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SAF2013-43284-P

Financiado
DETERMINANTES GENETICOS IMPLICADOS EN EL PATOTIPO ESCHERICHIA COLI ADHERENTE INV...
DETERMINANTES GENETICOS IMPLICADOS EN EL PATOTIPO ESCHERICHIA COLI ADHERENTE INVASIVA (AIEC) PARA SU IDENTIFICACION EN LA ENFERMEDAD DE CROHN. EL PATOTIPO ADHERENTE-INVASIVO DE ESCHERICHIA COLI (AIEC) HA SIDO IMPLICADO RECIENTEMENTE EN LA ETIOLOGIA DE LA ENFERMEDAD DE CROHN, ESPECIALMENTE EN PACIENTES CON AFECTACION ILEAL, AUNQUE CADA VEZ SON MAS LOS ESTUDIOS QUE TAMBIEN... EL PATOTIPO ADHERENTE-INVASIVO DE ESCHERICHIA COLI (AIEC) HA SIDO IMPLICADO RECIENTEMENTE EN LA ETIOLOGIA DE LA ENFERMEDAD DE CROHN, ESPECIALMENTE EN PACIENTES CON AFECTACION ILEAL, AUNQUE CADA VEZ SON MAS LOS ESTUDIOS QUE TAMBIEN LO RELACIONAN CON OTRAS AFECTACIONES INTESTINALES COMO LA COLITIS ULCEROSA Y EL CANCER DE COLON, AMBAS ENFERMEDADES TIENEN UNA INCIDENCIA CRECIENTE EN PAISES DESARROLLADOS,EL PATOTIPO AIEC SE DEFINE POR SU CAPACIDAD DE ADHERENCIA E INVASION DE CELULAS EPITELIALES INTESTINALES Y POR SER CAPAZ DE SOBREVIVIR Y REPLICARSE EN MACROFAGOS, LAS CEPAS AIEC AISLADAS HASTA EL MOMENTO SON GENETICAMENTE MUY DIVERSAS, PERTENECEN A DISTINTOS FILOGRUPOS Y PUEDEN PRESENTAR DIVERSOS GRUPOS DE GENES DE VIRULENCIA CARACTERISTICOS DE E, COLI PATOGENAS EXTRAINTESTINALES, NO OBSTANTE, EL HECHO DE TENER ESTOS GENES NO JUSTIFICA EL FENOTIPO AIEC, POR OTRO LADO, SE HA DEMOSTRADO QUE GENES DIRECTAMENTE IMPLICADOS EN LA PATOGENICIDAD DEL PATOTIPO SE HALLAN TAMBIEN EN CEPAS DE E, COLI NO PATOGENAS, EN RESUMEN, NO SE CONOCEN QUE DETERMINANTES GENETICOS ESTAN ESPECIFICAMENTE RELACIONADOS CON EL FENOTIPO AIEC, EN UN ESTUDIO PREVIO, NUESTRO GRUPO MOSTRO QUE AISLADOS DE E, COLI CON PULSOTIPOS IDENTICOS DIFIEREN EN EL FENOTIPO AIEC, EN EL ANTERIOR PROYECTO (GENAIEC, SAF2010-15896) SE SELECCIONARON TRES PAREJAS DE CEPAS (CADA PAREJA CONSISTE EN UN AISLADO AIEC Y UNO NO-AIEC CON EL MISMO PULSOTIPO) Y SE SECUENCIARON SUS GENOMAS, SE LLEVO A CABO UNA SECUENCIACION DE NOVO CON EL OBJETIVO DE TENER GENOMAS DE REFERENCIA DE ALTA CALIDAD EN QUE SE PUEDAN IDENTIFICAR NO SOLO DIFERENCIAS DE PRESENCIA/AUSENCIA DE GENES SINO TAMBIEN DIFERENCIAS ESTRUCTURALES, SE ANOTARON FUNCIONALMENTE LOS SEIS GENOMAS Y SE REALIZO UN ANALISIS COMPARATIVO DOS A DOS, LA COMPARACION DE CEPAS TAN CERCANAS GENETICAMENTE PERO QUE DIFIEREN EN EL FENOTIPO AIEC NOS HA PERMITIDO OBTENER UNA LISTA RELATIVAMENTE REDUCIDA DE ELEMENTOS GENETICOS CANDIDATOS, ADEMAS, AL SECUENCIAR TRES PAREJAS DE CEPAS QUE PERTENECEN A FILOGRUPOS DISTINTOS PODEMOS CONOCER QUE DIFERENCIAS SON ESPECIFICAS DE LA PAREJA ESTUDIADA Y CUALES SON “TRANSVERSALES” EN LAS AIEC DE DISTINTOS FILOGRUPOS,EN EL PRESENTE PROYECTO PRETENDEMOS IDENTIFICAR ELEMENTOS GENETICOS DISTINTIVOS DEL PATOTIPO AIEC, EN PRIMER LUGAR SE PROPONE DISEÑAR HERRAMIENTAS MOLECULARES QUE PERMITAN LA DETECCION Y CUANTIFICACION DEL PATOTIPO AIEC, ACTUALMENTE INEXISTENTES, Y QUE PODRAN APLICARSE EN MUESTRAS DE PACIENTES, POR OTRO LADO, PRETENDEMOS CONOCER EL MECANISMO MEDIANTE EL CUAL ESTOS ELEMENTOS GENETICOS ESTAN IMPLICADOS EN LA PATOGENICIDAD DE LAS AIEC,EL DISEÑO DE HERRAMIENTAS MOLECULARES PARA LA DETECCION DEL PATOTIPO AIEC PODRIA SER DE UTILIDAD EN EL DIAGNOSTICO DIFERENCIAL DE DISTINTOS SUBTIPOS DE ENFERMEDADES INFLAMATORIAS INTESTINALES, ADEMAS, ESTAS HERRAMIENTAS FACILITARIAN LOS ESTUDIOS A GRAN ESCALA, PUDIENDO CONOCER MEJOR LA PREVALENCIA DEL PATOTIPO E IDENTIFICAR LOS RESERVORIOS Y VIAS DE TRANSMISION, ESTOS ESTUDIOS SON DIFICILMENTE EJECUTABLES MEDIANTE LAS TECNICAS ACTUALES DE IDENTIFICACION DEL PATOTIPO, ADEMAS, ESCLARECER CUALES SON LOS DETERMINANTES GENETICOS RELACIONADOS CON SU PATOGENICIDAD NO SOLO AYUDARIA A COMPRENDER MEJOR EL MECANISMO DE PATO¬GENICIDAD DEL PATOTIPO SI NO QUE SIGNIFICARIA UN GRAN AVANCE EN LA DETECCION DE NUEVAS DIANAS TERAPEUTICAS PARA LA ENFERMEDAD DE CROHN, E. COLI ADHERENTE INVASIVA\ BASES MOLECULARES DE LA PATOGENICIDAD\ MARCADORES GENÉTICOS\ ENFERMEDAD DE CROHN\ HERRAMIENTAS DE DETECCIÓN MOLECULAR ver más
01/01/2013
UDG
73K€
Perfil tecnológico estimado

Línea de financiación: concedida

El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2013-01-01
Presupuesto El presupuesto total del proyecto asciende a 73K€
Líder del proyecto
UNIVERSITAT DE GIRONA No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.
Total investigadores 226