Descripción del proyecto
EL OBJETIVO CENTRAL DEL PROYECTO ES EL ANALISIS FUNCIONAL DE AGRUPACIONES GENICAS EN EL GENOMA, AHORA DISPONIBLE, DE STREPTOMYCES CLAVULIGERUS, UNA GENOTECA DE DNA DE S, CLAVULIGERUS SERA RASTREADA PARA LOCALIZAR LOS COSMIDOS QUE CONTENGAN COMPLETAS LAS AGRUPACIONES GENICAS PARA: 1) ACIDO CLAVULANICO, 2) CEFAMICINA C, 3) CLAVAMAS, 4) AGRUPACION PARALOGA DE ACIDO CLAVULANICO, Y 5) GENES PARA PRECURSORES BIOSINTETICOS, COMO LA AGRUPACION DE BIOSINTESIS DE ARGININA O DE UTILIZACION DE GLICEROL, SE LOCALIZARA EN EL GENOMA LA AGRUPACION GENICA DEL COMPUESTO ANTITUMORAL HOLOMICINA (HOL), HASTA AHORA DESCONOCIDO, MEDIANTE: A) OBTENCION DE MUTANTES NO PRODUCTORES POR MUTAGENESIS CON TRANSPOSONES, B) PURIFICACION DE LA HOLOMICINA SINTASA Y ANALISIS POR ESPECTROMETRIA DE MASAS DE SUS PEPTIDOS, O C) CARACTERIZACION DE GENES DEL GENOMA QUE PODRIAN ESTAR IMPLICADOS EN LA PRODUCCION DE HOLOMICINA, POSTERIORMENTE SE LOCALIZARA EL COSMIDO QUE CONTENGA LA AGRUPACION HOL, LAS AGRUPACIONES GENICAS EN COSMIDOS SE INTRODUCIRAN EN MUTANTES ¿SUPERHOST¿ DE STREPTOMYCES COELICOLOR, ESPECIALMENTE DISEÑADOS EN EL PROYECTO EUROPEO ACTINOGEN PARA ESTE FIN, ANALIZANDOSE LA EXPRESION HETEROLOGA DE LAS AGRUPACIONES GENICAS Y LA PRODUCCION DE LOS DISTINTOS METABOLITOS SECUNDARIOS, ESTO PERMITIRA CONOCER SI EXISTEN FACTORES ESPECIFICOS AJENOS A LA AGRUPACION, NECESARIOS PARA SU EXPRESION Y SI LAS AGRUPACIONES ESTAN COMPLETAS, ESTUDIOS BIOINFORMATICOS DEL GENOMA DE S, CLAVULIGERUS PERMITIRAN DETERMINAR LA PRESENCIA DE NUEVAS AGRUPACIONES GENICAS PARA METABOLITOS SECUNDARIOS, SE DETERMINARA LA NATURALEZA DE MOLECULAS DE BAJO PESO MOLECULAR IMPLICADAS EN LA REGULACION DE LA EXPRESION DE LOS PROMOTORES CONTROLADOS POR LAS PROTEINAS REGULADORAS CCAR Y AREB, ESTUDIANDOSE LA TRANSCRIPTOMICA DE LA CEPA SILVESTRE EN RELACION A DISTINTOS MUTANTES DESREGULADOS O BLOQUEADOS EN LA PRODUCCION DE LOS METABOLITOS CODIFICADOS POR LAS AGRUPACIONES, ESTOS RESULTADOS DE TRANSCRIPTOMICA SE VALIDARAN MEDIANTE ESTUDIOS DE PROTEOMICA Y PCR CUANTITATIVO, METABOLITOS SECUNDARIOS\ACIDO CLAVULANICO\TRANSCRIPTOMICA\S. CLAVULIGERUS\AGRUPACIONES GENICAS\HOLOMICINA.