Descripción del proyecto
LAS INFECCIONES VIRICAS PERSISTENTES IMPLICAN EL ESTABLECIMIENTO DE UNA INTERACCION COORDINADA VIRUS-CELULA CAPAZ DE PERMITIR, DE FORMA COINCIDENTE, LA REPLICACION DEL VIRUS Y LA PROLIFERACION CELULAR. EL VIRUS DE LA BURSITIS INFECCIOSA (IBDV), UNO DE LOS PATOGENOS AVIARES MAS IMPORTANTES PARA LA INDUSTRIA AVICOLA, CAUSA INFECCIONES AGUDAS QUE PUEDEN PROGRESAR HACIA EL ESTABLECIMIENTO DE INFECCIONES PERSISTENTES ASINTOMATICAS. DE HECHO, AVES PERSISTENTEMENTE INFECTADAS PUEDEN CONSTITUIR RESERVORIOS NATURALES DEL VIRUS, CONTRIBUYENDO A SU DISEMINACION. A PESAR DE LA IMPORTANCIA DE LA PERSISTENCIA EN LA EPIDEMIOLOGIA DE IBDV, LA INVESTIGACION SOBRE LOS MECANISMOS QUE LA DESENCADENAN ES CASI INEXISTENTE. EL TRABAJO LLEVADO A CABO GRACIAS A LA ANTERIOR SUBVENCION DEL MCI, NOS HA PERMITIDO AVANZAR EN EL ESTUDIO DE LA CAPACIDAD DE IBDV PARA ESTABLECER INFECCIONES PERSISTENTES PROLONGADAS EN LINEAS CELULARES AVIARES Y HUMANAS. UTILIZANDO ESTOS MODELOS EXPERIMENTALES VIRUS/CELULA, HEMOS COMPROBADO QUE LA PERSISTENCIA IMPLICA UNA REGULACION NEGATIVA EN LA REPLICACION DEL VIRUS. ESTA REGULACION, ES ESENCIAL PARA LA SUPERVIVENCIA CELULAR TRAS LA FASE AGUDA DE INFECCION Y LA POSTERIOR APARICION Y SELECCION DE CLONES CELULARES SUPERVIVIENTES. LOS DATOS PRELIMINARES UTILIZANDO LA TECNOLOGIA RNA-SEQ INDICAN QUE ESTA REGULACION NEGATIVA SE DEBE A LA ACUMULACION DE ARN VIRALES DEFECTIVOS (DVG) EN EL CITOPLASMA DE LAS CELULAS INFECTADAS, QUE CONTIENEN GRANDES DELECIONES DEL GENOMA. ESTOS DVGS MANTIENEN UNA CAPACIDAD DE TRANSCRIPCION Y REPLICACION SIMILAR A LA DE LOS SEGMENTOS GENOMICOS VIRALES DE LONGITUD COMPLETA. DE FORMA SIMILAR A OTROS SISTEMAS VIRALES, LOS DVGS DE IBDV PODRIAN COMPETIR EFICAZMENTE CON LOS ARN GENOMICOS VIRALES POR LA MAQUINARIA DE TRANSCRIPCION/REPLICACION/TRADUCCION, DISMINUYENDO ASI LA CAPACIDAD DE REPLICACION DEL VIRUS. EL PRESENTE PROYECTO TIENE COMO OBJETIVO REALIZAR UNA PROFUNDA CARACTERIZACION DE LOS DVGS DE IBDV QUE SE GENERAN TANTO IN VITRO COMO IN VIVO. PARA ELLO, SE UTILIZARAN DOS ENFOQUES COMPLEMENTARIOS DE SECUENCIACION NGS: (I) EL ANALISIS CONVENCIONAL RNA-SEQ BASADO EN ILUMINA, Y (II) LA SECUENCIACION NANOPORE DE RNAS DE LONGITUD COMPLETA, LO QUE PERMITIRA UNA CUANTIFICACION PRECISA Y UNA CARACTERIZACION COMPLETA DE LOS RNAS DEL IBDV. ESTE ESTUDIO SE LLEVARA A CABO TANTO EN CULTIVOS CELULARES INFECTADOS, COMO EN CULTIVOS CELULARES INFECTADOS PERSISTENTEMENTE A LARGO PLAZO. ESTOS ESTUDIOS SE LLEVARAN A CABO TAMBIEN EN LINFOCITOS DE POLLO INFECTADOS EX VIVO Y EN LINFOCITOS BURSALES OBTENIDOS A PARTIR DE BOLSAS DE FABRICIO CORRESPONDIENTES A POLLOS INFECTADOS EXPERIMENTALMENTE CON IBDV. ASIMISMO, NUESTROS ESTUDIOS PERMITIRAN CARACTERIZAR EL IMPACTO DE LAS DVGS EN LA REPLICACION DEL VIRUS Y SU POSIBLE PAPEL EN LA INDUCCION DE UNA RESPUESTA CELULAR DE SUPERVIVENCIA. FINALMENTE, LA IDENTIFICACION DEL REPERTORIO DE DVGS EN CELULAS INFECTADAS PERSISTENTEMENTE A LARGO PLAZO, Y RESISTENTES A LA SUPERINFECCION POR IBDV, SERA DE GRAN UTILIDAD PARA EL DESARROLLO DE LINEAS CELULARES DE POLLO ESTABLES RESISTENTES A LA INFECCION POR IBDV. EL PROYECTO PROPUESTO SERA LLEVADO A CABO POR UN EQUIPO DE INVESTIGACION INTERNACIONAL Y MULTIDISCIPLINAR, QUE REUNIRA INVESTIGADORES CON CONTRASTADA EXPERIENCIA EN BIOLOGIA MOLECULAR, INMUNOLOGIA Y EPIDEMIOLOGIA DEL IBDV, INFECCIONES EXPERIMENTALES AVIARIAS Y ANALISIS BIOINFORMATICOS. BDV\INMUNIDAD GENETICA\INTERFERON\GENOMAS VIRALES DEFECTIVOS INTERFERENTES\GENOMICA FUNCIONAL\PATOGENIA\PERSISTENCIA\GUMBORO