Descripción del proyecto
LAS RESPUESTAS ADAPTATIVAS AL AYUNO DE FOSFATO (PI) REPRESENTAN UN MODELO EMBLEMATICO PARA ESTUDIOS DE LA REGULACION DE LA ACTIVIDAD GENICA DESDE COMIENZOS DE LA BIOLOGIA MOLECULAR, EN PLANTAS, ESTE SISTEMA SUSCITA GRAN INTERES DEBIDO A SU POTENCIAL APLICADO PARA LA MEJORA DE PLANTAS QUE UTILICEN EFICIENTEMENTE EL PI, UN OBJETIVO DE LA AGRICULTURA SOSTENIBLE, MEDIANTE APROXIMACIONES GENETICAS DIRECTAS Y BIOQUIMICAS DIRIGIDAS SE HA IDENTIFICADO UN ALTO NUMERO DE GENES REGULADORES DE ESTE SISTEMA, EN EL QUE CABE RESALTAR FUNDAMENTALMENTE PHR1 Y FACTORES TRANSCRIPCIONALES (TFS) RELACIONADOS QUE ACTUAN COMO REGULADORES MAESTROS DE LAS RESPUESTAS AL AYUNO DE FOSFATO; SPX1 Y PROTEINAS RELACCIONADAS QUE ACTUAN COMO SENSORES DE PI VIA INOSITOL POLIFOSFATOS , ADEMAS DEL TIPO PHR1, SE HAN IDENTIFICADO OTROS TFS QUE REGULAN ALGUNAS DE ESTAS RESPUESTAS PERO SU RELACION FUNCIONAL CON PHR1 NO SE HA ESTABLECIDO, LA MODIFICACION DE LA ACTIVIDAD DE ESTOS U OTROS REGULADORES IDENTIFICADOS POR TECNICAS DE GENETICA DIRECTA/BIOQUIMICAS, SI BIEN SE HA DEMOSTRADO QUE IMPACTA A LAS RESPUESTAS AL AYUNO DE PI, TODAVIA NO HA TENIDO EXITO EN SU APLICACION BIOTECNOLOGICA PARA LA MEJORA DE LA UTILIZACION DE P, EN ESTE PROYECTO PROPONEMOS UN ABORDAJE GENETICO BASADO EN LA EXPLOTACION DE LA VARIACION NATURAL, UTILIZANDO APROXIMACIONES CLASICAS DE ANALISIS DE QTLS Y GWAS, PARA DEFINIR REDES TRANSCRIPCIONALES Y SU INTERRELACION CON REDES METABOLICAS (DE AMINOACIDOS Y HORMONAS), ASI COMO PARA LA IDENTIFICACION DE GENES/MOTIVOS REGULADORES (TRANS/CIS) CLAVE, QUE AL MOSTRAR VARIACION NATURAL SON POTENCIALMENTE MAS ADECUADOS PARA SU UTILIZACION BIOTECNOLOGICA, TAMBIEN, PROPONEMOS EXPLORAR A NIVEL GLOBAL MECANISMOS REGULADORES SUPERPUESTOS, TALES COMO LOS QUE DETERMINAN LAS INTERACCIONES INTERCROMATINICAS Y LOS QUE AFECTAN A LA FORMACION DE DNA CIRCULAR EXTRACROMOSOMICO (ECCDNA), CON OBJETO DE EVALUAR SU IMPACTO EN REGULACION DE LAS RESPUESTAS AL AYUNO DE PI Y POR EXTENSION DE CUALQUIER PROCESO BIOLOGICO, LOS OBJETIVOS ESPECIFICOS SON:1) EXPLOTACION DE LA VARIACION NATURAL DEL TRANSCRIPTOMA, METABOLOMA Y CARACTERES AGRONOMICOS RELACIONADOS CON CRECIMIENTO EN BAJO PI (CARTOGRAFIADO DE QTLS Y GWAS) PARA LA:1,1) INTEGRACION DE REDES TRANSCRIPCIONALES/METABOLICAS Y CORRELACION CON CARACTERES AGRONOMICOS(BIOMASA, RATIO RAIZ/PARTE AEREA, CONTENIDO EN PI Y AGUA ETC)1,2) IDENTIFICACION DE ALELOS NATURALES DE GENES REGULADORES DE CARACTERES MOLECULARES METABOLICOS O AGRONOMICOS RELEVANTES:1,3) DEFINICION DE MOTIVOS CIS-REGULADORES IMPORTANTES: LA VARIACION NATURAL COMO FUENTE DE MUTANTES EN MOTIVOS CIS 2) ESTUDIOS SOBRE LA ARQUITECTURA CROMATINICA EN LA RESPUESTA AL AYUNO DE FOSFATO2,1) DEFINICION DE INTERACCIONES CROMATINICAS A NIVEL GLOBAL, MEDIANTE LA TECNICA HI-C2,2) ANALISIS DE LA BASE GENETICA DE LAS INTERACCIONES INTERCROMATINICAS DURANTE EL AYUNO DE PI, EFECTO DE MUTACIONES EN GENES REGULADORES Y ANALISIS DE LA VARIACION NATURAL EN ECOTIPOS SELECCIONADOS3) ESTUDIOS GLOBALES SOBRE LA ALTERACIONES Y MOVILIDAD DE ECCDNAS EN LA RESPUESTA AL AYUNO DE PI3,1) ANALISIS DE ECCDNAS Y SU MOVILIDAD INTERORGANOS EN RESPUESTA AL AYUNO DE PI, MEDIANTE CIRCLE-SEQ3,2) ANALISIS DE LA BASE GENETICA DE LA FORMACION DE ECCDNAS DURANTE EL AYUNO DE PI, EFECTO EN ECCDNAS DE MUTACIONES EN GENES REGULADORES Y ANALISIS DE LA VARIACION NATURAL EN ECOTIPOS SELECCIONADO ARABIDOPSIS\HOMEOSTASIS FOSFATO\VARIACIÓN NATURAL\GWAS\CAPTURA DE CONFORMACIÓN CROMOSOMAL\DNA EXTRACROMOSOMAL CIRCULAR