Descripción del proyecto
LA MIDKINA (MK) Y LA PLEIOTROFINA (PTN) SON PROTEINAS EXTRACELULARES SOLUBLES DE BAJO PESO MOLECULAR RELACIONADAS CON LA FORMACION DE ESTRUCTURAS DEL SISTEMA NERVIOSO CENTRAL (SCN), PLASTICIDAD SINAPTICA Y DIFERENCIACION NEURONAL DURANTE EL DESARROLLO EMBRIONARIO, EN ADULTOS SU EXPRESION ESTA MUY RESTRINGIDA, A EVENTOS DE REGENERACION O DE CICATRIZACION, SOLO EN CASOS PATOLOGICOS COMO TUMORIGENESIS, ANGIOGENESIS Y EN ESTADOS ANTI-APOPTOTICOS SE DETECTAN NIVELES DE EXPRESION SIGNIFICATIVOS,DURANTE EL DESARROLLO DE LOS PROYECTOS ANTERIORES (CTQ2012-32605 Y CTQ2015-70134-P) HEMOS DETECTADO UNA POTENCIAL INTERACCION CON MK Y PTN DE PRODUCTOS CON ESTRUCTURAS DE SULFATO DE CONDROITINA (CS) E HIBRIDAS CS/ SULFATO DE DERMATANO (DS) EN EL RANGO DE TETRASACARIDO Y CON SECUENCIAS ALTERNATIVAS, EL ANALISIS DE ESTA INTERACCION PARECE INVOLUCRAR UN AJUSTE INDUCIDO DE LA PROTEINA QUE APROXIMA LOS DOS DOMINIOS ESTRUCTURADOS DE LA MK Y PTN A UNA DISTANCIA EN LA ES POSIBLE FORMAR UN COMPLEJO 1:1 CON EL GLICOSAMINOGLICANO (GAG), SE DETERMINO QUE LA ASOCIACION Y LA ACTIVIDAD DE ESTOS LIGANDOS ERA ESCASA COMPARADA CON LA DE LOS PRODUCTOS NATURALES QUE GRACIAS A UN EFECTO MULTIVALENTE AUMENTAN LA AFINIDAD, HEMOS COMPROBADO QUE LA PRESENCIA DE ESTRUCTURAS AROMATICAS EN EL LIGANDO AUMENTA CONSIDERABLEMENTE LA ASOCIACION CON LA PROTEINA, TAMBIEN HEMOS PROBADO QUE ES POSIBLE REEMPLAZAR LOS ACIDOS URONICOS POR AZUCARES MAS SIMPLES, POR OTRO LADO, LAS BASES MOLECULARES DE LA INTERACCION DE GAG CON MK Y PTF ANALIZADAS MEDIANTE UNA COMBINACION DE RMN Y MD ESTAN DE ACUERDO CON UN MISMO MODO DE ASOCIACION COMUN, INDEPENDIENTEMENTE DE LAS MODIFICACIONES ESTRUCTURALES, A LO LARGO DEL PRESENTE PROYECTO SE PRETENDE PROFUNDIZAR EN LAS BASES MOLECULARES DE LA INTERACCION, MEJORAR LOS METODOS DE SINTESIS Y ANALISIS DE LA INTERACCION Y ANALIZAR LA ACTIVIDAD EN CULTIVOS CELULARES, RESPETO AL PRIMER PUNTO SE CONTINUARA CON EL EMPLEO DE LOS ATOMOS DE FLUOR EN EL LIGANDO PARA OBTENER RESTRICCIONES ADICIONALES DE LOS EXPERIMENTOS DE STD, EN ESTE SENTIDO TAMBIEN SE QUIERE AUMENTAR EL NUMERO DE RESTRICCIONES MEDIANTE EL EMPLEO DE DIFERENTIAL EPITOPE MAPPING STD Y LOGSY TITRATION, MEDIANTE EL PRIMER METODO SE OBTENDRAN MAS RESTRICCIONES Y CON EL SEGUNDO GRACIAS AL MENOR TIEMPO DE CORRELACION DEL AGUA PODEMOS ANALIZAR MOLECULAS MAYORES, RESPECTO A LOS METODOS DE SINTESIS SE PRETENDEN USAR ETIQUETAS FLUORADAS PARA OPTIMIZAR LAS ETAPAS DE PURIFICACION, POR OTRO LADO, Y CON EL OBJETIVO DE DETERMINAR LA NATURALEZA DE LAS INTERACCIONES FAVORABLES QUE SE OBSERVAN ENTRE LOS ELEMENTOS AROMATICOS, SE PREPARARAN MODELOS SENCILLOS EN LOS QUE MEDIANTE CAMBIO EN LA DENSIDAD DE CARGA DE ESTOS SE PUEDA DETERMINAR SI PARTICIPAN ENLACES PI PI O SE TRATA SIMPLEMENTE DE FUERZAS HIDROFOBICAS, SE MEDIRA LA AFINIDAD DE TODOS LOS COMPUESTOS MEDIANTE METODOS DE POLARIZACION DE FLUORESCENCIA YA ESTABLECIDOS EN EL GRUPO, EN ESTE CASO SE PRETENDE ESTUDIAR LA CAPACIDAD DE NUEVAS SONDAS CON DIFERENTE AFINIDAD, PARA AUMENTAR EL RANGO DE AFINIDADES A MEDIR POR COMPETICION EN SOLUCION, ADEMAS, EMPLEANDO LOS COMPUESTOS FLUORADOS Y PLACAS ADECUADAS SE PRETENDE EVALUAR LA INTERACCION DIRECTA SUPERFICIAL, FINALMENTE, MENCIONAR QUE EN ESTE PROYECTO SE MEDIRA LA ACTIVIDAD BIOLOGICA DE LOS COMPUESTOS CON MAYOR INTERACCION SOBRE DOS MODELOS DE CRECIMIENTO Y DE APOPTOSIS EN COLABORACION CON EL DR, GARCIA DOMINGUEZ DEL CABIMER, GLICOSAMINOGLICANOS\SINTESIS\RMN\DINAMICA MOLECULAR\POLARIZACION DE FLUORESCENCIA\ANALISIS CONFORMACIONAL\INTERACIONES BIOMOLECULARES\CARBOHIDRATOS