Descripción del proyecto
EL OBJETIVO PRINCIPAL DE ESTE PROYECTO ES EL DESARROLLO DE NUEVAS METODOLOGIAS BASADAS EN REDES MOLECULARES PARA FILTRAR CONJUNTOS DEDATOS GENOMICOS ASOCIADOS A LAS ENFERMEDADES Y SUS FENOTIPOS, ASI COMO PARA OBTENER INFORMACION SOBRE LOS MECANISMOS MOLECULARES SUBYACENTES A ESTAS ENFERMEDADES, A PARTIR DE UN CONJUNTO CRUDO DE ELEMENTOS GENOMICOS ASOCIADOS A UNA ENFERMEDAD O FENOTIPO (CNVS, GWAS, ,,,) ESTOS ENFOQUES LOS COMBINAN CON INFORMACION SOBRE REDES MOLECULARES (RELACIONES ENTRE LAS ENTIDADES MOLECULARES) PARA LOCALIZAR MODULOS COHERENTES COMO UNA FORMA DE FILTRAR EL CONJUNTO ORIGINAL DE ELEMENTOS BUSCAR UN MECANISMO BIOLOGICO DETRAS DE LA ENFERMEDAD/FENOTIPO, TAL APROXIMACION ESTA APOYADO POR ESTUDIOS PREVIOS DE NUESTRO GRUPO Y OTROS QUE DEMUESTRAN QUE, TANTO LOS GENES ASOCIADOS A ENFERMEDADES COMO LOS ASOCIADOS A FENOTIPOS, FORMAN MODULOS COHERENTES EN INTERACTOMA, PARTIENDO DE UNA SERIE DE GENES PRESENTES EN CNVS ASOCIADOS A FENOTIPOS DE ENFERMEDADES RARAS PROPORCIONADOS POR EL GRUPO COLABORADOR DEL PROYECTO COORDINADO, USAREMOS DISTINTAS ESTRATEGIAS DE NETWORK PROPAGATION PARA LOCALIZAR LOS MODULOS TOPOLOGICOS ASOCIADOS A ESOS GENES EN DISTINTAS REDES MOLECULARES, NOS PROPONEMOS MEJORAR TAMBIEN UNA METODOLOGIA PARA LA DETECCION DE REGIONES CROMOSOMICAS RELACIONADAS FUNCIONALMENTE BASADA EN BUSCAR COMPORTAMIENTOS EPIGENETICOS CORRELACIONADOS, ESTA METODOLOGIA PERMITIRIA INTERPRETAR FUNCIONALMENTE LOS CNV QUE NO CODIFICASEN GENES, USANDO EL PRINCIPIO DE CULPABLE POR ASOCIACION,TAMBIEN PRETENDEMOS EXTRAER RELACIONES ENTRE FENOTIPOS HPO Y PROCESOS BIOLOGICOS GO POR TECNICAS DE MINADO DE TEXTO EN LITERATURA CIENTIFICA, ENTRE OTRAS COSAS, ESTO NOS PERMITIRA EVALUAR LOS PROCESOS BIOLOGICOS RELACIONADOS CON LOS MODULOS DE RED DETECTADOS ANTERIORMENTE, POR OTRA PARTE, Y BASANDONOS EN TRABAJOS NUESTROS ANTERIORES EN QUE EVALUABAMOS LA COHERENCIA MOLECULAR DE LOS PROCESOS BIOLOGICOS DEFINIDOS EN GO, PRETENDEMOS HACER LOS MISMO PARA LOS FENOTIPOS HPO, PARA ASI LOCALIZAR FENOTIPOS SIN SOPORTE MOLECULAR QUE PUDIESEN SER CONCEPTUALIZACIONES IMPUESTAS Y ASI DESCARTARLOS EN CIERTAS PARTES DEL PROYECTO, FINALMENTE, OTRO OBJETIVO ES OBTENER REDES MOLECULARES ESPECIFICAS DE TEJIDO, ASI COMO ASOCIACIONES HPO-TEJIDO, PARA RE-HACER LOS ESTUDIOS DEL PROYECTO DE MANERA TEJIDO-DEPENDIENTE, LO QUE PODRIA SER MUY IMPORTANTE DADA LA HETEROGENEIDAD MOLECULAR DE LOS TEJIDOS HUMANOS Y SU DISTINTA RELACION CON ENFERMEDADES, REDES BIOLOGICAS\BIOLOGIA DE SISTEMAS\FENOTIPO PATOLOGICO\ENFERMEDAD RARA\MODULO DE RED