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PID2021-126699NB-I00

Financiado

MONOCAPAS DERIVADAS DE ORGANOIDES INTESTINALES HUMANOS PARA ESTUDIAR LA PATOGENI...

MONOCAPAS DERIVADAS DE ORGANOIDES INTESTINALES HUMANOS PARA ESTUDIAR LA PATOGENICIDAD DE AIEC Y ROL DE LA ALARMONA PPGPP EN LA VIRULENCIA DE AIEC EL PATOTIPO ADHERENTE-INVASIVO DE ESCHERICHIA COLI (AIEC) SE HA RELACIONADO CON LA ETIOLOGIA DE LA ENFERMEDAD DE CROHN, UNA ENFERMEDAD INTESTINAL INFLAMATORIA CRONICA. LA BASE MOLECULAR DE SU PATOGENICIDAD NO ESTA CLARA. ESTE PATO... ver más

01/01/2021

UDG

169K€

Presupuesto del proyecto: 169K€

Líder del proyecto

UNIVERSITAT DE GIRONA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 226

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2021-01-01

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Participantes

UDG

Lider

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Líder del proyecto

UNIVERSITAT DE GIRONA

Total investigadores 226

Presupuesto del proyecto 169K€

Descripción del proyecto EL PATOTIPO ADHERENTE-INVASIVO DE ESCHERICHIA COLI (AIEC) SE HA RELACIONADO CON LA ETIOLOGIA DE LA ENFERMEDAD DE CROHN, UNA ENFERMEDAD INTESTINAL INFLAMATORIA CRONICA. LA BASE MOLECULAR DE SU PATOGENICIDAD NO ESTA CLARA. ESTE PATOTIPO SE DEFINE POR SU CAPACIDAD PARA ADHERIRSE E INVADIR CELULAS EPITELIALES INTESTINALES Y SU CAPACIDAD PARA SOBREVIVIR Y REPLICARSE EN DE MACROFAGOS. NO SE DISPONE DE FIRMAS MOLECULARES HASTA LA FECHA, POR LO QUE SU DETECCION ES MUY TEDIOSA Y HA LIMITADO LOS ESTUDIOS EPIDEMIOLOGICOS Y CLINICOS.DESDE 2005 ESTAMOS ENFOCADOS EN EL ESTUDIO DE POBLACIONES DE E. COLI DE PACIENTES CON ENFERMEDAD DE CROHN. NINGUN GEN PARTICULAR O MUTACION PATOADAPTATIVA SE HA ASOCIADO ESPECIFICAMENTE CON AIEC. SIN EMBARGO, IDENTIFICAMOS CEPAS DE E. COLI QUE COMPARTEN PATRONES DE MACRORRESTRICCION IDENTICOS (CONSIDERADAS EL MISMO CLON) PERO QUE DIFEREN EN SU FENOTIPO ADHERENTE-INVASIVO. HIPOTETIZAMOS QUE LA EXPRESION DIFERENCIAL DE GENES ES UN ASPECTO CLAVE EN LA VIRULENCIA DE AIEC.EN EL PROYECTO ANTERIOR (AIEXPRESS) REALIZAMOS UN ESTUDIO DE TRANSCRIPTOMICA COMPARATIVA ENTRE ESTAS CEPAS AIEC/NO-AIEC DE GENOMAS TAN SIMILARES, DURANTE LA INFECCION DE CELULAS I-407. IDENTIFICAMOS GENES QUE PUEDEN SER IMPORTANTES EN LA VIRULENCIA DE AIEC, ASI COMO POSIBLES MARCADORES MOLECULARES. I-407 ES UN BUEN MODELO YA QUE CORRESPONDE A LAS CONDICIONES EN LAS QUE SE PRUEBA EL FENOTIPO ADHERENTE-INVASIVO DE LAS BACTERIAS. SIN EMBARGO, EL USO DE CULTIVOS PRIMARIOS HUMANOS SUPERA LAS LIMITACIONES DE LAS LINEAS CELULARES INMORTALIZADAS. RECIENTEMENTE, HEMOS DESARROLLADO UN NUEVO MODELO DE INFECCION UTILIZANDO CELULAS PRIMARIAS HUMANAS DEL EPITELIO INTESTINAL. POR PRIMERA VEZ GENERAMOS, E INFECTAMOS CON AIEC, MONOCAPAS DE CELULAS DERIVADAS DE ORGANOIDES COLONICOS HUMANOS (ODMS). EL PRIMER OBJETIVO DE ESTE PROYECTO ES ESTUDIAR SI LOS GENES EXPRESADOS DIFERENCIALMENTE IDENTIFICADOS EN EL PROYECTO AIEXPRESS TAMBIEN SE EXPRESAN DIFERENCIALMENTE EN LAS ODMS, ASI COMO REALIZAR UN NUEVO ANALISIS TRANSCRIPTOMICO COMPARATIVO EN ESTE MODELO.A SU VEZ, LA MOLECULA PPGPP ES UN REGULADOR GLOBAL DE LA EXPRESION GENICA QUE ES CRUCIAL PARA LA VIRULENCIA Y LA SUPERVIVENCIA INTRACELULAR. YA SE HA DEMOSTRADO QUE PPGPP ES IMPORTANTE PARA LA SUPERVIVENCIA DE LA CEPA AIEC LF82 DENTRO DE MACROFAGOS. NO EXISTEN ESTUDIOS SOBRE SU PAPEL EN OTROS ASPECTOS DE LA PATOGENICIDAD (ADHESION, INVASION, COLONIZACION). EXISTEN MUTACIONES EN LAS SUBUNIDADES SPOT Y RNAP ENTRE LA CEPA AIEC LF82 Y LA COMENSAL K12, LO QUE SUGIERE QUE LOS NIVELES DE PPGPP, O SUS EFECTOS REGULADORES, PUEDEN ESTAR ALTERADOS EN AIEC. POR TANTO, PLANTEAMOS LA HIPOTESIS DE QUE PPGPP PUEDE SER CLAVE PARA LA REGULACION DE GENES IMPLICADOS EN LA VIRULENCIA DE AIEC. EL SEGUNDO OBJETIVO DE ESTE PROYECTO ES ESTUDIAR EL PAPEL DE PPGPP EN LA REGULACION DE LAS CARACTERISTICAS PATOGENICAS DE AIEC Y LA ADAPTACION A LAS CONDICIONES AMBIENTALES EN EL INTESTINO INFLAMADO E IDENTIFICAR QUE GENES ESTAN BAJO EL CONTROL DE ESTE REGULADOR GLOBAL.CON EL PROYECTO AIEC-PRIMALARM ESPERAMOS COMPRENDER MEJOR LOS MECANISMOS MOLECULARES DE LA PATOGENICIDAD DE AIEC Y DESCIFRAR SI PPGPP PUEDE ESTAR INVOLUCRADO EN LA REGULACION DE LOS GENES IMPLICADOS EN LA VIRULENCIA. TAMBIEN ESPERAMOS IDENTIFICAR TRANSCRITOS CANDIDATOS PARA USARSE COMO NUEVOS MARCADORES MOLECULARES PARA SU RAPIDA DETECCION Y CUANTIFICACION. ESTOS MARCADORES SERIAN UTILES EN EL DIAGNOSTICO CLINICO Y MANEJO DE PACIENTES COLONIZADOS POR AIEC. .COLI ADHERENTE INVASIVA\CROHN\EXPRESION GENICA\PPGPP\ORGANOIDES 2D\VIRULENCIA

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