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PID2020-118750RB-I00

Financiado

NUEVOS REGULADORES DE LA RESPUESTA AL AYUNO DE FOSFATO EN PLANTAS. IDENTIFICACIO...

NUEVOS REGULADORES DE LA RESPUESTA AL AYUNO DE FOSFATO EN PLANTAS. IDENTIFICACION MEDIANTE EL ANALISIS GWA Y DE REDES TRANSCRIPCIONALES EN ARABIDOPSIS Y CARDAMINE LAS PLANTAS HAN DESARROLLADO UNA SERIE DE RESPUESTAS ADAPTATIVAS QUE LES PERMITEN CRECER BAJO REGIMENES LIMITANTES DE FOSFATO (PI). ESTAS RESPUESTAS CONSTITUYEN EL SISTEMA DE RESCATE DEL AYUNO DE FOSFATO, QUE REPRESENTA UN MODELO... ver más

01/01/2020

CSIC

254K€

Presupuesto del proyecto: 254K€

Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2020-01-01

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Participantes

CSIC

Lider

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Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA...

TRL 2-3 | 552M€

Presupuesto del proyecto 254K€

Descripción del proyecto LAS PLANTAS HAN DESARROLLADO UNA SERIE DE RESPUESTAS ADAPTATIVAS QUE LES PERMITEN CRECER BAJO REGIMENES LIMITANTES DE FOSFATO (PI). ESTAS RESPUESTAS CONSTITUYEN EL SISTEMA DE RESCATE DEL AYUNO DE FOSFATO, QUE REPRESENTA UN MODELO EMBLEMATICO PARA ESTUDIOS SOBRE REGULACION GENICA DESDE LOS INICIOS DE LA BIOLOGIA MOLECULAR. ADEMAS, ESTE SISTEMA TIENE INTERES APLICADO POR SU POTENCIAL PARA PERMITIR LA OBTENCION DE PLANTAS CON EFICIENCIA MEJORADA EN LA ADQUISICION Y USO DE PI, MAS ADECUADAS PARA LA AGRICULTURA SOSTENIBLE. EN LOS ULTIMOS AÑOS SE HAN LOGRADO AVANCES CONSIDERABLES EN LA DISECCION DE LA RUTA DE SEÑALIZACION DEL AYUNO DE PI EN PLANTAS MEDIANTE APROXIMACIONES DE GENETICA DIRECTA E INVERSA, QUE SE REFLEJAN EN LA IDENTIFICACION DE MAS DE 15 COMPONENTES REGULADORES. SIN EMBARGO, ESTOS REGULADORES CONOCIDOS AUN NO HAN DEMOSTRADO SU UTILIDAD BIOTECNOLOGICA. UNA APROXIMACION MAS APROPIADA PARA IDENTIFICAR REGULADORES CON VALOR APLICADO ES LA EXPLOTACION DE ESTRATEGIAS BASADAS EN LA VARIACION NATURAL. LOS GENES ASI IDENTIFICADOS SON POTENCIALMENTE MAS ADECUADOS PARA SU APLICACION PORQUE ES POCO PROBABLE QUE LAS MUTACIONES DELETEREAS SOBREVIVAN EN LA NATURALEZA. EN NUESTRO PROYECTO ANTERIOR INICIAMOS UN ESTUDIO DE LA VARIACION NATURAL DEL SISTEMA DE RESCATE DEL AYUNO DE FOSFATO EN ARABIDOPSIS BASADO EN GWAS. EL OBJETIVO DE ESTE PROYECTO ES POTENCIAR Y AMPLIAR ESTOS ESTUDIOS EN CURSO MEDIANTE LA REALIZACION DE UN ANALISIS GWA COMPARATIVO ENTRE ARABIDOPSIS Y UNA ESPECIE RELACIONADA, CARDAMINE HIRSUTA, Y COMBINARLO CON EL ANALISIS DE REDES TRANSCRIPCIONALES. PARA CONSTRUIR LAS REDES TRANSCRIPCIONALES, UTILIZAREMOS DATOS TRANSCRIPTOMICOS DE PARTES AEREAS DE LAS ACCESIONES UTILIZADAS EN LOS ESTUDIOS GWA, ASI COMO DE CELULAS INDIVIDUALES DE PARTES AEREAS DE ARABIDOPSIS (SCRNA-SEQ), LO QUE PERMITE LA INFERENCIA DE REDES DE TRANSCRIPCION A NIVEL DE TIPO CELULAR Y POR TANTO PROPORCIONARA UNA VISION DE LA RESPUESTA MOLECULAR AL AYUNO DE PI CON UNA RESOLUCION SIN PRECEDENTES. EN CONJUNTO, ADEMAS DE DESCRIBIR LAS RESPUESTAS AL AYUNO DE PI A ALTA RESOLUCION E IDENTIFICAR GENES CON POTENCIAL BIOTECNOLOGICO, EL PROYECTO PROPORCIONARA UNA VISION INTEGRAL DE COMO DE CONSERVADA ESTA LA ARQUITECTURA DE LAS REDES TRANSCRIPCIONALES DE PLANTAS SOMETIDAS AL AYUNO DE PI Y LA SIMILITUD EN EL PATRON DE VARIACION NATURAL DE LOS REGULADORES DE LAS RESPUESTAS AL AYUNO DE PI ENTRE DOS ESPECIES RELACIONADAS. LOS OBJETIVOS ESPECIFICOS SON: 1) REDES TRANSCRIPCIONALES EN PLANTAS DE ARABIDOPSIS Y CARDAMINE HIRSUTA SOMETIDAS AL AYUNO DE PI1.1) RNA-SEQ DE CELULAS INDIVIDUALES DE PARTES AEREAS DE ARABIDOPSIS SOMETIDAS AL AYUNO DE PI. 1.2) ANALISIS TRANSCRIPTOMICO DE LA COLECCION IBERICA DE ACCESIONES DE CARDAMINE HIRSUTA Y SU INTEGRACION CON DATOS DE CARACTERES FISIOLOGICOS. 2) GWAS COMPARATIVO ENTRE CARDAMINE HIRSUTA Y ARABIDOPSIS THALIANA COMBINADO CON DATOS DE REDES TRANSCRIPCIONALES 2.1) IDENTIFICACION DE SNPS QUE AFECTAN A CARACTERES MOLECULARES (TRANSCRIPTOMICOS) Y AGRONOMICOS RELEVANTES EN CARDAMINE HIRSUTA. 2.2) INTEGRACION DE DATOS DE GWAS DE ARABIDOPSIS Y CARDAMINE Y DE SUS REDES TRANSCRIPCIONALES PARA INCREMENTAR LA SENSIBILIDAD Y RESOLUCION DEL ANALISIS GWA Y PARA EL ANALISIS COMPARATIVO DE PATRONES DE VARIACION NATURAL ENTRE AMBAS ESPECIES 2.3) VALIDACION Y CARACTERIZACION DE QTLS CANDIDATOS/GENES REGULADORES MAESTROS ESPECIFICOS DEL TIPO CELULAR. RABIDOPSIS\SCRNA-SEQ\REDES TRANSCRIPCIONALES\NUTRICION P.\SEÑALIZACION\GWAS\CARDAMINE

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