA ACTIVA, ESTE MECANISMO ES SORPRENDENTE, YA QUE LAS PROTEINAS SON TRANSLOCADAS Y PLEGADAS EN AUSENCIA DE ENERGIA, LAS BASES MECANISTICAS DESARROLLADAS EN LAS ANTIGUAS BACTERIAS HAN SIDO CONSERVADAS A TRAVES DE LA EVOLUCION Y SE MANTIENEN DE IGUAL MODO EN LOS ORGANULOS EUCARIOTICOS TRAS LA ENDOSIMBIOSIS, ESTE ES UN PROCESO APASIONANTE PARA ESTUDIARLO YA QUE FUNCIONALMENTE COMBINA UN COMPLEJO PROTEICO, FORMADO POR UN RECEPTOR ESENCIAL Y CONSERVADO DE LA SUPERFAMILIA OMP85, CON PROTEINAS ADAPTADORAS DIVERGENTES EN LA PERIFERIA DE LOS COMPLEJOS INSERTASA, EN MITOCONDRIA, EL COMPLEJO DE INSERCION ES CONOCIDO COMO LA MAQUINARIA DE CLASIFICACION Y ENSAMBLAJE (SAM), MIENTRAS QUE EN BACTERIA EL EQUIVALENTE FUNCIONAL ES UNA MAQUINARIA DE ENSAMBLAJE EN BARRIL BETA (BAM), COMO OBJETIVO FINAL, NUESTRAS INVESTIGACIONES PRETENDEN SUMINISTRAR LA DESCRIPCION DE UN MECANISMO DETALLADO DE LOS PRINCIPIOS QUE GOBIERNAN LA BIOGENESIS DE LAS OMP, UN PROCESO UBICUO EN LA NATURALEZA, SIN EMBARGO, NUESTRA PROPUESTA VA MAS ALLA AL PRETENDER ESTUDIAR LOS MECANISMOS DE LOS COMPLEJOS INSERTASA DE BACTERIAS Y MITOCONDRIAS, MEDIANTE UN ENFOQUE PARALELO DESTINADO A DESENTRAÑAR LOS MECANISMOS EN ESOS SISTEMAS DIVERGENTES, PODEMOS TRAZAR UNA EVOLUCION MECANISTICA INSPIRADA EN LA TRANSICION DESDE PROCARIOTAS A ORGANULOS, DADA LA AMPLIA DISTRIBUCION QUE SUBYACE EN LAS ARQUITECTURAS PROTEICAS CONSERVADAS DESDE BACTERIA A HUMANO, EL ENTENDIMIENTO DE SUS MECANISMOS ESPECIFICOS SERIA UN DESCUBRIMIENTO REVOLUCIONARIO EN LA BIOLOGIA CELULAR,DEBIDO A SU NATURALEZA ESENCIAL, EL ESTUDIO DE LA ESTRUCTURA Y MECANISMOS DEL COMPLEJO BAM EN BACTERIAS GRAM-NEGATIVAS TIENE FUERTES IMPLICACIONES PARA ESTUDIOS FARMACOLOGICOS, LA ASOCIACION ENTRE ESTE COMPLEJO Y LA PATOGENICIDAD DE BACTERIAS PUEDE CONDUCIR AL DESARROLLO DE PEQUEÑAS MOLECULAS QUE BLOQUEEN ESTOS PROCESOS, AYUDANDO ASI AL TRATAMIENTO DE LAS ENFERMEDADES INFECCIOSAS, ADEMAS DE USAR LOS RESULTADOS PROVENIENTES DE LA BIOLOGIA ESTRUCTURAL COMO BASE DE NUESTRO TRABAJO, ESTA PROPUESTA DEPENDE FUERTEMENTE DE UNA VARIEDAD DE METODOS, INCLUYENDO TECNICAS BIOINFORMATICAS, MICROBIOLOGICAS, BIOQUIMICAS Y BIOFISICAS, PARA LLEGAR A UNA COMPRENSION PROFUNDA DE LA FUNCION PROTEICA, EN LOS SIGUIENTES PASOS, EL DOCKING DE PEQUEÑAS MOLECULAS Y LA IMPLEMENTACION DE PRUEBAS PARA MEDIR LA EFECTIVIDAD PODRIAN AYUDAR A IDENTIFICAR MOLECULAS CUYA DIANA SEAN LOS ANDAMIOS ESENCIALES BAMA Y BAMD,LA CARACTERIZACION DE BAM ESTA TAMBIEN RELACIONADA CON LA INVESTIGACION TRANSLACIONAL Y PRESENTA FUERTES IMPLICACIONES EN EL DESARROLLO DE NUEVOS ANTIBIOTICOS, EL EMPLEO DE LAS INTERACCIONES PROTEINA-PROTEINA DE ENZIMAS CELULARES ESENCIALES ES UNA NUEVA APROXIMACION PARA EL DESAR OUTER MEMBRANE\ PROTEIN BIOGENESIS\ STRUCTURE BIOLOGY\ BIOCHEMISTRY\ MEMBRANE PROTEINS\ ANTIBIOTICS