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BIO2010-15683

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NUEVOS METODOS DE RMN Y NUEVOS CONCEPTOS PARA EL ESTUDIO DE BIOMOLECULAS CON INT...

NUEVOS METODOS DE RMN Y NUEVOS CONCEPTOS PARA EL ESTUDIO DE BIOMOLECULAS CON INTERACCIONES DINAMICAS IMPLICADAS EN LA SEÑALIZACION LA ADAPTACION DE LAS CELULAS A SU ENTORNO SE LLEVA A CABO MEDIANTE REDES DE REGULACION QUE IMPLICAN INTERACCIONES DINAMICAS ENTRE NUMEROSAS PROTEINAS, EL INCREMENTO DE COMPLEJIDAD DE LOS ORGANISMOS SUPERIORES IMPONE UNAS DEMANDAS... ver más

01/01/2010

303K€

Presupuesto del proyecto: 303K€

Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE BARCELONA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 328

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2010-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE BARCELONA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 328

Presupuesto del proyecto 303K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto LA ADAPTACION DE LAS CELULAS A SU ENTORNO SE LLEVA A CABO MEDIANTE REDES DE REGULACION QUE IMPLICAN INTERACCIONES DINAMICAS ENTRE NUMEROSAS PROTEINAS, EL INCREMENTO DE COMPLEJIDAD DE LOS ORGANISMOS SUPERIORES IMPONE UNAS DEMANDAS DE REGULACION QUE NO PUEDEN SUSTENTARSE SIMPLEMENTE AUMENTANDO EL NUMERO DE PROTEINAS IMPLICADAS, PARA RESPONDER A ESTAS DEMANDAS, LAS PROTEINAS QUE PARTICIPAN EN REDES DE REGULACION TIENEN QUE POSEER UNAS CARACTERISTICAS ESTRUCTURALES Y DINAMICAS ESPECIALES, NUESTRA ESTRATEGIA PARA IDENTIFICAR DICHAS CARACTERISTICAS Y ENTENDER LA FORMA COMO PARTICIPAN EN LOS MECANISMOS DE REGULACION, SE BASA EN EL PRINCIPIO DE LA PERTURBACION DIFERENCIAL, ESTA ESTRATEGIA PROPONE EL ESTUDIO COMPARADO DE LA ESTRUCTURA Y LA DINAMICA DE SISTEMAS MUY SIMILARES PERO QUE DAN LUGAR A RESPUESTAS MUY DIFERENTES, EN NUESTRO CASO, DICHO ESTUDIO SE LLEVA A CABO DE FORMA PREDOMINANTE POR RMN EN COMBINACION CON OTRAS TECNICAS ESTRUCTURALES Y HERRAMIENTAS DE MODELADO,LAS PROTEINAS INTRINSECAMENTE DESORDENADAS SON UNA CARACTERISTICA DISTINTIVA DE MUCHAS PROTEINAS EUCARIOTAS IMPLICADAS EN VIAS DE SEÑALIZACION, EN ESTE PROYECTO ESTUDIAREMOS LOSL DOMINIOS UNICO DE QUINASAS DE LA FAMILIA SRC (SFK), QUE SON INTRINSECAMENTE DESORDENADOS, LA C-SRC DA NOMBRE Y ES EL PARADIGMA DE LAS SFKS, DICHA FAMILIA ES ESTRUCTURALMENTE MUY HOMOGENEA, SIN EMBARGO, PARTICIPA EN UN GRAN NUMERO DE VIAS DE SEÑALIZACION DISTINTAS, LA PRINCIPAL DIFERENCIA ENTRE SFKS RESIDE EN EL DOMINIO UNICO, LA DESREGULACION DE SFKS ESTA ASOCIADA A CANCER Y A ENFERMEDADES CARDIOVASCULARES,LAS ENTEROBACTERIAS TIENEN LA CAPACIDAD DE SILENCIAR SELECTIVAMENTE LOS GENES DE TRANSMISION HORIZONTAL MEDIANTE UNA VARIANTE PLASMIDICA DE LA PROTEINA H-NS, LA FORMA CROMOSOMICA DE H-NS NO PRESENTA DICHA SELECTIVIDAD, A PESAR DE QUE AMBAS PROTEINAS SON MUY PARECIDAS, DICHO SISTEMA ES ADECUADO PARA LA APLICACION DEL PRINCIPIO DE PERTURBACION DIFERENCIAL, LA FORMA CROMOSOMICA PUEDE ADQUIRIR SELECTIVIDAD CON LA AYUDA DE UN CO-REGULADOR, LA PROTEINA HHA, AMBAS VARIANTES DE H-NS FORMAN OLIGOMEROS QUE INTERACCIONAN CON ADN CURVADO Y REPRIMEN GENES RELACIONADOS CON LA PATOGENICIDAD, EN EL PROYECTO SE ESTUDIARAN OTRAS PROTEINAS ASOCIADAS A PATOGENICIDAD BACTERIANA: LER (ACTIVADORA DE ALGUNOS GENES REPRIMIDOS POR H-NS) Y YMOB (PARALOGO DE YBAJ QUE FORMA UN PAR TOXINA-ANTITOXINA CON HHA Y ESTA IMPLICADO EN LA FORMACION DE BIOFILMS),EN EL MARCO DE UNA RED DE COLABORACIONES INTERNACIONALES, SE APLICARAN Y DESARROLLARAN METODOS CONVENCIONALES Y NO-CONVENCIONALES DE RMN (RMN DE ESTADO SOLIDO, RMN-ELECTROFORESIS, POLARIZACION NUCLEAR DINAMICA) PARA EL ESTUDIO DE LOS SISTEMAS ANTES MENCIONADOS, NUESTRA APROXIMACION MULTIDISCIPLINAR INCLUIRA TAMBIEN METODOS DE BIOLOGIA MOLECULAR Y CELULAR, OTRAS TECNICAS BIOFISICAS, METODOS COMPUTACIONALES Y NUEVOS CONCEPTOS COMO EL ANALISIS DE REDES EN EL ESPACIO QUIMICO PARA EXTRAER RELACIONES ENTRE CONJUNTOS DE PROTEINAS O PEQUEÑAS MOLECULAS,EN EL PROYECTO SE PRETENDE DESENTRAÑAR LOS DETALLES ESTRUCTURALES Y DINAMICOS DE LOS SISTEMAS ELEGIDOS Y, AL MISMO TIEMPO, DESARROLLAR CONCEPTOS GENERALES Y METODOS PARA EL ESTUDIO DE PROTEINAS IMPLICADAS EN VIAS DE SEÑALIZACION QUE CONSTITUYEN POSIBLES DIANAS TERAPEUTICAS,

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