Descripción del proyecto
ENTENDER LOS MECANISMOS QUE ALTERAN LA ESTABILIDAD DE LOS GENOMAS ES CLAVE EN LA BIOLOGIA MOLECULAR Y BIOMEDICINA, DADO SU IMPACTO EN CANCER Y EN UN NUMERO DE ENFERMEDADES GENETICAS CONOCIDAS COMO RARAS, UN TIPO DE INESTABILIDAD PARTICULARMENTE IMPORTANTE ES EL ASOCIADO A TRANSCRIPCION, LA TRANSCRIPCION DE UNA SECUENCIA DE DNA AUMENTA SU FRECUENCIA DE RECOMBINACION, UN FENOMENO REFERIDO COMO RECOMBINACION ASOCIADA A TRANSCRIPCION (TAR, DEL INGLES "TRANSCRIPTION-ASSOCIATED RECOMBINATION") DE CONSECUENCIAS IMPORTANTES EN LA DINAMICA DE LOS GENOMAS, DURANTE LA TRANSCRIPCION SE FORMAN REGIONES TRANSITORIAS DE DNA DE CADENA SENCILLA (SSDNA) COMO CONSECUENCIA DE LA DESNATURALIZACION DEL DNA CAUSADA POR EL SUPERENROLLAMIENTO NEGATIVO LOCAL QUE SE ACUMULA DETRAS DE UNA RNA POLIMERASA (RNAP) ACTIVA, COMO RESULTADO SE FORMAN LAS ESTRUCTURAS DE HIBRIDOS DE DNA-RNA QUE TIENEN UN IMPACTO CLAVE EN LA INESTABILIDAD DE LOS GENOMAS, EL OBJETIVO DE ESTE PROYECTO ES DEFINIR LOS MECANISMOS Y FACTORES RESPONSABLES DEL FENOMENO DE TAR COMO UNA DE LAS FUENTES PRINCIPALES DE INESTABILIDAD GENOMICA, EL PROYECTO PERSIGUE REALIZAR UN ANALISIS GENOMICO DE LAS FUNCIONES Y ELEMENTOS QUE ACTUAN EN TRANS Y EN CIS, ES DECIR, LOS GENES Y SECUENCIAS DE DNA QUE CONTROLAN TAR, ENTRE DICHOS ELEMENTOS, ANALIZAREMOS CON MAS DETALLE LOS HIBRIDOS DE DNA-RNA, EL PROYECTO SE BASA EN UNA APROXIMACION GENOMICA Y MULTIDISCIPLINAR QUE USARA EL ORGANISMO MODELO SACCHAROMYCES CEREVISIAE, EL NEMATODO CAENORHABDITIS ELEGANS Y DIFERENTES TIPOS DE LINEAS CELULARES HUMANAS, LOS OBJETIVOS CONCRETOS SERAN: 1) DETERMINAR LA ESTRUCTURA DE LOS MRNPS DE MUTANTES QUE FORMAN HIBRIDOS DNA-RNA; 2) IDENTIFICAR LOS GENES Y FACTORES QUE CONTROLAN ACTIVAMENTE LA FORMACION DE INTERMEDIARIOS RESPONSABLES DE TAR; 3) DEFINIR NUEVAS FUNCIONES QUE CONECTEN LA BIOGENESIS DE LOS MRNPS CON LOS HIBRIDOS DE DNA-RNA Y LA INESTABILIDAD GENOMICA; 4) DETERMINAR EL PAPEL DE LA ESTRUCTURA Y REMODELACION DE LA CROMATINA EN LA INESTABILIDAD GENOMICA ASOCIADA A TRANSCRIPCION; 5) ESTUDIAR LOS MECANISMOS POR LOS QUE LOS HIBRIDOS DE DNA-RNA AFECTAN A LAS MODIFICACIONES DE HISTONAS IMPLICADAS EN HETEROCROMATINA Y CONDENSACION DE LA CROMATINA, Y 6) DEFINIR A ESCALA GENOMICA LA BASE MOLECULAR DE LA CONEXION DE LA REPLICACION DEFECTUOSA Y LOS DAÑOS EN EL DNA CON LA ESTRUCTURA DE LA CROMATINA EN CELULAS EUCARIOTAS QUE ACUMULAN HIBRIDOS DE DNA-RNA, EL OBJETIVO FINAL DEL PROYECTO ES PROPORCIONAR UN MODELO DE TRABAJO PARA ENTENDER LOS MECANISMOS DE TAR Y SU RELEVANCIA GLOBAL COMO FUENTE NATURAL DE INESTABILIDAD GENOMICA, COMO BASE DEL CANCER Y UN NUMERO DE ENFERMEDADES GENETICAS, INESTABILIDAD GENÓMICA\ HÍBRIDOS DNA-RNA\ REPLICACIÓN\ REPARACIÓN\ ROTURAS CROMOSÓMICAS\ CÁNCER\ EUCARIOTAS\ TRANSCRIPCIÓN