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CTQ2015-70134-P

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INTESIS DE GLICOSAMINOGLICANOS Y GLICOMIMETICOS, ESTRUCTURA EN DISOLUCION Y RECO...

INTESIS DE GLICOSAMINOGLICANOS Y GLICOMIMETICOS, ESTRUCTURA EN DISOLUCION Y RECONOCIMIENTO MOLECULAR. IMPLICACIONES EN QUIMICA BIOLOGICA DE CARBOHIDRATOS. LA MIDKINA (MK) Y LA PLEIOTROFINA (PTN) SON PROTEINAS EXTRACELULARES SOLUBLES DE BAJO PESO MOLECULAR RELACIONADAS CON LA FORMACION DE ESTRUCTURAS DEL SISTEMA NERVIOSO CENTRAL (SCN), Y EN CASOS PATOLOGICOS CON TUMORIGENESIS, ANGIOG... ver más

01/01/2015

CSIC

104K€

Presupuesto del proyecto: 104K€

Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2015-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Presupuesto del proyecto 104K€

Descripción del proyecto LA MIDKINA (MK) Y LA PLEIOTROFINA (PTN) SON PROTEINAS EXTRACELULARES SOLUBLES DE BAJO PESO MOLECULAR RELACIONADAS CON LA FORMACION DE ESTRUCTURAS DEL SISTEMA NERVIOSO CENTRAL (SCN), Y EN CASOS PATOLOGICOS CON TUMORIGENESIS, ANGIOGENESIS Y ANTI-APOPTOSIS, DURANTE EL DESARROLLO DEL PROYECTO ANTERIOR (CTQ2012-32605) HEMOS DETECTADO UNA POTENCIAL INTERACCION CON MK DE PRODUCTOS CON ESTRUCTURAS DE SULFATO DE CONDROITINA (CS) E HIBRIDAS CS/ SULFATO DE DERMATANO (DS) EN EL RANGO DE TETRASACARIDO, UN PRIMER ANALISIS DE ESTA HIPOTETICA INTERACCION PARECE INVOLUCRAR UN AJUSTE INDUCIDO DE LA PROTEINA PARA APROXIMAR LOS DOS DOMINIOS ESTRUCTURADOS DE LA MK A UNA DISTANCIA EN LA ES POSIBLE FORMAR UN COMPLEJO 1:1 CON EL GLICOSAMINOGLICANO (GAG), ESTE PROYECTO SE PLANTEA PARA OBTENER LA MAYOR INFORMACION POSIBLE SOBRE ESTA ASOCIACION, DESDE UN PUNTO DE VISTA SINTETICO, SE QUIERE APROVECHAR LA FLEXIBILIDAD DE LA SINTESIS QUIMICA Y DE LA EXPERIENCIA ADQUIRIDA POR EL GRUPO PARA DETERMINAR LOS REQUERIMIENTOS ESTRUCTURALES DE DICHA INTERACCION, ELLO ES DE ESPECIAL VALOR EN EL CASO DE LAS ESTRUCTURAS HIBRIDAS, DIFICILES DE CONSEGUIR MEDIANTE LA PURIFICACION DE PRODUCTOS DE HIDROLISIS DE SUS FUENTES NATURALES, POR OTRO LADO, PENSAMOS QUE NO ES NECESARIA LA FUNCION CARBOXILO DEL ACIDO URONICO, Y QUE SU REEMPLAZO POR UN RESIDUO MAS SENCILLO DE PREPARAR, SIN DICHA FUNCION, NO DEBERIA AFECTAR A LA CAPACIDAD DE INTERACCION, FINALMENTE EL OTRO ASPECTO A CONSIDERAR ES QUE LA RUTA PERMITE ACCEDER A COMPUESTOS PARCIALMENTE BENCILADOS QUE SOMETIDOS A ENSAYOS DE INTERACCION CON MIDKINA HAN RESULTADO MAS AFINES QUE LOS PRODUCTOS DESPROTEGIDOS, LOS COMPUESTOS PREPARADOS SE SOMETERAN A ENSAYOS DE AFINIDAD FRENTE A MK Y PTF, POR MEDIDAS DE FLUORESCENCIA Y DE POLARIZACION DE FLUORESCENCIA EN LECTOR DE MICROPLACAS, LAS BASES MOLECULARES DE LA INTERACCION DE GAG CON MK Y PTF SE ANALIZARAN MEDIANTE UNA COMBINACION DE RMN Y MD, PRIMERO SE ESTUDIARA LA ESTRUCTURA DE LOS COMPUESTOS PREPARADOS LIBRES A LOS QUE SE LES REALIZARA UN ESTUDIO CONFORMACIONAL POR RMN, EN ESTE ESTUDIO SE PRETENDE INCLUIR DATOS DE CONSTANTES DE ACOPLAMIENTO A LARGO ALCANCE H C, OBTENIDAS MEDIANTE METODOLOGIA PURE IN-PHASE (PIP) Y LA APLICACION DE METODOS DE PURE SHIFT EN RMN, LOS DATOS ASI LOGRADOS SE COMBINARAN CON MD-TAR (MD CON RESTRICCIONES PROMEDIADAS EN EL TIEMPO) PARA OBTENER UNA PRECISA DEFINICION DE LAS ESTRUCTURAS DE LOS COMPUESTOS LIBRES, EN EL ESTUDIO DE LAS INTERACCIONES PARA FORMAR COMPLEJOS SE PRETENDE USAR METODOS BASADOS EN TRANSFERENCIA DE SATURACION (STD) Y SU CUANTIFICACION, ADEMAS SE PRETENDE EMPLEAR METODOS BASADOS EN RMN DE 19F, INTRODUCIDO EN LA MOLECULA COMO GRUPO NHCOCF3, CON EL CONSECUENTE CAMBIO EN LA HIDROFOBICIDAD CUYO EFECTO ESPERAMOS FAVORABLE, DE NUEVO MEDIANTE QUIMICA COMPUTACIONAL, AHORA SOBRE EL COMPLEJO SE PRETENDE OBTENER ESTRUCTURAS DE BAJA RESOLUCION DE LOS COMPLEJOS ESTUDIADOS, COMO ULTIMO PUNTO, PLANEAMOS REALIZAR UN ESTUDIO TERMODINAMICO DE ESTA ASOCIACION MEDIANTE ITC, UNA MEJOR CARACTERIZACION DE ESTA INTERACCION PUEDE AYUDAR A SU COMPRENSION Y A DETERMINAR EL PAPEL QUE JUEGA EL BALANCE ENTALPICO - ENTROPICO EN LA MISMA, SINTESIS DE GAG\GLICOMIMETICOS\CADENAS HIBRIDAS CS/DS\MIDKINA\INTERACCION CARBOHIDRATO-PROTEINA\STD-NMR\19F-NMR\FLUORESCENCIA\MOLECULAR MODELING

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