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AGL2013-48742-C2-1-R

Financiado

FISIOLOGIA GENOMICA DEL DEPOSITO DE GRASA INTRAMUSCULAR EN PORCINO

LA GRASA INTRAMUSCULAR (GIM) Y SU COMPOSICION TIENEN UNA PROFUNDA INFLUENCIA SOBRE LA JUGOSIDAD, LA TERNEZA Y, EN DEFINITIVA, LA CALIDAD Y LA ACEPTABILIDAD DE LA CARNE POR PARTE DEL CONSUMIDOR, ASIMISMO, ES UN PARAMETRO FUNDAMENTA... ver más

01/01/2013

CENTRE RECERCA EN...

139K€

Presupuesto del proyecto: 139K€

Líder del proyecto

CENTRE RECERCA EN AGRIGENOMICA CSIC IRTA UAB... Otra investigación y desarrollo experimental en ciencias naturales y técnicas organismos publicos

TRL 4-5 | 50K€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2013-01-01

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Participantes

CENTRE RECERCA EN AGRIGENOMI...

Lider

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Líder del proyecto

CENTRE RECERCA EN AGRIGENOMICA CSIC IRTA UAB...

TRL 4-5 | 50K€

Presupuesto del proyecto 139K€

Descripción del proyecto LA GRASA INTRAMUSCULAR (GIM) Y SU COMPOSICION TIENEN UNA PROFUNDA INFLUENCIA SOBRE LA JUGOSIDAD, LA TERNEZA Y, EN DEFINITIVA, LA CALIDAD Y LA ACEPTABILIDAD DE LA CARNE POR PARTE DEL CONSUMIDOR, ASIMISMO, ES UN PARAMETRO FUNDAMENTAL EN LA ELABORACION DE PRODUCTOS CURADOS COMO POR EJEMPLO EL JAMON, LOS ANALISIS DE ASOCIACION A NIVEL GENOMICO DE LIPIDOS PLASMATICOS HAN REVELADO, PRINCIPALMENTE EN HUMANO Y EN MENOR MEDIDA EN PORCINO, LA EXISTENCIA DE GENES ASOCIADOS A ESTOS CARACTERES CUYA RELACION CON EL METABOLISMO LIPIDICO ERA HASTA LA FECHA DESCONOCIDA, DE ELLO CABE INFERIR QUE LA FISIOLOGIA GENOMICA DE LA ABSORCION, TRANSPORTE, ALMACENAMIENTO Y CATABOLISMO DE LIPIDOS (ES DECIR, LOS GENES QUE INTERVIENEN EN DICHOS PROCESOS Y COMO INTERACTUAN ENTRE SI) SE CONOCE DE MANERA BASTANTE LIMITADA EN AMBAS ESPECIES, EN EL PRESENTE PROYECTO, SE PRETENDE IDENTIFICAR LOS GENES PORCINOS QUE REGULAN LA ABSORCION, TRANSPORTE, ALMACENAMIENTO Y CATABOLISMO DE LIPIDOS A NIVEL MUSCULAR CON EL FIN DE MEJORAR LA CALIDAD DE LA CARNE PORCINA,EN PRIMER LUGAR, SE REALIZARA UN EXPERIMENTO (EXPERIMENTO 1) CONSISTENTE EN ANALIZAR LA EXPRESION GENICA MUSCULAR PRE-INGESTA (T0) Y POST-INGESTA (2 PUNTOS TEMPORALES T1 Y T2) EN 50 CERDOS DUROC (EDAD = 120 DIAS), EL OBJETIVO DE ESTA APROXIMACION CONSISTIRA EN ESTUDIAR LOS CAMBIOS EN LOS PATRONES MUSCULARES DE EXPRESION GENICA COMO RESPUESTA AGUDA A LA INGESTA DE NUTRIENTES Y ESPECIALMENTE DE LIPIDOS, MAS CONCRETAMENTE, SE ANALIZARA EL TRANCRIPTOMA (GENES CODIFICANTES DE PROTEINAS Y MICRORNAS) DEL MUSCULO GUTEUS MEDIUS MEDIANTE RNASEQ, LA COMPARACION ENTRE GRUPOS DE ESTOS DATOS PERMITIRA DETERMINAR QUE GENES CODIFICANTES DE PROTEINAS O MICRORNAS ACTIVAN SU EXPRESION EN RESPUESTA A LA ABSORCION DE LIPIDOS, ESTA INFORMACION CONTRIBUIRA A ENTENDER MEJOR LA FISIOLOGIA GENOMICA DEL PORCENTAJE Y LA COMPOSICION DE LA GRASA INTRAMUSCULAR, ASIMISMO, LA INFORMACION FENOTIPICA Y GENOMICA OBTENIDA EN EL MARCO DE TRES PROYECTOS PREVIAMENTE CONCEDIDOS SERA UTILIZADA PARA LA VALIDACION DE LOS RESULTADOS GENERADOS EN EL EXPERIMENTO ANTERIOR, SE DISPONE DE REGISTROS PARA LA CANTIDAD Y LA COMPOSICION DE LA GIM DE 350 CERDOS DUROC (POBLACION LIPGEN) ASI COMO SUS GENOTIPOS PARA 60,000 SNPS, POR OTRA PARTE, LA SECUENCIACION DEL GENOMA DE LOS CINCO MACHOS FUNDADORES LIPGEN HA PERMITIDO IDENTIFICAR MAS DE 10 MILLONES DE SNP (CON RESPECTO AL GENOMA DE REFERENCIA), A PARTIR DE DICHA INFORMACION, SE CONSTRUIRA UN PANEL REDUCIDO DE SNPS, LOCALIZADOS EN LOS GENES IDENTIFICADOS EN EL EXPERIMENTO 1, Y SE DETERMINARA SU ASOCIACION CON EL CONTENIDO DE GIM Y EL PERFIL DE ACIDOS GRASOS EN LA POBLACION LIPGEN, ASI COMO EL PORCENTAJE DE VARIACION FENOTIPICA EXPLICADO POR DICHO PANEL (EXPERIMENTO 2), ELLO RESULTARA DE INTERES PARA COMPRENDER EL ORIGEN DE PARTE DE LA "HEREDABILIDAD AUSENTE ("MISSING HERITABILITY") PARA GIM Y SU COMPOSICION, DETECTADA EN LA POBLACION LIPGEN MEDIANTE ANALISIS DE ASOCIACION GENOMICO CON EL CHIP 60K, AQUELLAS MUTACIONES QUE TENGAN UN EFECTO CAUSAL MUY PROBABLE SERAN VALIDADAS FUNCIONALMENTE Y PODRIAN EMPLEARSE COMO FUENTE DE INFORMACION EN ESQUEMAS DE SELECCION PARA MEJORAR LA CALIDAD DE LA CARNE DE CERDO, CERDO\ EXPRESIÓN GÉNICA MUSCULAR\ MICRORNA\ METABOLISMO LIPÍDICO\ GRASA INTRAMUSCULAR\ ÁCIDOS GRASOS\ MUTACIÓN CAUSAL

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