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BIO2012-34723

Financiado

EXPRESION DIFERENCIAL DE AGRUPACIONES PARA LA BIOSINTESIS DE METABOLITOS SECUNDA...

EXPRESION DIFERENCIAL DE AGRUPACIONES PARA LA BIOSINTESIS DE METABOLITOS SECUNDARIOS: GENOME MINING DE STREPTOMYCES CLAVULIGERUS EL OBJETIVO CENTRAL DEL PROYECTO ES EL ANALISIS FUNCIONAL, EN EL GENOMA DE STREPTOMYCES CLAVULIGERUS, DE AGRUPACIONES GENICAS DE FUNCION DESCONOCIDA CON NIVELES DE EXPRESION MUY BAJOS O NULOS. SEGUN ANALISIS BIOINFORMATICOS EL GEN... ver más

01/01/2012

ULE

105K€

Presupuesto del proyecto: 105K€

Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE LEON No se ha especificado una descripción o un objeto social para esta compañía.

Total investigadores 589

Financiación concedida El organismo AGENCIA ESTATAL DE INVESTIGACIÓN notifico la concesión del proyecto el día 2012-01-01

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Participantes

ULE

Lider

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Líder del proyecto

UNIVERSIDAD DE LEON

Total investigadores 589

Presupuesto del proyecto 105K€

Descripción del proyecto EL OBJETIVO CENTRAL DEL PROYECTO ES EL ANALISIS FUNCIONAL, EN EL GENOMA DE STREPTOMYCES CLAVULIGERUS, DE AGRUPACIONES GENICAS DE FUNCION DESCONOCIDA CON NIVELES DE EXPRESION MUY BAJOS O NULOS. SEGUN ANALISIS BIOINFORMATICOS EL GENOMA DE S. CLAVULIGERUS CONTIENE INFORMACION GENETICA PARA 48 POSIBLES METABOLITOS SECUNDARIOS. LA MITAD DE LOS MISMOS (25) ESTAN CODIFICADOS EN EL MEGAPLASMIDO PSCL4 DE 1.8 MB. ESTE PROYECTO ESTA DEDICADO A CUATRO GRANDES OBJETIVOS: 1) SE OBTENDRAN CEPAS CURADAS DEL MEGAPLASMIDO PSCL4 POR TECNICAS DE BIOLOGIA MOLECULAR. POR COMPARACION CON LA CEPA SILVESTRE SE ANALIZARA, MEDIANTE TECNICAS DE HPLC-MASAS, UHPLC Y RNM, EL EFECTO DE LA PERDIDA DE PSCL4 EN LA PRODUCCION DE METABOLITOS UTILIZANDO MEDIOS DE CULTIVO DEFINIDOS Y COMPLEJOS. UNA VEZ DETERMINADA LA ESTRUCTURA DE LOS METABOLITOS QUE NO SE PRODUCEN EN LA CEPA CURADA, SE CORRELACIONARA SU ESTRUCTURA CON LAS AGRUPACIONES GENICAS DEL PLASMIDO MAS AFINES A SU POSIBLE VIA BIOSINTETICA. LA FUNCIONALIDAD DE LAS AGRUPACIONES SELECCIONADAS POR SU INTERES BIOTECNOLOGICO (POR EJ. ANTIBIOTICOS, ANTIFUNGICOS O INMUNOMODULADORES), SE CONFIRMARA POR INTERRUPCION DE UNO O VARIOS DE SUS GENES EN LA CEPA SILVESTRE UTILIZANDO UNA GENOTECA EN COSMIDOS DE S. CLAVULIGERUS Y LA TECNICA REDIRECTR. UNA VEZ SE CONFIRME LA RELACION AGRUPACION GENICA-METABOLITO SE PROCEDERA A OPTIMIZAR LA PRODUCCION DE LOS METABOLITOSDE MAYOR INTERES MEDIANTE TECNICAS CLASICAS DE FERMENTACION Y POR MANIPULACION GENETICA DE LA CEPA UTILIZANDO TECNICAS DE DNA RECOMBINANTE. 2) EN EL MEGAPLASMIDO PSCL4 PUEDEN EXISTIR GENES REGULADORES DE DOMINIO AMPLIO QUE CONTROLAN LA FORMACION DE METABOLITOS DE ORIGEN CROMOSOMAL (COMO HA DEMOSTRADO NUESTRO GRUPO EN RELACION A LA HOLOMICINA). SE DETERMINARA SI LA AUSENCIA DE PSCL4 CONDUCE A AUMENTOS DE EXPRESION O A EXPRESION DE NOVO DE AGRUPACIONES GENICAS LOCALIZADAS EN EL CROMOSOMA. 3) EN ESTE SENTIDO SE ESTUDIARAN Y CARACTERIZARAN LAS AGRUPACIONES CROMOSOMALES PARA NARINGENINA, NOCARDAMINA Y AQUELLAS QUE SE ACTIVEN POR LA AUSENCIA DE PSCL4. 4) FINALMENTE, SE DETERMINARA SI LA INTEGRACION DE LOS GENES REGULADORES POSITIVOS HETEROLOGOS PIMM Y FKBM (REGULADORES POSITIVOS DE LA PIMARICINA Y TACROLIMUS, RESPECTIVAMENTE) ACTIVAN EN S. CLAVULIGERUS AGRUPACIONES GENICAS PARA POLIQUETIDOS CUYA EXPRESION ES BAJA O NULA.

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