HACIA LA PREDICCION DE LOS CAMBIOS DE ESTRUCTURA DE PROTEINAS DEBIDOS A UNION DE...
HACIA LA PREDICCION DE LOS CAMBIOS DE ESTRUCTURA DE PROTEINAS DEBIDOS A UNION DE LIGANDOS Y EVOLUCION.
ESTE PROYECTO PRETENDE DESARROLLAR NUEVOS METODOS DE BIOINFORMATICA ESTRUCTURAL PARA PREDECIR CAMBIOS DE ESTRUCTURAS DE PROTEINAS DEBIDOS A UNION DE LIGANDOS Y EVOLUCION DE UNA MANERA COMPUTACIONALMENTE ASEQUIBLE. ESTE OBJETIVO PU...
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Descripción del proyecto
ESTE PROYECTO PRETENDE DESARROLLAR NUEVOS METODOS DE BIOINFORMATICA ESTRUCTURAL PARA PREDECIR CAMBIOS DE ESTRUCTURAS DE PROTEINAS DEBIDOS A UNION DE LIGANDOS Y EVOLUCION DE UNA MANERA COMPUTACIONALMENTE ASEQUIBLE. ESTE OBJETIVO PUEDE TENER IMPORTANTES APLICACIONES PARA MEJORAR LA PREDICCION DE ESTRUCTURAS DE PROTEINAS BASADA EN HOMOLOGIA Y LAS PREDICCIONES COMPUTACIONALES DE LAS INTERACCIONES ENTRE PROTEINAS Y LIGANDOS, PARA ENTENDER MEJOR LOS CAMBIOS DE CONFORMACION EN LA FUNCION DE LAS PROTEINAS, Y PARA MODELAR DE FORMA CUANTITATIVA LA EVOLUCION ESTRUCTURAL DE LAS PROTEINAS. EN PARTICULAR, NOS PROPONEMOS PREDECIR LOS CAMBIOS ESTRUCTURALES EN LA EVOLUCION DE PROTEINAS, SOBRE TODO AQUELLOS RELACIONADOS CON LOS CAMBIOS DE FUNCION, QUE SON MAS DIFICILES E IMPORTANTES DE PREDECIR, PORQUE PUEDEN PROPORCIONAR INFORMACION SOBRE LOS CAMBIOS DE FUNCION, Y MODELAR Y PREDECIR LOS AJUSTES ESTRUCTURALES ENTRE LAS PROTEINAS Y LOS LIGANDOS QUE JUEGAN UN PAPEL CENTRAL EN LOS PROCESOS DE REGULACION ALOSTERICA Y CONSTITUYEN UNA SERIA LIMITACION PARA LOS METODOS COMPUTACIONALES DE DISEÑO RACIONAL DE FARMACOS.ESTE PROYECTO ES LA CONTINUACION DEL ANTERIOR PROYECTO DE INVESTIGACION DE NUESTRO GRUPO, Y SE BASARA SOBRE NUESTROS RESULTADOS ANTERIORES. EN PARTICULAR, ESTAMOS DESARROLLANDO UNA NUEVA METODOLOGIA PARA SIMULAR LA DINAMICA ELASTICA DE LAS PROTEINAS EN EL ESPACIO DE LOS ANGULOS DE TORSION. ESTE ESPACIO PRESENTA LA VENTAJA DE EVITAR DISTORSIONAR LA GEOMETRIA COVALENTE DE LA PROTEINA, Y PERMITE REPRESENTAR UN GRAN NUMERO DE ATOMOS USANDO SOLO DOS GRADOS DE LIBERTAD POR RESIDUO. EL MODELO DE RED ELASTICA PERMITIRA REDUCIR MOVIMIENTOS POCO FISICOS QUE PRODUCEN COLISIONES ATOMICAS. DE ESTA MANERA, EL PASO TEMPORAL PUEDE SER MUCHO MAS GRANDE Y LA DINAMICA MUCHO MAS RAPIDA QUE LA DINAMICA MOLECULAR CONVENCIONAL. EN ESTE MARCO, QUEREMOS PREDECIR LOS CAMBIOS DE CONFORMACION DE LA PROTEINA COMO RESPUESTA ELASTICA DE LA PROTEINA A PERTURBACIONES SEGUN UN CAMPO DE FUERZA EFECTIVO QUE ESTAMOS DESARROLLANDO. ROTEINAS\MODELADO POR HOMOLOGIA\DISEÑO DE FARMACOS\MODOS NORMALES\CAMBIOS DE CONFORMACION
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