LOS ROLES DE LA DIVERSIFICACION TRANSCRIPTOMICA EN EL DESARROLLO Y PLURIPOTENCIA...
LOS ROLES DE LA DIVERSIFICACION TRANSCRIPTOMICA EN EL DESARROLLO Y PLURIPOTENCIA EMBRIONARIA DE MAMIFEROS
EN LOS PRIMEROS DIAS DEL DESARROLLO EMBRIONARIO DE LOS MAMIFEROS OCURREN DIVERSOS EVENTOS DE VITAL IMPORTANCIA: (I) EL TRANSCRIPTOMA COMIENZA A REMODELARSE TRAS LA FERTILIZACION, MEDIANTE LA DEGRADACION DE LOS TRANSCRITOS MATERNOS...
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Descripción del proyecto
EN LOS PRIMEROS DIAS DEL DESARROLLO EMBRIONARIO DE LOS MAMIFEROS OCURREN DIVERSOS EVENTOS DE VITAL IMPORTANCIA: (I) EL TRANSCRIPTOMA COMIENZA A REMODELARSE TRAS LA FERTILIZACION, MEDIANTE LA DEGRADACION DE LOS TRANSCRITOS MATERNOS Y LA ACTIVACION DEL GENOMA ZIGOTICO DURANTE LAS PRIMERAS DIVISIONES CELULARES; (II) PROCESOS MORFOGENETICOS SENCILLOS TRANSFORMAN EL ZIGOTO, UNICELULAR, EN UNA ESFERA HUECA CON UN MASA CELULAR EN SU INTERIOR (EL BLASTOCISTO); (III) EL POTENCIAL DE DIFERENCIACION SE VA RESTRINGIENDO GRADUALMENTE, DESDE UN ESTADIO TOTIPOTENTE A UNO PLURIPOTENTE; (IV) SE ESPECIFICAN LOS PRIMEROS LINAJES CELULARES (EL TROFOBLASTO Y LA MASA CELULAR INTERNA); Y (V) EL EMBRION SE IMPLANTA EN EL UTERO MATERNO Y SE DESARROLLA LA PLACENTA, AUNQUE SE SABE QUE LA REGULACION A NIVEL TRANSCRIPCIONAL DE CIERTOS GENES ES NECESARIA PARA ESTOS PROCESOS, LOS ROLES QUE DESEMPEÑA EL SPLICING ALTERNATIVO EL PROCESAMIENTO DIFERENCIAL DE LOS INTRONES Y EXONES PARA GENERAR MULTIPLES ISOFORMAS DE MRNA Y PROTEINA A PARTIR DE UN MISMO LOCUS EN ESTOS EVENTOS SON DESCONOCIDOS, EL OBJETIVO GLOBAL DE ESTE PROYECTO ES INVESTIGAR ESAS FUNCIONES, A PARTIR DEL ANALISIS DE MILES DE MILLONES DE SECUENCIAS DE RNA-SEQ DE BLASTOMEROS INDIVIDUALES Y GRUPOS DE EMBRIONES DESDE EL ESTADIO DE OOCITO A POST-IMPLANTACION Y MODELOS IN VITRO ASOCIADOS, HEMOS IDENTIFICADO DECENAS DE EXONES ALTERNATIVOS Y REGULADORES DE SPLICING QUE MUY PROBABLEMENTE JUEGUEN UN PAPEL IMPORTANTE EN ESTOS PROCESOS TEMPRANOS, EN ESTE PROYECTO, NOS CENTRAREMOS EN: (I) LA IMPORTANCIA FUNCIONAL DE DOS EVENTOS DE SPLICING ALTERNATIVO EN EL VIA DE SEÑALIZACION HIPPO PARA LA PRIMERA ESPECIFICACION DE LINAJE Y LA DIFERENCIACION CELULAR; (II) LA RELEVANCIA DEL PROCESAMIENTO ALTERNATIVO EN GENES DE LA RUTA DE SEÑALIZACION DE LA INSULINA Y DE SUS REGULADORES DE SPLICING PARA LA TRANSICION DEL ESTADO DE PLURIPOTENCIA "NAIVE" A "PRIMED"; Y (III) LOS ROLES QUE LOS FACTORES DE SPLICING DE LA FAMILIA MBNL JUEGAN EN EL DESARROLLO Y EVOLUCION DE LA PLACENTA, PARA ABORDAR ESTOS PROYECTOS USAREMOS UNA COMBINACION DE TECNOLOGIAS HIGH-THROUGHPUT (RNA-SEQ, SINGLE-CELL RNA-SEQ, ESPECTROMETRIA DE MASAS), METODOLOGIAS GENETICAS, BIOQUIMICAS Y CELULARES ESPECIFICAS, Y EXPERIMENTOS IN VIVO CON EMBRIONES DE RATON, PARA LOS PRIMEROS DOS OBJETIVOS USAREMOS EL SISTEMA CRISPR-CAS9 PARA GENERAR CELULAS MADRE EMBRIONARIAS QUE INCLUYAN O EXCLUYAN ESPECIFICAMENTE LOS EXONES DE INTERES, MIENTRAS QUE PARA EL TERCER OBJETIVO CONTAMOS YA CON LOS MODELOS KO DE RATON QUE NECESITAMOS, LOS RESULTADOS DE ESTOS EXPERIMENTOS NOS DARAN UNA PRIMERA VISION DEL IMPACTO FUNCIONAL QUE EL SPLICING ALTERNATIVO TIENE EN LA PLURIPOTENCIA Y EL DESARROLLO EMBRIONARIO TEMPRANO TANTO IN VITRO COMO IN VIVO, POR ELLO, ESTE PROYECTO COMPLETARA UN VACIO DE CONOCIMIENTO QUE EXISTE EN LA ACTUALIDAD EN NUESTRA COMPRENSION DE COMO LAS REDES GENICAS EN LAS MULTIPLES CAPAS DE REGULACION CONTROLAN, POR UN LADO, EL DESARROLLO TEMPRANO Y, POR OTRO, LA PLURIPOTENCIA Y LA CAPACIDAD DE RENOVACION DE LAS CELULAS MADRE, LAS CUALES SON ESENCIALES PARA SU USO EFECTIVO Y SEGURO EN APLICACIONES TERAPEUTICAS, LURIPOTENCIA\SPLICING ALTERNATIVO\TRANSCRIPTOMA\CÉLULAS MADRE EMBRIÓNICAS\PLACENTA
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