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SAF2016-78041-C2-2-R

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IDENTIFICACION DE MODULOS ASOCIADOS A PATO-FENOTIPOS EN REDES MOLECULARES

EL OBJETIVO PRINCIPAL DE ESTE PROYECTO ES EL DESARROLLO DE NUEVAS METODOLOGIAS BASADAS EN REDES MOLECULARES PARA FILTRAR CONJUNTOS DE DATOS GENOMICOS ASOCIADOS A LAS ENFERMEDADES Y SUS FENOTIPOS, ASI COMO PARA OBTENER INFORMACION... ver más

01/01/2016

CSIC

48K€

Presupuesto del proyecto: 48K€

Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Fecha límite participación Sin fecha límite de participación.

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2016-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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CSIC

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Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Presupuesto del proyecto 48K€

Fecha límite de participación Sin fecha límite de participación.

Descripción del proyecto EL OBJETIVO PRINCIPAL DE ESTE PROYECTO ES EL DESARROLLO DE NUEVAS METODOLOGIAS BASADAS EN REDES MOLECULARES PARA FILTRAR CONJUNTOS DE DATOS GENOMICOS ASOCIADOS A LAS ENFERMEDADES Y SUS FENOTIPOS, ASI COMO PARA OBTENER INFORMACION SOBRE LOS MECANISMOS MOLECULARES SUBYACENTES A ESTAS ENFERMEDADES. A PARTIR DE UN CONJUNTO CRUDO DE ELEMENTOS GENOMICOS ASOCIADOS A UNA ENFERMEDAD O FENOTIPO (CNVS, GWAS, DATOS DE EXPRESION, ...) ESTOS ENFOQUES LOS COMBINAN CON INFORMACION SOBRE REDES MOLECULARES (RELACIONES ENTRE LAS ENTIDADES MOLECULARES) PARA LOCALIZAR MODULOS COHERENTES COMO UNA FORMA DE FILTRAR EL CONJUNTO ORIGINAL DE ELEMENTOS BUSCAR UN MECANISMO BIOLOGICO DETRAS DE LA ENFERMEDAD/FENOTIPO. TAL APROXIMACION ESTA APOYADO POR ESTUDIOS PREVIOS DE NUESTRO GRUPO Y OTROS QUE DEMUESTRAN QUE, TANTO LOS GENES ASOCIADOS A ENFERMEDADES COMO LOS ASOCIADOS A FENOTIPOS, FORMAN MODULOS COHERENTES EN INTERACTOMA. UNA GRAN PARTE DEL PROYECTO ESTARA ENCAMINADA A LA GENERACION DE UNA NUEVA RED MOLECULAR (RED DE SIMILITUDES DE CAMBIOS EPIGENOMICOS DE REGIONES CROMOSOMICAS) PARA COMPLEMENTAR LAS REDES EXISTENTES (INTERACTOMA, METABOLOMA, ...) EN LA BUSQUEDA DE MODULOS. EN ESTA RED, DOS REGIONES GENOMICAS ESTAN VINCULADAS SI SUS PATRONES DE CAMBIOS EPIGENETICOS SON SIMILARES EN UNA SERIE AMPLIA DE MUESTRAS; Y SE GENERAN A PARTIR DE LOS CONJUNTOS DE DATOS MASIVOS EPIGENOMICOS EXPERIMENTALES DISPONIBLES EN LA ACTUALIDAD. UNA VENTAJA DE ESTA RED RESPECTO A LAS YA EXISTENTES, CENTRADAS EN GENES/PROTEINAS, ES QUE REPRESENTA RELACIONES GENERICAS ENTRE REGIONES GENOMICAS, QUE PUEDEN CONTENER GENES O NO, Y POR LO TANTO ES MAS ADECUADA PARA EXPLICAR ALGUNOS DATOS GENOMICOS ASOCIADOS A LA ENFERMEDAD QUE EN ALGUNOS CASOS NO PUEDE RASTREARSE HASTA GENES (POR EJEMPLO, GRANDES REGIONES DE CNVS). EN CONSECUENCIA, ESTE ENFOQUE PARA LA LOCALIZACION DE VINCULOS ENTRE ELEMENTOS GENOMICOS A PARTIR DE DATOS EPIGENOMICOS GENERA UN CONJUNTO GENERICO DE RELACIONES QUE REPRESENTAN DIFERENTES TIPOS DE ASOCIACIONES BIOLOGICAS (INTERACCIONES GEN-GEN, RELACION FACTOR DE TRANSCIPCION-GEN CONTROLADO, INTERACCION ENHANCER-PROMOTOR, ETC.) UTILIZANDO ESTA NUEVA RED ASI COMO LAS YA EXISTENTES, APLICAREMOS METODOLOGIAS EXISTENTES Y DESARROLLADAS AD-HOC PARA ESTE PROYECTO PARA LOCALIZAR MODULOS EN ELLAS Y MAPEAR EN ESTOS LOS GENES Y/O ELEMENTOS GENETICOS. ENOTIPO PATOLÓGICO\ENFERMEDAD RARA\RED MOLECULAR\MEDICINA SISTEMAS\MÓDULO DE RED\DESÓRDEN GENÉTICO

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