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PID2019-109395GB-I00

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NUEVAS HERRAMIENTAS STD NMR PARA OBTENER ESTRUCTURAS 3D DE COMPLEJOS PROTEINA-LI...

NUEVAS HERRAMIENTAS STD NMR PARA OBTENER ESTRUCTURAS 3D DE COMPLEJOS PROTEINA-LIGANDO DEBILES: APLICACION A INTERACCIONES PROTEINA-CARBOHIDRATO BIOLOGICAMENTE RELEVANTES LAS ESTRUCTURAS DE COMPLEJOS PROTEINA-LIGANDO DEBILES SE PUEDEN CONSIDERAR ENTRE LAS MAS DIFICILES DE ESTUDIAR MEDIANTE LAS TECNICAS BIOFISICAS ACTUALES (CRISTALOGRAFIA DE RAYOS-X, RMN DE PROTEINAS, ,,,), A PESAR DE SER BIOLOGICAM... ver más

01/01/2019

103K€

Presupuesto del proyecto: 103K€

Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE SEVILLA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 3672

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2019-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE SEVILLA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 3672

Presupuesto del proyecto 103K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto LAS ESTRUCTURAS DE COMPLEJOS PROTEINA-LIGANDO DEBILES SE PUEDEN CONSIDERAR ENTRE LAS MAS DIFICILES DE ESTUDIAR MEDIANTE LAS TECNICAS BIOFISICAS ACTUALES (CRISTALOGRAFIA DE RAYOS-X, RMN DE PROTEINAS, ,,,), A PESAR DE SER BIOLOGICAMENTE RELEVANTES, LAS INTERACCIONES PROTEINA-LIGANDO DEBILES SON FUNDAMENTALES PARA LA DINAMICA Y FLEXIBILIDAD DE RESPUESTAS CELULARES (SEÑALIZACION, CONTROL METABOLICO, ,,,) QUE HACEN POSIBLE LA VIDA, EN PARTICULAR, LAS INTERACCIONES PROTEINA-CARBOHIDRATO SON EJEMPLOS PARADIGMATICOS DE SISTEMAS DE AFINIDAD DEBIL DE ALTA RELEVANCIA, CON ALTA ESPECIFICIDAD Y DESEMPEÑANDO ROLES CLAVE COMO MODULADORES EN RECONOCIMIENTO CELULA-CELULA, RESPUESTAS INMUNES, ROLLING DE LEUCOCITOS, ETC, EN OTRO CONTEXTO, EL DEL DESCUBRIMIENTO DE FARMACOS, LAS CAMPAÑAS DE CRIBADO INICIALES IDENTIFICAN TIPICAMENTE LIGANDOS DEBILES, CUYA ELUCIDACION ESTRUCTURAL RESULTA MUY DIFICIL, DIFICULTANDO LA OPTIMIZACION POSTERIOR PARA LLEGAR A FARMACOS POTENTES,ESTA PROPUESTA PRETENDE SOLUCIONAR EL PROBLEMA DE LA DETERMINACION DE ESTRUCTURAS 3D DE COMPLEJOS PROTEINA-LIGANDO DE BAJA AFINIDAD DE RELEVANCIA BIOLOGICA, SIN LA NECESIDAD DE CARACTERIZAR ESPECTROSCOPICAMENTE LA PROTEINA, QUE ES EL ESCOLLO PRINCIPAL EN CALCULOS PROTEINA-LIGANDO MEDIANTE RMN DE PROTEINAS, ESTO PRESENTA UN ENORME INTERES TANTO PARA LABORATORIOS ACADEMICOS COMO PARA COMPAÑIAS FARMACEUTICAS CENTRADAS EN DESCUBRIMIENTO DE FARMACOS BASADO EN FRAGMENTOS (FBDD), DONDE LOS FRAGMENTOS IDENTIFICADOS EN LAS PRIMERAS ETAPAS PRESENTAN TIPICAMENTE BAJA AFINIDAD, POR LO QUE SUS COMPLEJOS CON PROTEINAS SON MUY DIFICILES DE CARACTERIZAR, UN ACCESO A ESTRUCTURAS 3D PRECISAS DE DICHOS COMPLEJOS RESULTARIA FUNDAMENTAL PARA PODER OPTIMIZAR EL CONJUNTO COMPLETO DE FRAGMENTOS IDENTIFICADOS (HITS), NO SOLAMENTE AQUELLOS ADECUADOS PARA LA CRISTALIZACION, ESTO, PUES, CATALIZARIA LOS PROCESOS DE OPTIMIZACION DE LEADS, Y AYUDARIA A LAS COMPAÑIAS FARMACEUTICAS EN LA RESOLUCION DE UN IMPORTANTE PROBLEMA ACTUAL EN EL DESARROLLO DE NUEVOS FARMACOS, ESTO ES: COMO PROGRESAR LOS FRAGMENTOS EN CAMPAÑAS FBDD CUANDO NO SE DISPONE DE ESTRUCTURAS CRISTALOGRAFICAS DE SUS COMPLEJOS,ESTE PROYECTO SE FUNDAMENTA EN DESARROLLOS RECIENTES POR EL INVESTIGADOR PRINCIPAL, BASADOS EN ESPECTROSCOPIA STD NMR, EN PARTICULAR EL METODO DEEP-STD NMR, ESTA HERRAMIENTA HA ABIERTO EL HORIZONTE A LA APLICACION DE STD NMR PARA LA DETERMINACION DE ESTRUCTURAS 3D DE COMPLEJOS PROTEINA-LIGANDO DEBILES, ACCEDIENDO A LA ORIENTACION DEL LIGANDO EN EL SITIO ACTIVO DE LA PROTEINA, ALGO NO REALIZABLE MEDIANTE STD NMR CONVENCIONAL, ESTE PROYECTO PERSEGUIRA UNA COMBINACION DE DEEP-STD NMR, STD NMR CONVENCIONAL, Y MODELIZACION MOLECULAR AVANZADA A FIN DE GENERAR ESTRUCTURAS 3D DE COMPLEJOS PROTEINA-LIGANDO DEBILES VALIDADOS POR DATOS EXPERIMENTALES DE RMN DE ALTA RESOLUCIONFINALMENTE, EL PROYECTO TIENE POR OBJETIVO TAMBIEN APLICAR LOS NUEVOS PROTOCOLOS STD NMR AL ESTUDIO DE DOS SISTEMAS PROTEINA-LIGANDO DE BAJA AFINIDAD DE ELEVADA RELEVANCIA, ENTRE LAS INTERACCIONES DEBILES DE PROTEINAS MAS UBICUAS Y RELEVANTE DESTACAN AQUELLAS EN LAS QUE LOS LIGANDOS SON CARBOHIDRATOS, Y LOS DOS SISTEMAS ELEGIDOS PARA LA APLICACION DE LAS NUEVAS HERRAMIENTAS ESPECTROSCOPICAS CORRESPONDEN A PROTEINAS DE ASOCIACION A CARBOHIDRATOS DE ELEVADA RELEVANCIA BIOLOGICA: (I) LAS INTERACCIONES DEBILES EN EL PROCESADO DE ACIDO SIALICO POR LA MICROBIOTA INTESTINAL, Y (II) EL RECONOCIMIENTO MOLECULAR DE LIGANDOS DEL HOSPEDADOR POR FACTORES DE VIRULENCIA BACTERIANOS, RMN\STD NMR\RECONOCIMIENTO MOLECULAR\INTERACCION LIGANDO-PROTEINA\CARBOHIDRATOS\ESTRUCTURA\DINAMICAS MOLECULARES\MODELADO MOLECULAR\19F NMR

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