Descripción del proyecto
ANTECEDENTES, LAS CEPAS ENTEROAGREGATIVAS DE E, COLI (EAEC) CONSTITUYEN UNO DE LOS PATOTIPOS DIARREAGENICOS, EN LOS ULTIMOS AÑOS, HEMOS UTILIZADO EN EL GRUPO COMO MODELO LA CEPA EAEC 042 PARA INTENTAR DESCIFRAR NUEVOS ASPECTOS DE LA VIRULENCIA BACTERIANA, CUANDO COMPARAMOS SU GENOMA CON EL DE CEPAS COMENSALES, ESTA CEPA PRESENTA ALGUNAS CARACTERISTICAS INUSUALES, ENTRE ELLAS, LA PRESENCIA DE VARIAS COPIAS DE PARALOGOS DE MODULADORES GLOBALES, HEMOS SIDO CAPACES DE PONER DE MANIFIESTO QUE, DE HECHO, ESTA Y MUCHAS OTRAS CEPAS PATOGENAS DE E, COLI QUE PERTENECEN A CASI TODOS LOS PATOTIPOS CODIFICAN PARA, ADEMAS DE VARIOS PARALOGOS DE MODULADORES GLOBALES, PARA UNOS 25 GENES QUE ESTAN BIEN DUPLICADOS O AMPLIFICADOS (GDAS), ESTO ES DESTACABLE, YA QUE E, COLI PRESENTA UNA ELEVADA VARIABILIDAD GENOMICA, NO SE SABE NADA ACERCA DEL PAPEL BIOLOGICO DE ESOS GDAS,LA CEPA 042 ES PORTADORA DE UN PLASMIDO DE VIRULENCIA (PAA2), EL MISMO CODIFICA PARA UN REGULADOR CENTRAL DE VIRULENCIA (AGGR), CUYA EXPRESION CUANDO LA CEPA CRECE EN CONDICIONES DE LABORATORIO ES REDUCIDA, LA SOBREEXPRESION DE AGGR TIENE COMO CONSECUENCIA LA EXPRESION DE DETERMINANTES DE VIRULENCIA, TANTO PLASMIDICOS COMO CROMOSOMICOS, HEMOS PODIDO OBTENER UN MUTANTE DE LA CEPA 042 QUE SOBREEXPRESA DE FORMA CONSTITUTIVA AGGR, SORPRENDENTEMENTE, ADEMAS DE INDUCIR LA EXPRESION DE FACTORES DE VIRULENCIA CLASICOS (TOXINAS, ADHESINAS), SOBREEXPRESA TAMBIEN AL MENOS DOS VIAS METABOLICAS ESPECIFICAS, LAS MISMAS PARTICIPAN EN LA DEGRADACION DE LA ARGININA (AST) Y DE ACIDOS GRASOS (FAD), TANTO LOS NIVELES DE ARGININA COMO DE ACIDOS GRASOS DE CADENA CORTA HAN SIDO ASOCIADOS AL MICROBIOMA INTESTINAL Y A SU HOMEOSTASIS,PREGUNTAS, (I) ¿CUAL ES EL IMPACTO DE LOS GENES DUPLICADOS/AMPLIFICADOS EN LA VIRULENCIA DE LA MAYORIA DE CEPAS PATOGENAS DE E, COLI?, Y (II) ¿CONTRIBUYE LA SOBREEXPRESION DE LAS VIAS METABOLICAS AST Y FAD A LA CAPACIDAD DE LAS CEPAS EAEC DE COLONIZAR EL INTESTINO?OBJETIVOS GENERALES, DEMOSTRAR LA PARTICIPACION DE LOS GDAS EN LA VIRULENCIA DE E, COLI, Y PROPORCIONAR EVIDENCIAS DE LA CONTRIBUCION DE LAS VIAS METABOLICAS AST Y FAD EN LA CAPACIDAD DE LAS EAEC DE COLONIZAR EL INTESTINO,RESUMEN DE LOS OBJETIVOS ESPECIFICOS,1,GDAS Y VIRULENCIA1,1 DELECIONAR GRUPOS ESPECIFICOS DE GDAS Y ESTUDIAR SI INFLUYEN EN LA VIRULENCIA DE LA CEPA 0421,2 PURIFICAR AQUELLOS GDAS QUE SON COMPONENTS HIPOTETICOS DE LAS ESTRUCTURAS EXTERNAS DE LA CELULA BACTERIANA1,3 DEMOSTRAR SI LOS MISMOS PUEDEN SER ANTIGENICOS1,4 ESTUDIAR LA EXPRESSION DE LOS GDAS BAJO CONDICIONES AMBIENTALES ESPECIFICAS2, INDUCCION DE LAS VIAS METABOLICAS AST Y FAD 2,1 REALIZAR ESTUDIOS COMPARATIVOS DE COLONIZACION (MODELO DE RATON) CON (I) CEPA WT 042, (II) SU MUTANTE QUE SOBREEXPRESA AGGR Y LAS VIAS METABOLICAS AST Y FAD , Y (III) EL MUTANTE QUE SOBREEXPRESA AGGR, PERO QUE CARECE DE LAS VIAS AST Y FAD 2,2 ESTUDIAR LAS ALTERACIONES DIFERENCIALES EN EL MICROBIOMA DEL INTESTINO DE RATON DESPUES DE LA COLONIZACION CON LAS TRES CEPAS REFERIDAS EN 2,1 2,3 ESTUDIAR LA INDUCCION DE LAS VIAS AST Y FAD DESPUES DE LA SOBREEXPRESION DE AGGR EN CEPAS EAEC DIFERENTES DE LA 042 ESCHERICHIA COLI\VIRULENCIA\REGULACION\DUPLICACIONES GENICAS\CEPA 042\EAEC\AGGR