FRICCION INTERNA EN EL PLEGAMIENTO, LA FUNCION Y AGREGACION DE PROTEINAS
LAS PROTEINAS SON FASCINANTES MAQUINAS MOLECULARES QUE LLEVAN A CABO TODO TIPO DE FUNCIONES EN LOS ORGANISMOS VIVOS, SE SINTETIZAN COMO POLIMEROS LINEALES DE AMINOACIDOS, Y SU PLEGAMIENTO EN ESTRUCTURAS TRIDIMENSIONALES FUNCIONALE...
LAS PROTEINAS SON FASCINANTES MAQUINAS MOLECULARES QUE LLEVAN A CABO TODO TIPO DE FUNCIONES EN LOS ORGANISMOS VIVOS, SE SINTETIZAN COMO POLIMEROS LINEALES DE AMINOACIDOS, Y SU PLEGAMIENTO EN ESTRUCTURAS TRIDIMENSIONALES FUNCIONALES DEPENDE DE LA FORMA DE EMBUDO DE SUS PAISAJES DE ENERGIA,DURANTE LOS ULTIMOS 30 AÑOS, LA COMUNIDAD INTERESADA EN LA BIOFISICA DE PROTEINAS HA INTERROGADO LOS DETALLES MICROSCOPICOS DE LOS PAISAJES ENERGETICOS EN EL PLEGAMIENTO DE PROTEINAS, ESTOS PAISAJES SON SUAVES Y MINIMAMENTE FRUSTRADOS, DEBIDO A LA SELECCION EVOLUTIVA DE LAS SECUENCIAS DE AMINOACIDOS QUE GARANTIZAN UN PLEGAMIENTO RAPIDO Y REPRODUCIBLE, SIN EMBARGO, QUEDA UN CIERTO NIVEL DE RUGOSIDAD, DEBIDO A LAS INTERACCIONES DE LA PROTEINA CONSIGO MISMA QUE NECESITAN PARA FORMAR Y ROMPER INTERACCIONES AL ACERCARSE AL ESTADO PLEGADO DESDE LA FORMA DESPLEGADA, ESTA RUGOSIDAD EN LOS PAISAJES QUE SE HA DENOMINADO "FRICCION INTERNA", UNA GRAN VARIEDAD DE SISTEMAS HAN SIDO ESTUDIADOS PARA SONDEAR EXPERIMENTALMENTE LA FRICCION INTERNA, Y DE HECHO SE HA ENCONTRADO EN VARIADOS SISTEMAS, COMO PROTEINAS DE PLEGAMIENTO RAPIDO, ENZIMAS Y PROTEINAS DESORDENADAS, SIN EMBARGO, HASTA HACE POCO FALTABA UNA DESCRIPCION MOLECULAR DE ESTE EFECTO, NUESTRO RECIENTE TRABAJO COMPUTACIONAL HA ESTABLECIDO POR PRIMERA VEZ EL ORIGEN DE FRICCION INTERNA EN PEQUEÑOS PEPTIDOS, Y POSIBLEMENTE TAMBIEN EN LAS PROTEINAS,LAS PROTEINAS TAMBIEN PUEDEN PLEGARSE INADECUADAMENTE, LO QUE A MENUDO RESULTA EN TERRIBLES ENFERMEDADES COMO EL ALZHEIMER O EL PARKINSON, PARA EL MAL PLEGAMIENTO, SIN EMBARGO, ES EVIDENTE QUE NO HAY PRESION EVOLUTIVA, POR LO TANTO, LA TEORIA DE LOS PAISAJES DE ENERGIA SUGERIRIA QUE LOS PAISAJES DE MAL PLEGAMIENTO SON POR EL CONTRARIO ASPEROS EN COMPARACION CON LOS PAISAJES DE PLEGAMIENTO, RECIENTES EXPERIMENTOS DE UNA SOLA MOLECULA EN LA PROTEINA PRP HAN CONFIRMADO ESTA PREDICCION, DEMOSTRANDO QUE LA DIFUSION EN EL PANORAMA ENERGETICO PARA MAL PLEGAMIENTO ES TAN LENTA COMO 3 ORDENES DE MAGNITUD MAS LENTO QUE PARA EL PLEGAMIENTO,ESTA ENORME DIFERENCIA OFRECE UNA OPORTUNIDAD PARA EL TRATAMIENTO DE LA ENFERMEDAD, PODREMOS INTENTAR PREVENIR LAS ENFERMEDADES DE MAL PLEGAMIENTO SI PODEMOS AUMENTAR SIQUIERA MARGINALMENTE LA FRICCION INTERNA DE LA PROTEINA, EN ESTA PROPUESTA SE INTENTA DESARROLLAR UNA ESTRATEGIA TERAPEUTICA BASADA EN ESTE PRINCIPIO,PARA ELLO VAMOS A ESTUDIAR PRIMERO UN GRAN SUBCONJUNTO DE LOS SISTEMAS EN QUE SE ENCUENTRA FRICCION INTERNA EN LOS TRABAJOS EXPERIMENTALES, ESTO NOS DARA UNA IDEA DE LOS MECANISMOS QUE PRODUCEN LA FRICCION INTERNA EN ESTOS DIVERSOS SISTEMAS, DESPUES, VAMOS A ESTUDIAR LA RUGOSIDAD MICROSCOPICA EN LOS PAISAJES DE MAL PLEGAMIENTO, AL HACER USO DE LOS CONOCIMIENTOS OBTENIDOS DE LA PRIMERA PARTE DEL PROYECTO, SEREMOS CAPACES DE INTRODUCIR MUTACIONES QUE AUMENTEN LA FRICCION INTERNA DE LA PROTEINA, POR ULTIMO, VAMOS A TRATAR DE RECUPERAR LOS MISMOS EFECTOS UTILIZANDO UNA LIBRERIA DE COMPUESTOS QUIMICOS, CON LO QUE ESTABLECEREMOS LAS BASES PARA UN NUEVO ENFOQUE TERAPEUTICO PARA LA CURA DE LAS ENFERMEDADES DE MAL PLEGAMIENTO, PLEGAMIENTO DE PROTEÍNAS\SIMULACIÓN\AGREGACIÓN\DISEÑO DE FÁRMACOS\CINÉTICA MOLECULARver más
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