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AGL2011-29821-C02-02

Financiado

APLICACION DE METODOS DE SECUENCIACION PARALELA MASIVA Y GENOMICA AL ESTUDIO DE...

APLICACION DE METODOS DE SECUENCIACION PARALELA MASIVA Y GENOMICA AL ESTUDIO DE VARIANTES GENICAS QUE REGULAN:CRECIMIENTO,CONFORMACION Y CALIDAD DE CARNE EN CERDO.SUBPROYECTO2 EL CONOCIMIENTO DE LAS BASES GENETICAS QUE CONTROLAN EL CRECIMIENTO, LA DEPOSICION GRASA, LA CONFORMACION Y LA CALIDAD DE LA CARNE EN EL CERDO AYUDARAN EN EL DISEÑO DE ESTRATEGIAS DE SELECCION QUE PERMITAN INCREMENTAR EL RENDIMIEN... ver más

01/01/2011

INST NAL DE INVEST...

157K€

Presupuesto del proyecto: 157K€

Líder del proyecto

INST NAL DE INVESTIGACION Y TECNOLOGIA AGRARI... Otra investigación y desarrollo experimental en ciencias naturales y técnicas organismos publicos

TRL 4-5 | 50K€

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2011-01-01

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Participantes

INST NAL DE INVESTIGACION Y...

Lider

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TRL 4-5 | 50K€

Presupuesto del proyecto 157K€

Descripción del proyecto EL CONOCIMIENTO DE LAS BASES GENETICAS QUE CONTROLAN EL CRECIMIENTO, LA DEPOSICION GRASA, LA CONFORMACION Y LA CALIDAD DE LA CARNE EN EL CERDO AYUDARAN EN EL DISEÑO DE ESTRATEGIAS DE SELECCION QUE PERMITAN INCREMENTAR EL RENDIMIENTO Y LA CALIDAD DE SUS PRODUCTOS. ESTUDIOS EN GENETICA ANIMAL HAN INVESTIGADO LA BASE GENETICA DE ESTOS CARACTERES, IDENTIFICANDO UN GRAN NUMERO DE QUANTITATIVE TRAIT LOCI (QTL), SIN EMBARGO, SON MUY POCAS LAS MUTACIONES CAUSALES IDENTIFICADAS. NUEVAS ESTRATEGIAS EN GENETICA MOLECULAR DESARROLLADAS EN LOS ULTIMOS AÑOS PUEDEN AYUDAR A LA IDENTIFICACION DE GENES Y MUTACIONES CAUSALES, LA NUEVA GENERACION DE TECNOLOGIAS DE SECUENCIACION NEXT-GENERATION SEQUENCING (NGS), ENTRE ELLAS. LAS TECNOLOGIAS DE NGS PERMITEN DE FORMA MAS EFECTIVA CONOCER LA VARIABILIDAD A NIVEL DE ADN Y ARN EXISTENTE EN EL MATERIAL DE ESTUDIO, PERMITIENDO HACER MAS EXITOSA LA IDENTIFICACION DE MUTACIONES CAUSALES. EL PRINCIPAL OBJETIVO DE LA PROPUESTA ES LA IDENTIFICACION DE LAS MUTACIONES CAUSALES RESPONSABLES DE CARACTERES COMPLEJOS DE INTERES ECONOMICO EN CERDO. PARA CONSEGUIR ESTE OBJETIVO SE PLANTEA UNA PROPUESTA DE UN PROYECTO COORDINADO ENTRE LA UNIVERSIDAD AUTONOMA DE BARCELONA (SUBPROYECTO1) Y EL INSTITUTO NACIONAL DE INVESTIGACION Y TECNOLOGIA AGRARIA Y ALIMENTARIA (SUBPROYECTO2).EL ESTUDIO SE LLEVARA A CABO UTILIZANDO EL MATERIAL IBMAP, GENERADO EN PREVIOS PROYECTOS. EN ESTE MATERIAL SE HAN IDENTIFICADO PREVIAMENTE QTL PARA CRECIMIENTO, DEPOSICION GRASA, CONFORMACION Y COMPOSICION DE ACIDOS GRASOS EN LOS CROMOSOMAS SSC1, SSC4, SSC6, SSC8, SSC10, SSC12, SSC14 Y SSCX.LOS OBJETIVOS CONCRETOS QUE PLANTEA SE CONSEGUIR EN EL SUBPROYECTO2 (INIA) SON:1. DESCUBRIR NUEVAS VARIANTES ESTRUCTURALES EN LA REGION DEL QTL DEL CROMOSOMA SSC6, POTENCIALMENTE MUTACIONES CAUSALES DE EFECTOS RELEVANTES SOBRE EL APETITO Y DEPOSICION GRASA. 2. IDENTIFICAR MUTACIONES PROXIMAS AL SNP C.1987C>T DEL GEN LEPR Y QUE JUNTO CON ESTA PODRIA TENER EFECTOS SOBRE CRECIMIENTO Y DEPOSICION GRASA.3. IDENTIFICAR DIFERENCIAS DE EXPRESION, VARIANTES TRANSCRIPCIONALES Y SNPS EN GENES IMPLICADOS EN LA REGULACION HIPOTALAMICA DEL CRECIMIENTO, CONFORMACION Y DEPOSICION GRASA EN CERDO.4. IDENTIFICAR TRANSCRITOS CANDIDATOS A SER RESPONSABLES DE LOS QTL PREVIAMENTE IDENTIFICADOS EN LOS CROMOSOMAS SC10, SSC12, SSC14.5. ESTUDIAR, A TRAVES DE ANALISIS DE ASOCIACION, SNPS CANDIDATOS A SER RESPONSABLES DE LOS QTL PREVIAMENTE IDENTIFICADOS EN SSC10, SSC12, SSC14.6. VALIDAR LOS EFECTOS DE POTENCIALES MUTACIONES CAUSALES A SER RESPONSABLES DE LOS QTL PREVIAMENTE IDENTIFICADOS EN LOS CROMOSOMAS SSC10, SSC12, SSC14 EN DIFERENTES FONDOS GENETICOS. 7. BUSCAR EVIDENCIAS CONCLUYENTES DE LOS EFECTOS DE LAS MUTACIONES CAUSALES PARA EL SNP C.1987C>T DEL GEN LEPR, POLIMORFISMOS DEL GEN DE LA ACACA Y DE OTROS GENES CANDIDATO PARA LOS QTL ANTERIORMENTE MENCIONADOS EN LOS CROMOSOMAS SSC6, SSC10, SSC12 AND SSC14. SE PLANTEAN CUATRO GRUPOS DE TAREAS. TAREA1: CAPTURA Y RE-SECUENCIACION DE LA REGION DEL QTL DEL CROMOSOMA SSC6, INCLUYE EL GEN RECEPTOR DE LEPTINA. TAREA2: RNA-SEQUENCING EN HIPOTALAMO, PARA IDENTIFICAR LAS VARIANTES GENICAS POTENCIALMENTE RELACIONADAS CON CRECIMIENTO Y DEPOSICION GRASA. TAREA3: SELECCION DE SNPS PARA LLEVAR A CABO ANALISIS DE ASOCIACION CON EL OBJETIVO DE IDENTIFICAR LAS MUTACIONES RESPONSABLES DE LOS QTL MENCIONADOS. TAREA 4: VALIDACION DE RESULTADOS Y ESTUDIOS FUNCIONALES QUE PERMITAN PONER EVIDENCIAR EL EFECTO CAUSAL DE LAS MUTACIONES. ORCINO\CONFORMACION\CRECIMIENTO\CALIDAD DE LA CARNE\GENOMICA\SECUENCIACION MASIVA\MEJORA GENETICA

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