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PID2021-127503OB-I00

Financiado

EXPLORANDO "METAMORFISMO" EN PROTEINAS MULTIFUNCIONALES.

LA HIPOTESIS SECUENCIA, ESTRUCTURA, FUNCION (SFF, DEL INGLES) ESTABLECE QUE, PARA QUE LAS PROTEINAS ADOPTEN UNA FUNCION DETERMINADA HAN DE ADQUIRIR ESTADO NATIVO DE PLEGAMIENTO O ESTRUCTURA TERCIARIA. POR TANTO, HAY UNA CORRESPO... ver más

01/01/2021

CSIC

151K€

Presupuesto del proyecto: 151K€

Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2021-01-01 No tenemos la información de la convocatoria

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Líder del proyecto

AGENCIA ESTATAL CONSEJO SUPERIOR DE INVESTIGA... No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

TRL 2-3 | 552M€

Presupuesto del proyecto 151K€

Descripción del proyecto LA HIPOTESIS SECUENCIA, ESTRUCTURA, FUNCION (SFF, DEL INGLES) ESTABLECE QUE, PARA QUE LAS PROTEINAS ADOPTEN UNA FUNCION DETERMINADA HAN DE ADQUIRIR ESTADO NATIVO DE PLEGAMIENTO O ESTRUCTURA TERCIARIA. POR TANTO, HAY UNA CORRESPONDENCIA LINEAL E INEQUIVOCA ENTRE LA SECUENCIA DE AMINO ACIDO, LA ESTRUCTURA, Y LA FUNCION. SIENDO ESTA RELACION EL NUCLEO DEL DESARROLLO DE LA BIOINFORMATICA, TODOS LOS METODOS COMPUTACIONALES DESARROLLADOS PARA LA PREDICCION DE FUNCION SE BASAN EN ESTA PREMISA.SIN EMBARGO, DESDE HACE DECADAS SE HA OBSERVADO QUE CIERTAS PROTEINAS SON CAPACES DE DESEMPEÑAR MAS DE UNA FUNCION, RADICALMENTE DISTINTA, SIN NECESIDAD DE RECURRIR A LA INVENCION DE NUEVAS FORMAS NI DE MUTACIONES. DICHAS PROTEINAS PUEDEN EXHIBIR UNA O MAS FUNCIONES, NORMALMENTE EN PROCESOS CELULARES DISTINTOS EN DISTINTAS LOCALIZACIONES, O PUEDEN ADQUIRIR UNA FUNCION ACCESORIA MANTENIENDO LA EXISTENTE AL MISMO TIEMPO. ALGUNAS NO POSEEN ESTRUCTURA ESTABLE (PROTEINAS DESORDENADAS), QUE ADQUIEREN MEDIANTE UNION A OTRAS PROTEINAS O POR MODIFICACIONES SOBRE LAS MISMA (POR EJEMPLO, FOSFORILACIONES, ETC). OTRAS EN CAMBIO, SI POSEEN ESTRUCTURAS ESTABLES, Y SON LAS PROTEINAS METAMORFICAS Y LAS PROTEINAS MOONLIGHTING. ESTOS DOS ULTIMOS GRUPOS ILUSTRAN UN CASO EXTREMO DE VIOLACION DE LA HIPOTESIS SFF, YA QUE EN TERMINOS PRACTICOS NO ES POSIBLE EXPLICAR COMO UNA PROTEINA PUEDE ADOPTAR UNA NUEVA FUNCION, RETENIENDO LA ANCESTRAL. EN EL CASO DE LAS PROTEINAS MULTIFUNCIONALES, LAS MOONLIGHTING PUEDEN EXPLICARSE INVOCANDO MODELOS DE EVOLUCION TRADICIONALES (DUPLICACION, ETC). SIN EMBARGO, LAS PROTEINAS METAMORFICAS NO PUEDEN SER EXPLICADAS POR MODELOS ACEPTADOS DE EVOLUCION. MODELOS ALTERNATIVOS PARA EXPLICAR LA PRESENCIA DE ESTAS PROTEINAS SON EL ESCAPE AL CONFLICTO ADAPTATIVO, QUE PUEDE OCURRIR ANTES O DESPUES DE LA DUPLICACION QUE POSTERIORMENTE PERMITIRA LA DIVERSIFICACION DE PROTEINAS.COMO RESULTADOS DE NUESTRO EJERCICIO PREVIO FINANCIADO, HEMOS OBSERVADO QUE LAS TECNICAS MAS NOVEDOSAS Y PODEROSAS PARA PREDECIR FUNCION, NO PREDICEN FORMAS NI FUNCIONES CONOCIDAS EN ESTOS GRUPOS DE PROTEINAS. POR LO TANTO, PRETENDEMOS ABORDAR EL PROBLEMA DE LA MULTIFUNCIONALIDAD DESDE UNA PERSPECTIVA EVOLUTIVA QUE TRANSCIENDA LA HIPOTESIS ESTABLECIDA (SFF). PARA ELLO EXPLOTAREMOS LA CONFUSION CREADA EN ESTOS METODOS INNOVADORES PARA IDENTIFICAR METAMORFOS, Y EXPLORAREMOS NUESTROS DESCUBRIMIENTOS EN CIENTOS DE SECUENCIAS POBREMENTE CARACTERIZADAS. EL CONOCIMIENTO GENERADO EN ESTE PROYECTO SERA RELEVANTE PARA OTRAS AREAS BIOTECNOLOGICAS Y BIOMEDICAS. VOLUCION PROTEICA\MULTIFUNCIONAL\METAMORFICAS\FUNCION\DEEP LEARNING

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