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SAF2017-82261-P

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BUSQUEDA DE NUEVOS FACTORES IMPLICADOS EN LA VIRULENCIA DEL PATOTIPO AIEC ASOCIA...

BUSQUEDA DE NUEVOS FACTORES IMPLICADOS EN LA VIRULENCIA DEL PATOTIPO AIEC ASOCIADO A LA ENFERMEDAD DE CROHN: ESTUDIO TRANSCRIPTOMICO Y ROL DE LAS VESICULAS DE MEMBRANA EXTERNA EL PATOTIPO ADHERENTE-INVASIVO DE ESCHERICHIA COLI (AIEC) HA SIDO IMPLICADO EN LA ETIOLOGIA DE LA ENFERMEDAD DE CROHN Y SE DEFINE POR SU CAPACIDAD DE ADHERENCIA E INVASION DE CELULAS EPITELIALES INTESTINALES, Y DE SOBREVIVIR Y REP... ver más

01/01/2017

UDG

109K€

Presupuesto del proyecto: 109K€

Líder del proyecto

UNIVERSITAT DE GIRONA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 227

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2017-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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UDG

Lider

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Líder del proyecto

UNIVERSITAT DE GIRONA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 227

Presupuesto del proyecto 109K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto EL PATOTIPO ADHERENTE-INVASIVO DE ESCHERICHIA COLI (AIEC) HA SIDO IMPLICADO EN LA ETIOLOGIA DE LA ENFERMEDAD DE CROHN Y SE DEFINE POR SU CAPACIDAD DE ADHERENCIA E INVASION DE CELULAS EPITELIALES INTESTINALES, Y DE SOBREVIVIR Y REPLICARSE EN MACROFAGOS, LA IDENTIFICACION SE BASA EN EL AISLAMIENTO DE E, COLI DE LA MUCOSA INTESTINAL Y POSTERIOR IDENTIFICACION DEL PATOTIPO MEDIANTE ENSAYOS FENOTIPICOS DE INFECCION DE CULTIVOS CELULARES, NO EXISTE NINGUNA HERRAMIENTA MOLECULAR PARA SU IDENTIFICACION, LO QUE HACE QUE LA DETECCION SEA TEDIOSA Y DIFICULTE LOS ESTUDIOS CLINICOS Y EPIDEMIOLOGICOS, ADEMAS, NO SE CONOCEN CON EXACTITUD LAS BASES MOLECULARES DE SU PATOGENICIDAD,EL PATOTIPO AIEC ES GENETICAMENTE MUY DIVERSO, EXISTEN CEPAS QUE PERTENECEN A DISTINTOS GRUPOS FILOGENETICOS Y PRESENTAN DIFERENTES COMBINACIONES DE GENES DE VIRULENCIA CARACTERISTICOS DE E, COLI PATOGENAS EXTRAINTESTINALES, ESTUDIOS RECIENTES DE GENOMICA COMPARATIVA NO HAN PERMITIDO HALLAR GENES ESPECIFICOS DE AIEC, NUESTRO GRUPO MOSTRO QUE AISLADOS DE E, COLI GENOMICAMENTE MUY SIMILARES (CON PATRONES DE MACRORESTRICCION IDENTICOS) DIFIEREN EN EL FENOTIPO AIEC, LO QUE NOS LLEVO A PENSAR QUE PEQUEÑOS CAMBIOS EN EL GENOMA (SNPS, MICROINSERCIONES, MICRODELECCIONES) O DIFERENCIAS DE EXPRESION DE GENES PUEDEN DETERMINAR EL FENOTIPO AIEC, EN UN PROYECTO ANTERIOR (SAF2010-15896) SE SECUENCIARON, ANOTARON Y COMPARARON LOS GENOMAS DE TRES PAREJAS DE CEPAS AIEC/NO-AIEC QUE PRESENTABAN EL MISMO PERFIL DE MACRORESTRICCION, CON EL OBJETIVO DE OBTENER UNA LISTA DE DIFERENCIAS RELATIVAMENTE REDUCIDA DEBIDO A QUE SE COMPARARON CEPAS CON UN GENOMA MUY PARECIDO, EN EL SIGUIENTE PROYECTO (SAF2013-43284-P) SE CONFIRMARON POR SANGER LAS MUTACIONES SELECCIONADAS Y SE SECUENCIARON LOS GENES MUTADOS EN UNA AMPLIA COLECCION DE CEPAS AIEC Y NO AIEC DE DISTINTOS ORIGENES FILOGENETICOS, EN LINEA CON LOS RESULTADOS RECIENTES DE OTROS GRUPOS DE INVESTIGACION, EL ANALISIS GENOMICO NO NOS HA PERMITIDO IDENTIFICAR SECUENCIAS FIRMA PARA EL PATOTIPO AIEC, YA QUE NO HEMOS ENCONTRADO MUTACIONES ESPECIFICAS Y AMPLIAMENTE DISTRIBUIDAS EN TODAS LAS CEPAS,EL PROYECTO QUE PRESENTAMOS PRETENDE DETERMINAR SI DIFERENCIAS EN LA EXPRESION DE GENES CLAVE SON RESPONSABLES DEL FENOTIPO AIEC, PROPONEMOS UN ESTUDIO DE TRANSCRIPTOMICA COMPARATIVA BASANDONOS EN LA SECUENCIACION DEL ARNM, EXISTE SOLO UN TRABAJO PUBLICADO RECIENTEMENTE EN QUE SE HA SECUENCIADO EL TRANSCRIPTOMA DE AIEC, PERO ESTE ESTUDIO INCLUYE SOLAMENTE LA CEPA DE REFERENCIA Y UNA COMENSAL, CRECIENDO EN MEDIO DE CULTIVO BACTERIANO, EL PROYECTO AIEXPRESS, APARTE DE INCLUIR PAREJAS DE CEPAS AIEC/NO-AIEC DE DISTINTO ORIGEN FILOGENETICO, PROPONE ESTUDIAR LA EXPRESION DIFERENCIAL DE GENES ENTRE PAREJAS DURANTE LA INFECCION DE CELULAS INTESTINALES Y MACROFAGOS, ESTA APROXIMACION NOS DARA INFORMACION ACERCA DE LOS GENES IMPLICADOS EN LA VIRULENCIA DEL PATOVAR Y RESPONSABLES DEL FENOTIPO AIEC, ADEMAS, PROPONE VERIFICAR DE FORMA PROSPECTIVA LOS RESULTADOS EN MUESTRAS COMPLEJAS (FECALES) DE ENFERMOS DE CROHN ACTIVOS, FINALMENTE, PRETENDEMOS ESTUDIAR EL PAPEL DE OMPA Y LAS VESICULAS DE MEMBRANA EXTERNA EN LA CAPACIDAD DE INVASION DE AIEC,ESPERAMOS OBTENER TRANSCRITOS INVOLUCRADOS EN LA PATOGENICIDAD DE AIEC QUE PUEDAN SER USADOS COMO MARCADORES MOLECULARES PARA LA RAPIDA IDENTIFICACION DEL PATOTIPO Y EN EL DIAGNOSTICO CLINICO, ASI COMO HALLAR NUEVOS FACTORES DE VIRULENCIA QUE PODRIAN REPRESENTAR NUEVAS DIANAS TERAPEUTICAS, E. COLI ADHERENTE-INVASIVA\ENFERMEDAD DE CROHN\RNA-SEQ\TRANSCRIPTÓMICA COMPARATIVA\SECUENCIAS FIRMA\FACTOR DE VIRULENCIA\VESÍCULAS DE MEMBRANA EXTERNA\ADHERENCIA\INVASIÓN\PATOGENICIDAD

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