Descripción del proyecto
EL VIRUS DE LA HEPATITIS C (VHC) CAUSA GRAVES ENFERMEDADES HEPATICAS INCLUYENDO CIRROSIS Y HEPATOCARCINOMA, EL TRATAMIENTO QUE SE EMPLEA EN LA ACTUALIDAD, COMBINACION DE INTERFERON Y RIBAVIRINA, OBTIENE RESPUESTA VIRAL SOSTENIDA UNICAMENTE EN EL 50% DE LOS CASOS DE INFECCION POR GENOTIPO 1, EL MAYORITARIO, ADEMAS, ESTE TRATAMIENTO PROVOCA SERIOS EFECTOS SECUNDARIOS RESPONSABLES DE UN ELEVADO NUMERO DE ABANDONOS DEL TRATAMIENTO, POR TODO ELLO, EL ESTUDIO DE NUEVAS DIANAS TERAPEUTICAS EN LA INFECCION POR VHC ES UN AREA PRIORITARIA, UNA DE LAS DIANAS CON MAYORES POSIBILIDADES ES LA POLIMERASA DEL VHC (PROTEINA NS5B), EXISTEN DOS GRANDES GRUPOS DE COMPUESTOS QUE INHIBEN LA ACTIVIDAD POLIMERASA, ANALOGOS (NI) Y NO ANALOGOS DE NUCLEOSIDO (NNI), Y DENTRO DE LOS NNI EXISTEN CUATRO GRANDES FAMILIAS DEPENDIENDO DEL SITIO DE UNION (NNI-1, NNI-2, NNI-3 Y NNI-4), CUANDO SE HA PROBADO SU ACTIVIDAD EN SISTEMAS DE CULTIVOS CELULARES SE HAN PODIDO RESCATAR MUTANTES DE RESISTENCIA FRENTE A TODOS ELLOS, POR TANTO, EL DISEÑO DE NUEVAS ESTRATEGIAS ANTIVIRALES DEBE CONTINUAR, LA OLIGOMERIZACION DE POLIMERASAS VIRALES Y LA FUNCION QUE ESTAS INTERACCIONES TIENEN EN EL CICLO REPLICATIVO DE LOS VIRUS IN VIVO HA COBRADO UNA GRAN IMPORTANCIA EN LOS ULTIMOS AÑOS PARA UN GRAN NUMERO DE VIRUS ARN DE CADENA POSITIVA Y NEGATIVA, PARA LA POLIMERASA DE VHC SE CONOCEN ALGUNOS DE LOS RESIDUOS IMPLICADOS AUNQUE LA FINALIDAD DE ESTA INTERACCION ES TOTALMENTE DESCONOCIDA, LA NECESIDAD DE MANTENER UNA ESTRUCTURA COMPACTA DURANTE LA INICIACION DE NOVO PODRIA ESTAR RELACIONADA CON LA REGULACION ALOSTERICA MEDIANTE GTP Y LA INTERACCION CON OTRAS NS5B, Y DESENTRAÑAR ESTA RELACION ES EL OBJETIVO FINAL DE ESTA PROPUESTA, PARA ELLO NOS PROPONEMOS: 1, DEFINIR MEDIANTE LA TECNICA DE FRET LOS AMINOACIDOS IMPLICADOS EN EL PROCESO DE OLIGOMERIZACION, PARA ELLO NOS CENTRAREMOS EN LA INTERACCION DE LOS RESIDUOS DE LA HELICE T CON OTRAS POSICIONES, BASANDONOS EN CRITERIOS ESTRUCTURALES,2, ESTABLECER UN SISTEMA QUE NOS PERMITA DIFERENCIAR LAS FASES DE INICIACION DE NOVO Y ELONGACION DE CEBADOR, SE TENDRA EN CUENTA EL EMPLEO DE MOLDES CON Y SIN CITOSINAS POR SER EL GTP UNA MOLECULA CON POTENCIAL CAPACIDAD DE REGULACION ALOSTERICA EN LA SINTESIS MEDIADA POR LA NS5B DE VHC,3, ANALIZAR EL EFECTO SOBRE LA CAPACIDAD DE OLIGOMERIZACION Y DE INICIACION DE NOVO DE LA SINTESIS DE MUTACIONES QUE AFECTAN BIEN A LA CONFORMACION CERRADA DE LA ENZIMA (POSICIONES TRP397 E HIS428) BIEN A LA OLIGOMERIZACION (HIS502 Y OTRAS POSICIONES DEFINIDAS EN EL OBJETIVO 1),4, ANALIZAR EL EFECTO DEL GTP EN LA SINTESIS DE ARN INDEPENDIENTEMENTE DE SU INCORPORACION COMO SUSTRATO, PARA ELLO SE EMPLEARAN MOLDES QUE CAREZCAN DE C¿S Y NO NECESITEN LA INCORPORACION DE G¿S (TANTO HOMOPOLIMERICOS COMO HETEROPOLIMERICOS),