Descripción del proyecto
AUNQUE EL NUMERO DE FARMACOS EXISTENTES EN EL MERCADO ES ELEVADO, SE NECESITAN MAS PARA TRATAR Y MEJORAR EL TRATAMIENTO DE DISTINTAS PATOLOGIAS, LOS COMPUESTOS NATURALES SON UNA FUENTE MUY IMPORTANTE DE ESTOS FARMACOS, POR SU GRAN DIVERSIDAD ESTRUCTURAL Y SUS PROPIEDADES QUIMICAS, LAS BACTERIAS PERTENECIENTES AL GENERO STREPTOMYCES, SON LOS MAYORES PRODUCTORES DE COMPUESTOS BIOACTIVOS, ADEMAS, LA SECUENCIACION DE GENOMAS DE STREPTOMYCES HA PUESTO DE MANIFIESTO QUE ESTAS BACTERIAS POSEEN MAYOR CAPACIDAD BIOSINTETICA QUE LA PREVISTA INICIALMENTE, EN LOS ULTIMOS AÑOS, SE ESTA UTILIZANDO LA MINERIA GENOMICA (GENOME MINING) COMO ESTRATEGIA PARA ESCUDRIÑAR/ANALIZAR GENOMAS CON EL FIN DE IDENTIFICAR AGRUPACIONES DE BIOSINTESIS DE COMPUESTOS BIOACTIVOS PREVIAMENTE DESCONOCIDAS (CLUSTERS CRIPTICOS) QUE SE EXPRESAN O ESTAN SILENCIOSOS, UNO DE LOS RETOS ACTUALES ES IDENTIFICAR CLUSTERS QUE CODIFIQUEN COMPUESTOS CON ESTRUCTURAS NOVEDOSAS, DISTINTAS A LAS YA CONOCIDAS, EN ESTE PROYECTO SE PLANTEA INCREMENTAR LA PROBABILIDAD DE DESCUBRIR COMPUESTOS CON ESTRUCTURAS QUIMICAS NOVEDOSAS, Y POR LO TANTO CON ACTIVIDADES BIOLOGICAS POTENCIALMENTE IMPORTANTES, MEDIANTE LA BUSQUEDA DE GENES DE BIOSINTESIS PARA UNIDADES ESTRUCTURALES ESPECIFICAS (BUILDING BLOCKS) DE HIDROXIBENZOATOS Y AMINOBENZOATOS, EL OBJETIVO GENERAL DEL PRESENTE PROYECTO ES LA IDENTIFICACION Y CARACTERIZACION DE CLUSTERS DE BIOSINTESIS EN STREPTOMYCES QUE CODIFIQUEN COMPUESTOS CON ESTRUCTURAS NUEVAS Y BIOACTIVOS, DERIVADOS DE HIDROXIBENZOATOS Y AMINOBENZOATOS, LA REALIZACION DE ESTE PROYECTO IMPLICARA: (I) IDENTIFICAR CLUSTERS DE BIOSINTESIS DE COMPUESTOS BIOACTIVOS DERIVADOS DE HIDROXIBENZOATOS Y AMINOBENZOATOS, PARA LO CUAL SE IDENTIFICARAN GENES DE BIOSINTESIS DE HIDROXIBENZOATOS Y AMINOBENZOATOS EN GENOMAS DE STREPTOMYCES, QUE SE INACTIVARAN PARA IDENTIFICAR LOS COMPUESTOS CODIFICADOS, LOS CUALES SE PURIFICARAN Y CARACTERIZARAN QUIMICAMENTE Y BIOLOGICAMENTE; (II) CARACTERIZAR LOS CLUSTERS DE BIOSINTESIS SELECCIONADOS, LO QUE IMPLICARA DETERMINAR SUS LIMITES, INACTIVAR SUS GENES DE BIOSINTESIS E IDENTIFICAR LOS COMPUESTOS ACUMULADOS POR LOS MUTANTES PARA ASIGNARLES FUNCIONES Y PROPONER RUTAS DE BIOSINTESIS; Y (III) GENERAR NUEVOS COMPUESTOS POR BIOSINTESIS COMBINATORIA, A TRAVES DE LA CONSTRUCCION DE PLASMIDOS DE CASSETTES PARA LA BIOSINTESIS DE HIDROXIBENZOATOS Y AMINOBENZOATOS Y SU EXPRESION EN CEPAS DE STREPTOMYCES Y POR MUTASINTESIS, STREPTOMYCES\ANTIBIÓTICO\ANTITUMORAL\BIOACTIVO\MINERÍA GENÓMICA\AHBA\CORISMATO\HIDROXIBENZOATO\AMINOBENZOATO