Descripción del proyecto
LA INESTABILIDAD GENOMICA ES UN FENOMENO RELACIONADO CON EL CANCER Y ALGUNAS ENFERMEDADES HEREDITARIAS CUYO ORIGEN ESTA ASOCIADO A FALLOS EN LA REPLICACION Y REPARACION DEL ADN, DURANTE LOS ULTIMOS 20 AÑOS, HEMOS INVESTIGADO LOS MECANISMOS QUE DAN LUGAR A LA INESTABILIDAD EN ORGANISMOS EUCARIOTAS, CON UN ENFASIS ESPECIAL EN LA INESTABILIDAD ASOCIADA A LA TRANSCRIPCION Y LA BIOGENESIS DEL ARNM, EN ESTE NUEVO PROYECTO, AMPLIAMOS NUESTRA INVESTIGACION A OTROS MECANISMOS DE INESTABILIDAD GENOMICA QUE OCURREN DEBIDO A LA RECOMBINACION, LOS CUALES SE ORIGINAN DURANTE LA REPLICACION Y DAN LUGAR A ROTURAS DE DOBLE CADENA, LOS SUCESOS Y MECANISMOS QUE VAMOS A ESTUDIAR INCLUYEN AQUELLOS ORIGINADOS COMO CONSECUENCIA DE FALLOS EN LA REPLICACION, EN LOS PUNTOS DE VERIFICACION DEL CICLO (¿CHECKPOINTS¿) DE FASE S Y EN LA REPARACION POR ESCISION DE NUCLEOTIDOS (NUCLEOTIDE EXISION REPAIR, NER), TANTO SI TIENEN O NO UN EFECTO SIMULTANEO EN LA TRANSCRIPCION, NUESTRA HIPOTESIS ES QUE LA MAYOR FUENTE DE INESTABILIDAD QUE DA LUGAR A REORGANIZACIONES CROMOSOMICAS SON LOS FALLOS EN LA REPLICACION QUE, DE UN MODO U OTRO, TERMINAN EN LA GENERACION DE ROTURAS EN EL ADN, NUESTROS OBJETIVOS SON: 1) IDENTIFICAR Y ANALIZAR A NIVEL MOLECULAR NUEVOS GENES Y PROTEINAS IMPLICADOS EN EL CONTROL DE BAJOS NIVELES DE RECOMBINACION MEDIANTE UNA APROXIMACION GENOMICA DE ALTO RENDIMIENTO; 2) INVESTIGAR EL PAPEL DE LAS REGIONES DE ADN DE CADENA SENCILLA Y LOS CORTES DE CADENA SENCILLA EN EL ORIGEN DE LA HIPER-RECOMBINACION; 3) ESTUDIAR LA INTERFAZ MOLECULAR ENTRE TRANSCRIPCION Y REPLICACION; 4) DEFINIR LAS BASES MOLECULARES DE LA INTERCONEXION ENTRE LA TRANSCRIPCION Y EL ENSAMBLAJE/TRANSPORTE DE LA RNPM A TRAVES DE PROTEINAS DEL COMPLEJO THO Y OTROS RELACIONADOS, Y COMO ESTA INTERCONEXION REPERCUTE EN LA INTEGRIDAD GENOMICA; 5) IDENTIFICAR FACTORES ESPECIFICOS CON UN PAPEL ESPECIFICO EN LA REPARACION DE DSBS MEDIANTE LA RECOMBINACION A TRAVES DE LA CROMATIDA HERMANA; 6) DETERMINAR LOS MECANISMOS DE LA HIPER-RECOMBINACION ASOCIADA A FALLOS EN LA REPARACION DE ROTURAS EN EL ADN MEDIANTE LA CROMATIDA HERMANA; Y 7) IDENTIFICAR FACTORES Y MECANISMOS IMPLICADOS EN EL ORIGEN DE LAS TRANSLOCACIONES CROMOSOMICAS, CON ESTE PROPOSITO, INVESTIGAREMOS LOS MECANISMOS POR LOS CUALES LA NER, LA REPLICACION, EL ¿CHECKPOINT¿ DE FASE S, LA ESTRUCTURA DE LA CROMATINA Y LAS PROTEINAS DE LA MAQUINARIA DE TRANSCRIPCION PUEDEN COMPROMETER LA INTEGRIDAD DEL GENOMA MEDIANTE LA RECOMBINACION A LO LARGO DEL CICLO CELULAR Y EN DIFERENTES REGIONES DEL ADN, INCLUYENDO LOS SITIOS FRAGILES, LA INVESTIGACION SE LLEVARA A CABO EN A) LA LEVADURA SACCHAROMYCES CEREVISIAE, LA CUAL SERVIRA COMO SISTEMA MODELO PARA LAS APROXIMACIONES GENETICAS Y MOLECULARES Y LA IDENTIFICACION DE NUEVOS GENES Y RUTAS, B) EN CAENORHABDITIS ELEGANS, QUE SERA UTILIZADO COMO ORGANISMO MODELO PARA ESTUDIAR EL PAPEL DE LA HIPER-RECOMBINACION EN EL DESARROLLO Y DURANTE LA MEIOSIS, Y C) EN CULTIVOS DE CELULAS HUMANAS, EN LOS CUALES SE EXPANDIRAN LOS RESULTADOS OBTENIDOS CON LA LEVADURA Y PERMITIRAN AMPLIAR DE FORMA MAS PROFUNDA LAS CONCLUSIONES A NIVEL DE BIOLOGIA CELULAR, SIENDO UNO DE LOS PROPOSITOS DEL PROYECTO EL DESARROLLO DE NUEVAS HERRAMIENTAS GENETICAS Y DE BIOLOGIA CELULAR PARA LA DETECCION DE INESTABILIDAD GENOMICA EN CELULAS HUMANAS, NUESTRO OBJETIVO FINAL ES IDENTIFICAR LOS FACTORES DE ALTO RIESGO Y LOS MECANISMOS DERIVADOS DE LA RECOMBINACION EN LA INESTABILIDAD GENOMICA,