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AGL2017-82641-R

Financiado

GENOMICA FUNCIONAL, BIOLOGIA DE SISTEMAS Y MICROBIOMICA APLICADAS A LA IDENTIFIC...

GENOMICA FUNCIONAL, BIOLOGIA DE SISTEMAS Y MICROBIOMICA APLICADAS A LA IDENTIFICACION DE REGULADORES GENETICOS DEL CRECIMIENTO, ENGRASAMIENTO Y CALIDAD DE LA CARNE EN PORCINO LA CALIDAD DE LA CARNE, INCLUYENDO CARACTERES SENSORIALES, NUTRICIONALES Y DE SALUD HUMANA, RECIBE UN CRECIENTE INTERES, EL CONOCIMIENTO DE LOS GENES QUE DETERMINAN ESTOS CARACTERES ES ESENCIAL PARA MEJORAR LA CALIDAD DE LOS PRODU... ver más

01/01/2017

CENTRE RECERCA EN...

169K€

Presupuesto del proyecto: 169K€

Líder del proyecto

CENTRE RECERCA EN AGRIGENOMICA CSIC IRTA UAB... Otra investigación y desarrollo experimental en ciencias naturales y técnicas organismos publicos

TRL 4-5 | 50K€

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Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2017-01-01

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Participantes

CENTRE RECERCA EN AGRIGENOMI...

Lider

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Líder del proyecto

CENTRE RECERCA EN AGRIGENOMICA CSIC IRTA UAB...

TRL 4-5 | 50K€

Presupuesto del proyecto 169K€

Descripción del proyecto LA CALIDAD DE LA CARNE, INCLUYENDO CARACTERES SENSORIALES, NUTRICIONALES Y DE SALUD HUMANA, RECIBE UN CRECIENTE INTERES, EL CONOCIMIENTO DE LOS GENES QUE DETERMINAN ESTOS CARACTERES ES ESENCIAL PARA MEJORAR LA CALIDAD DE LOS PRODUCTOS DERIVADOS DEL CERDO SIN AFECTAR AL RENDIMIENTO PRODUCTIVO, LAS HERRAMIENTAS GENOMICAS HAN PERMITIDO IDENTIFICAR QUANTITATIVE TRAIT LOCI (QTLS) DE CARACTERES RELEVANTES, PERO SOLO EN UNOS POCOS QTLS PORCINOS SE CONOCEN LAS VARIANTES GENETICAS CAUSALES, SERAN NECESARIOS MAS ESTUDIOS CON ANIMALES DE DIFERENTES FONDOS GENETICOS Y POBLACIONES COMERCIALES, NUEVOS METODOS GENOMICOS PERMITEN GENERAR DIFERENTES CAPAS DE INFORMACION ENTRE FENOTIPO Y GENOTIPO, QUE PUEDEN SER INTEGRADAS CON METODOS DE REDES Y DE BIOLOGIA DE SISTEMAS, EL MICROBIOMA DEL INTESTINO PUEDE SER CONSIDERADO COMO UN ORGANO IMPORTANTE EN LA SALUD Y EN LA DIGESTION DE LOS ALIMENTOS, INCLUYENDO LA EXTRACCION DE NUTRIENTES Y LA HOMEOSTASIS ENERGETICA, EN ESTUDIOS PREVIOS DE NUESTRO GRUPO SE HAN IDENTIFICADO QTLS Y REGIONES GENOMICAS ASOCIADAS AL CRECIMIENTO, ENGRASAMIENTO Y COMPOSICION DE ACIDOS GRASOS, SE HAN ESTUDIADO GENES CANDIDATOS POSICIONALES DE DIFERENTES QTLS Y ANALIZADO EL TRANSCRIPTOMA PORCINO DE HIGADO, TEJIDO ADIPOSO, MUSCULO E HIPOTALAMO POR RNA-SEQ EN UN NUMERO REDUCIDO DE ANIMALES CON FENOTIPOS EXTREMOS, SE HA ESTUDIADO EL MICROBIOMA PORCINO A LO LARGO DEL APARATO DIGESTIVO Y SE HA ASOCIADO CON EL CRECIMIENTO Y LA COMPOSICION DE ACIDOS GRASOS, EL PRINCIPAL OBJETIVO DEL PRESENTE PROYECTO ES LA IDENTIFICACION Y VALIDACION DE QTLS Y POLIMORFISMOS DE GENES CANDIDATOS DE CRECIMIENTO, ENGRASAMIENTO Y CALIDAD DE CARNE, INTEGRANDO INFORMACION DEL ANALISIS DEL TRANSCRIPTOMA DE MUSCULO, GENOTIPOS Y REGISTROS FENOTIPICOS, ADEMAS, SE ANALIZARA LA CONTRIBUCION DEL MICROBIOMA, EL PLAN DE TRABAJO ESTA ORGANIZADO EN: WP,1) ANALISIS DEL TRANSCRIPTOMA DE MUSCULO PORCINO Y ASOCIACION CON QTLS Y EQTLS, SE UTILIZARA RNA-SEQ PARA ESTUDIAR EL TRANSCRIPTOMA DEL MUSCULO (LONGISSIMUS DORSI) DE 150 CERDOS (IBERICO X DUROC) E IDENTIFICAR REGIONES GENOMICAS REGULADORAS DE LA EXPRESION GENICA, GENES, REDES GENICAS Y REGULADORES CLAVE DE LOS CARACTERES ANALIZADOS, WP,2) PAPEL DEL MICROBIOMA INTESTINAL EN EL CRECIMIENTO Y EL METABOLISMO LIPIDICO, SE ESTUDIARA EN CERDOS IBERICO X DUROC LA ASOCIACION ENTRE LA COMPOSICION EN HECES DE ACIDOS GRASOS DE CADENA CORTA, EL PERFIL DEL MICROBIOMA, EL CRECIMIENTO Y LA COMPOSICION DE ACIDOS GRASOS Y EL GENOMA PORCINO, SE ESTUDIARA EL METATRANSCRIPTOMA DE MUESTRAS FECALES DIVERGENTES PARA LA COMPOSICION DEL MICROBIOMA Y SU EFECTO SOBRE LA HOMEOSTASIS ENERGETICA Y EL METABOLISMO LIPIDICO, WP,3) VALIDACION GENETICA Y FUNCIONAL DE GENES CANDIDATOS Y REGULADORES CLAVE DE QTLS, LA VALIDACION GENETICA DE POLIMORFISMOS EN GENES CANDIDATOS PREVIAMENTE IDENTIFICADOS SE REALIZARA MEDIANTE EL GENOTIPADO DE 128 SNPS EN 960 ANIMALES CON DIFERENTES FONDOS GENETICOS, SEGUIDO DE ESTUDIOS DE ASOCIACION, SE EVALUARAN FUNCIONALMENTE PUTATIVOS POLIMORFISMOS CAUSALES DE QTLS Y EQTLS MEDIANTE ESTUDIOS IN SILICO, EXPRESION GENICA POR QPCR DE 480 ANIMALES Y EXPERIMENTOS ESPECIFICOS DE BIOLOGIA MOLECULAR, ESTOS ESTUDIOS PROPORCIONARAN INFORMACION BIOLOGICA SOBRE LAS BASES GENETICAS DEL CRECIMIENTO, ENGRASAMIENTO Y CALIDAD DE LA CARNE EN CERDOS, PERO TAMBIEN SOBRE ENFERMEDADES HUMANAS RELACIONADAS CON LA OBESIDAD, ADEMAS, SE ESPERA OBTENER MARCADORES ESPECIFICOS, TANTO DEL GENOMA PORCINO COMO DEL MICROBIOMA, DE INTERES PARA LA MEJORA PORCINA, EQTL\METAGENOMA\METATRANSCRIPTOMA\RNA-SEQ\MEJORA GENÉTICA\ÁCIDOS GRASOS\EXPRESIÓN GÉNICA\REDES GÉNICAS\CERDO

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